More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0496 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0496  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  676    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1750  methanogenesis marker protein 2  58.28 
 
 
330 aa  414  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0832  AIR synthase-like protein  58.13 
 
 
336 aa  395  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.786385  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0917  AIR synthase related protein  57.1 
 
 
333 aa  392  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1073  AIR synthase related protein  58.1 
 
 
338 aa  391  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0762  AIR synthase-like protein  52 
 
 
321 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.353751  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0496  AIR synthase related protein  44.58 
 
 
324 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1267  AIR synthase related protein  41.67 
 
 
331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0131  thiamin-monophosphate kinase  41.1 
 
 
326 aa  281  9e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0844  AIR synthase related protein  43.12 
 
 
323 aa  269  4e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223576  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0779  AIR synthase related protein  43.12 
 
 
323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.278492  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0044  AIR synthase related protein  42.19 
 
 
327 aa  266  4e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1139  methanogenesis marker protein 2  42.19 
 
 
327 aa  264  1e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2622  AIR synthase related protein domain protein  39.04 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0248  AIR synthase related protein  37.46 
 
 
331 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.484423  normal  0.676888 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0059  AIR synthase related protein  37.42 
 
 
331 aa  192  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.148611  normal  0.181031 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4564  AIR synthase-like protein  35.46 
 
 
328 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299231  normal  0.430179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1411  putative thiamine-monophosphate kinase  35.87 
 
 
327 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5396  AIR synthase related protein  34.69 
 
 
331 aa  186  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2101  AIR synthase related protein  34.41 
 
 
341 aa  182  7e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0558  AIR synthase related protein  35.31 
 
 
332 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2712  AIR synthase related protein domain protein  35.91 
 
 
327 aa  179  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1995  AIR synthase related protein  34.17 
 
 
323 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3475  hypothetical protein  32.93 
 
 
342 aa  172  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.451422  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4748  AIR synthase related protein  39.35 
 
 
334 aa  172  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0560199  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7579  selenophosphate synthetase-related protein  33.01 
 
 
328 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1111  hypothetical protein  35.38 
 
 
325 aa  162  5.0000000000000005e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13161  hypothetical protein  33.57 
 
 
326 aa  152  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0836  hypothetical protein  29.2 
 
 
338 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.261675 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2059  GCN5-related N-acetyltransferase  35.24 
 
 
479 aa  136  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4689  AIR synthase related protein  34.21 
 
 
481 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6662  GCN5-related N-acetyltransferase  34.5 
 
 
486 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0223324  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1220  GCN5-related N-acetyltransferase  32.77 
 
 
471 aa  123  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  30.9 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  27.67 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1027  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.24 
 
 
741 aa  70.1  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.352422 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1820  AIR synthase-like protein  21.78 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.79718  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1097  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.19 
 
 
599 aa  68.9  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000033132  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  27.69 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1681  AIR synthase related protein domain protein  25 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  28.27 
 
 
328 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1721  thiamine-monophosphate kinase  25.09 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488772  normal  0.0257709 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1597  thiamine-phosphate kinase  28.43 
 
 
319 aa  64.3  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  28.17 
 
 
334 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1450  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.67 
 
 
733 aa  64.3  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244925  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21270  AIR synthase related protein domain protein  29.1 
 
 
348 aa  63.5  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.0242e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  20.81 
 
 
779 aa  62.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1525  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.4 
 
 
601 aa  62.8  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  24.8 
 
 
323 aa  62.8  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1959  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25 
 
 
727 aa  62  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0119456  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2665  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.84 
 
 
727 aa  62  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.367188  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0708  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.1 
 
 
740 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4090  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.26 
 
 
749 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919609  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0768  selenide, water dikinase  24.14 
 
 
344 aa  61.6  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306081  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  26.56 
 
 
331 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  27.89 
 
 
316 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  25.51 
 
 
324 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  24.66 
 
 
727 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  25.34 
 
 
327 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1574  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.26 
 
 
601 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  25.4 
 
 
333 aa  61.6  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0863  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.45 
 
 
737 aa  61.2  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.472862  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  21.74 
 
 
332 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0547  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.5 
 
 
737 aa  60.8  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  25.16 
 
 
325 aa  61.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0521  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  22.11 
 
 
733 aa  60.8  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3455  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  22.58 
 
 
737 aa  60.8  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821031  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1244  thiamine-monophosphate kinase  32.89 
 
 
313 aa  60.5  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  23.36 
 
 
346 aa  60.5  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3394  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  21.69 
 
 
802 aa  60.5  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  21.84 
 
 
779 aa  59.3  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  33.79 
 
 
340 aa  59.3  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  21.07 
 
 
777 aa  59.3  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1205  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  22.26 
 
 
770 aa  59.3  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.737255  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0804  thiamine-monophosphate kinase  24.8 
 
 
319 aa  58.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.914964  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.84 
 
 
736 aa  58.9  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3840  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  22.71 
 
 
761 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.619159  normal  0.165254 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1820  thiamine-monophosphate kinase  27.48 
 
 
323 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  28.15 
 
 
337 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3970  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  22.7 
 
 
724 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  21.84 
 
 
779 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  26.29 
 
 
350 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  27.85 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1089  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.09 
 
 
761 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.550447  normal  0.288584 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  21.31 
 
 
779 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.494756  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0634  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.41 
 
 
716 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.191388  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1057  AIR synthase related protein domain protein  27.12 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  25.9 
 
 
318 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1019  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.18 
 
 
761 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1539  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  21.48 
 
 
717 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0210  thiamine-phosphate kinase  25.49 
 
 
323 aa  57.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.631674 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  21.33 
 
 
335 aa  57.4  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1060  AIR synthase related protein  23.29 
 
 
439 aa  57  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.130176  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2581  thiamine-monophosphate kinase  30.69 
 
 
319 aa  57.4  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2274  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.76 
 
 
754 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00429114  normal  0.210249 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0582  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  22.93 
 
 
340 aa  57  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0640  AIR synthase related protein domain protein  26.56 
 
 
371 aa  57  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221872  normal  0.692624 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  29.11 
 
 
346 aa  56.6  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2397  selenide, water dikinase  24.45 
 
 
353 aa  57  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1419  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  23.1 
 
 
349 aa  57  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>