278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0389 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0389  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  675    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.211147  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  41.08 
 
 
421 aa  205  8e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  36.77 
 
 
390 aa  176  7e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  37.64 
 
 
502 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4102  beta-lactamase domain protein  38.83 
 
 
386 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  36.61 
 
 
284 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  36.33 
 
 
352 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  36.78 
 
 
461 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  35.31 
 
 
348 aa  166  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  35.69 
 
 
283 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2771  beta-lactamase domain-containing protein  33.45 
 
 
367 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  31.33 
 
 
294 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  35.63 
 
 
461 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  35.25 
 
 
461 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  31.21 
 
 
292 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  35.4 
 
 
451 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  34.87 
 
 
461 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  33.58 
 
 
443 aa  159  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  34.87 
 
 
461 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  31.05 
 
 
291 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3555  beta-lactamase domain-containing protein  32.21 
 
 
300 aa  159  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000166822  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1235  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 
295 aa  157  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000521991  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0044  beta-lactamase-like protein  36.51 
 
 
291 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  34.66 
 
 
454 aa  156  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2727  beta-lactamase domain protein  35.26 
 
 
374 aa  155  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1849  metallo-beta-lactamase family protein  33.84 
 
 
286 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000969274  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2772  beta-lactamase-like  35.36 
 
 
257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.619488  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1903  beta-lactamase domain-containing protein  33.1 
 
 
451 aa  152  8e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.140876  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3578  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
281 aa  149  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  33.1 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  33.09 
 
 
406 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.33 
 
 
818 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  33.73 
 
 
479 aa  147  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.81 
 
 
775 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1867  beta-lactamase domain protein  35.27 
 
 
477 aa  143  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0121854 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.57 
 
 
780 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2351  beta-lactamase domain-containing protein  36.72 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.43 
 
 
808 aa  139  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.87 
 
 
773 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1232  beta-lactamase domain protein  33.6 
 
 
453 aa  136  5e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000615653  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.48 
 
 
773 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.92 
 
 
814 aa  135  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.35 
 
 
796 aa  132  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.46 
 
 
654 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.46 
 
 
773 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  31.37 
 
 
795 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.83 
 
 
773 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.89 
 
 
798 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  33.08 
 
 
773 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.46 
 
 
772 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.94 
 
 
789 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.46 
 
 
772 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.58 
 
 
840 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.6 
 
 
794 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0140  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.58 
 
 
868 aa  126  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038467 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2283  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)-like protein  30.66 
 
 
342 aa  126  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1073  metallo-beta-lactamase family protein  31.48 
 
 
300 aa  125  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.698038  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1716  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.73 
 
 
846 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.116279  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4123  metallo-beta-lactamase family protein  32.25 
 
 
300 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15793  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.8 
 
 
773 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4165  metallo-beta-lactamase family protein  31.11 
 
 
300 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141054  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.6 
 
 
795 aa  124  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.79 
 
 
811 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4187  metallo-beta-lactamase family protein  31.88 
 
 
300 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247862  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1314  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 
363 aa  123  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2755  beta-lactamase domain-containing protein  32.03 
 
 
300 aa  122  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3797  metallo-beta-lactamase  31.48 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3885  beta-lactamase domain-containing protein  33.98 
 
 
300 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.39 
 
 
750 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.72 
 
 
770 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3812  metallo-beta-lactamase  31.48 
 
 
300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0782  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.67 
 
 
745 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3966  metallo-beta-lactamase family protein  31.48 
 
 
300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4275  metallo-beta-lactamase family protein  31.48 
 
 
300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.05 
 
 
802 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4076  metallo-beta-lactamase family protein  31.48 
 
 
300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104735 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1164  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.91 
 
 
777 aa  119  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5470  ComEC/Rec2-related protein  30.98 
 
 
819 aa  119  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.6 
 
 
778 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1942  beta-lactamase-like  31.42 
 
 
423 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.42 
 
 
773 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1520  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  29.79 
 
 
746 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.6 
 
 
837 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  30.82 
 
 
872 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.39 
 
 
749 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.3 
 
 
759 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3847  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31 
 
 
806 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.39 
 
 
835 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1600  hydrolase of metallo-beta-lactamase fold  29.07 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.949503  unclonable  2.1744e-23 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0715  hypothetical protein  43.75 
 
 
274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5417  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.66 
 
 
830 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560238  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.43 
 
 
797 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.01 
 
 
786 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2092  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  27.46 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.214294  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30 
 
 
757 aa  109  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.24 
 
 
761 aa  109  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3434  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.52 
 
 
800 aa  108  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242762  normal  0.0166392 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.07 
 
 
771 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.88 
 
 
752 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2499  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.79 
 
 
783 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>