26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0458 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0458  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  436  9.999999999999999e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1524  transcription factor TFIIE, alpha subunit  45.45 
 
 		 173 aa  186  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2009  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  44.17 
 
 		 173 aa  177  7e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.735877  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2797  transcription factor TFIIE, alpha subunit  43.35 
 
 		 173 aa  176  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0975699 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1279  transcription factor TFIIE, alpha subunit  43.96 
 
 		 173 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.11333 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1650  transcription factor TFIIE, alpha subunit  35.35 
 
 		 167 aa  123  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0285  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  33 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137025  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0913  transcription initiation factor E subunit alpha  37.01 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2330  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  37.82 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.373955 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1033  transcription initiation factor E subunit alpha  37.01 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0325255 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0196  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  32.16 
 
 		 164 aa  102  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1644  transcription initiation factor E subunit alpha  37.01 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.275573  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3157  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  38.66 
 
 		 178 aa  101  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.484396  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2279  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  39.32 
 
 		 176 aa  98.2  8e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.933385 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0965  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  37.5 
 
 		 172 aa  95.9  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0372  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  27.92 
 
 		 165 aa  94.7  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000142035  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1033  transcription initiation factor E subunit alpha  33.59 
 
 		 185 aa  94  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1708  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  36.67 
 
 		 174 aa  94.4  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1244  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  30.88 
 
 		 178 aa  89.4  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1607  transcription factor TFIIE subunit alpha  37.84 
 
 		 171 aa  86.3  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1150  transcription initiation factor E subunit alpha  30.37 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0710  transcription factor TFIIE, alpha subunit  28.91 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0032  transcription factor TFIIE, alpha subunit  23.68 
 
 		 170 aa  47.8  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00767088 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1074  transcription factor TFIIE, alpha subunit  23.58 
 
 		 170 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0035  transcription factor TFIIE, alpha subunit  25.58 
 
 		 170 aa  46.2  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2147  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  22.42 
 
 		 170 aa  43.1  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>