255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0575 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  100 
 
 
256 aa  518  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  49.6 
 
 
254 aa  238  5.999999999999999e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  47.64 
 
 
255 aa  229  3e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  40.08 
 
 
257 aa  169  5e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  34.46 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  34.9 
 
 
266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  34.83 
 
 
272 aa  145  6e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  34.08 
 
 
272 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  39 
 
 
424 aa  142  5e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  33.09 
 
 
289 aa  140  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0370  formylmethanofuran dehydrogenase  35.43 
 
 
266 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  34.81 
 
 
268 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  36.78 
 
 
415 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  36.26 
 
 
415 aa  136  4e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1990  formylmethanofuran dehydrogenase  35.55 
 
 
266 aa  135  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114316  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  35.21 
 
 
415 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.33 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0201  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  35.11 
 
 
307 aa  133  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0127762  normal  0.0655916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0875  formylmethanofuran dehydrogenase  32.42 
 
 
266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.118005  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  31.69 
 
 
332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  33.9 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  34.17 
 
 
425 aa  125  9e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1473  formylmethanofuran dehydrogenase  30.28 
 
 
275 aa  118  7e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143119  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0283  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  34.21 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.363907  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  31.84 
 
 
301 aa  113  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.74 
 
 
274 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  29.07 
 
 
281 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  29.68 
 
 
270 aa  86.3  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.51 
 
 
286 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.46 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0523  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.84 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300278  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5997  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.95 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  26.2 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0022  formylmethanofuran dehydrogenase  27.41 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  27.37 
 
 
269 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2626  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  28.9 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3133  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.66 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5773  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.02 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1824  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.11 
 
 
265 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.69 
 
 
276 aa  75.5  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2159  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.46 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0901303 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1421  glutamate synthase alpha subunit domain protein  27.75 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1793  glutamate synthase alpha subunit  32.54 
 
 
267 aa  62.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607708  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1198  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C (tungsten)  38.71 
 
 
152 aa  60.1  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.83 
 
 
572 aa  59.7  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  32.77 
 
 
568 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  32.77 
 
 
568 aa  58.2  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1487  glutamate synthase, large subunit  34.96 
 
 
1465 aa  57  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0194294  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  27.22 
 
 
240 aa  56.6  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0890  glutamate synthase (ferredoxin)  33.33 
 
 
1536 aa  55.8  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00390315  decreased coverage  0.000127994 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2165  glutamate synthase subunit alpha  31.69 
 
 
1487 aa  55.8  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.409887  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  32.28 
 
 
312 aa  55.8  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  27.68 
 
 
228 aa  55.8  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1874  glutamate synthase subunit alpha  31.69 
 
 
1487 aa  55.5  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0403  glutamate synthase subunit alpha  35.85 
 
 
1507 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0405842 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1083  glutamate synthase alpha subunit  32 
 
 
320 aa  54.7  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.386486  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.95 
 
 
228 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  35.34 
 
 
553 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  34.71 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  29.75 
 
 
242 aa  53.5  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1607  tungsten containing formylmethanofruran dehydrogenase subunit C-related protein  31.25 
 
 
313 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.4 
 
 
281 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  26.36 
 
 
228 aa  52.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  29.17 
 
 
248 aa  52.4  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0550  glutamate synthase subunit alpha  36.54 
 
 
1482 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.213876 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.06 
 
 
1474 aa  52.8  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  27.13 
 
 
228 aa  52.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.9 
 
 
646 aa  52.4  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5076  glutamate synthase subunit alpha  34.62 
 
 
1481 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4949  glutamate synthase subunit alpha  34.62 
 
 
1481 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.772604  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01631  glutamate synthase subunit alpha  29.33 
 
 
1460 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.17 
 
 
249 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0834  glutamate synthase subunit alpha  33.96 
 
 
1482 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87862  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  33.33 
 
 
1487 aa  51.2  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  32.31 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20710  glutamate synthase (NADH) large subunit  32.54 
 
 
1524 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.42786 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0390  glutamate synthase subunit alpha  33.96 
 
 
1481 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  25.19 
 
 
228 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51965  predicted protein  28.06 
 
 
1562 aa  50.4  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.738666  normal  0.0653658 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.09 
 
 
1530 aa  50.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4805  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.45 
 
 
247 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1345  glutamate synthase, alpha subunit-like  37.11 
 
 
227 aa  49.7  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0265  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.33 
 
 
1487 aa  49.7  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.316824 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5126  glutamate synthase subunit alpha  33.65 
 
 
1481 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.979784  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1260  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.52 
 
 
1511 aa  49.3  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179185  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45210  glutamate synthase subunit alpha  33.96 
 
 
1480 aa  48.9  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1078  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.56 
 
 
1529 aa  48.9  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19531  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.56 
 
 
1475 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16351  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.33 
 
 
1531 aa  48.9  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0413  glutamate synthase subunit alpha  33.65 
 
 
1481 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.359883 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4809  glutamate synthase alpha subunit  27.52 
 
 
229 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453145  hitchhiker  0.00411559 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  37.04 
 
 
264 aa  48.9  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.62 
 
 
659 aa  48.5  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  34.51 
 
 
246 aa  48.9  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0857  glutamate synthase subunit alpha  35.29 
 
 
1483 aa  48.5  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.245541 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2016  glutamate synthase (NADPH)  33.33 
 
 
1535 aa  48.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  29.91 
 
 
312 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3748  glutamate synthase subunit alpha  33.08 
 
 
1488 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956068  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1954  glutamate synthase subunit alpha  31.75 
 
 
1487 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0526  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.65 
 
 
1548 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.801021  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>