42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0686 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0686  hypothetical protein  100 
 
 
409 aa  837    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1445  LOR/SDH bifunctional protein  60.78 
 
 
409 aa  527  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2149  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  60.55 
 
 
440 aa  508  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.951911  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0938  hypothetical protein  58.82 
 
 
409 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.182607  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1408  LOR/SDH bifunctional protein  60.29 
 
 
411 aa  505  9.999999999999999e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000543179  normal  0.449844 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1454  LOR/SDH bifunctional protein  53.63 
 
 
415 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0845  LOR/SDH bifunctional protein  51.96 
 
 
417 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0533  LOR/SDH bifunctional protein  53.88 
 
 
415 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.990735  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0372  LOR/SDH bifunctional protein  53.13 
 
 
415 aa  442  1e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.216176  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0465  LOR/SDH bifunctional protein  53.63 
 
 
415 aa  442  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0299  LOR/SDH bifunctional protein  52.5 
 
 
410 aa  426  1e-118  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1342  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  47.79 
 
 
408 aa  420  1e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0795325  normal  0.948696 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0863  LOR/SDH bifunctional protein  47.78 
 
 
407 aa  409  1e-113  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00957303 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1684  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  47.91 
 
 
429 aa  404  1e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0305327  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0636  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  48.94 
 
 
450 aa  395  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1005  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  49.03 
 
 
419 aa  393  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.538878  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2692  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  48.28 
 
 
410 aa  380  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3107  LOR/SDH bifunctional protein  46.13 
 
 
435 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3854  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  44.25 
 
 
704 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4864  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  45.83 
 
 
412 aa  350  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0701737 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3232  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  42.62 
 
 
705 aa  345  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2163  hypothetical protein  44.25 
 
 
405 aa  344  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106153  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2742  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  42.65 
 
 
705 aa  342  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3360  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  42.65 
 
 
705 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0297131  normal  0.880976 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4047  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  42.26 
 
 
703 aa  340  2.9999999999999998e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2273  hypothetical protein  41.28 
 
 
703 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4659  hypothetical protein  42.26 
 
 
703 aa  339  5e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0175942 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1826  LOR/SDH bifunctional protein  42.3 
 
 
411 aa  317  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.263588  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3091  LOR/SDH bifunctional enzyme region  38.88 
 
 
414 aa  293  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1451  hypothetical protein  35.34 
 
 
372 aa  189  8e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.553711  normal  0.492787 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1885  hypothetical protein  36.05 
 
 
369 aa  188  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2488  hypothetical protein  37.07 
 
 
363 aa  188  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.492113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2325  hypothetical protein  35.17 
 
 
369 aa  188  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05900  hypothetical protein  34.88 
 
 
363 aa  182  8.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.598804 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4880  hypothetical protein  33.93 
 
 
362 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0554  hypothetical protein  35.58 
 
 
380 aa  176  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2787  hypothetical protein  35.19 
 
 
364 aa  176  9e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0121  hypothetical protein  33.15 
 
 
420 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2463  hypothetical protein  43.9 
 
 
431 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0048  hypothetical protein  34.23 
 
 
365 aa  161  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0026  hypothetical protein  31.18 
 
 
367 aa  142  8e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0025  hypothetical protein  32.5 
 
 
392 aa  132  9e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>