33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0489 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0489  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  540  1e-152  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0839  hypothetical protein  47.33 
 
 
270 aa  254  1e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.286364  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1944  protein of unknown function DUF147  40.89 
 
 
265 aa  214  2e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0381023  normal  0.0659541 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1389  hypothetical protein  44.09 
 
 
293 aa  174  9e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0634969  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1579  hypothetical protein  40.4 
 
 
291 aa  169  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1317  protein of unknown function DUF147  49.3 
 
 
649 aa  146  4e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.521946  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1210  putative PAS/PAC sensor protein  42.86 
 
 
540 aa  139  4e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0526078  normal  0.0174457 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1780  hypothetical protein  43.54 
 
 
443 aa  132  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1616  putative PAS/PAC sensor protein  47.52 
 
 
559 aa  130  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.477909  normal  0.117342 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1053  hypothetical protein  42.86 
 
 
197 aa  128  1e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.593896  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0310  hypothetical protein  44.44 
 
 
288 aa  123  4e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0723  hypothetical protein  31.64 
 
 
310 aa  122  8e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0286471 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0099  hypothetical protein  31.25 
 
 
310 aa  121  1e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.892669  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1195  hypothetical protein  31.25 
 
 
310 aa  120  2e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0788  hypothetical protein  36.69 
 
 
310 aa  120  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3381  hypothetical protein  46.22 
 
 
195 aa  119  5e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1190  protein of unknown function DUF147  40.82 
 
 
456 aa  116  4e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2555  hypothetical protein  40.4 
 
 
277 aa  115  7e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338009  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1293  protein of unknown function DUF147  39.07 
 
 
294 aa  114  2e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.964954  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1394  protein of unknown function DUF147  39.07 
 
 
294 aa  114  2e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0782856  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4591  hypothetical protein  39.16 
 
 
446 aa  111  1e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.89176  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0075  protein of unknown function DUF147  37.24 
 
 
265 aa  106  4e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.104264  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1308  hypothetical protein  37.09 
 
 
294 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.832333  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0504  protein of unknown function DUF147  37.67 
 
 
270 aa  102  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2466  protein of unknown function DUF147  36.99 
 
 
270 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0301  protein of unknown function DUF147  35.62 
 
 
268 aa  98.6  9e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0317825  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2246  protein of unknown function DUF147  34.93 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.217243 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1442  protein of unknown function DUF147  35.62 
 
 
269 aa  96.7  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0837  protein of unknown function DUF147  34.67 
 
 
275 aa  43.1  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2732  hypothetical protein  40.3 
 
 
275 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.76859  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1807  hypothetical protein  38.57 
 
 
261 aa  43.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.895114  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0999  hypothetical protein  37.31 
 
 
261 aa  42.7  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000188135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1888  hypothetical protein  38.81 
 
 
255 aa  42.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.52181e-06  hitchhiker  1.69292e-09 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>