33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0361 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0361  DNA primase  100 
 
 
434 aa  868    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0846  DNA primase  54.36 
 
 
415 aa  443  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0699  DNA primase  51.95 
 
 
417 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000129929  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1017  DNA primase  52.89 
 
 
408 aa  422  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1103  DNA primase  48.55 
 
 
440 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0722  DNA primase  44.92 
 
 
438 aa  354  2e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000789623  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2135  DNA primase  62.55 
 
 
505 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.218194  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3256  TOPRIM domain protein  42.55 
 
 
477 aa  337  2.9999999999999997e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1769  DNA primase  39.92 
 
 
475 aa  325  1e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0959  DNA primase  57.14 
 
 
517 aa  323  5e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0596  DNA primase  42.25 
 
 
443 aa  320  3e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.792701  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0741  DNA primase  57.52 
 
 
464 aa  317  2e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.119048  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1388  DNA primase  42.66 
 
 
438 aa  316  6e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1229  TOPRIM domain protein  59.54 
 
 
491 aa  315  9.999999999999999e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189055  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1395  TOPRIM domain protein  58.8 
 
 
407 aa  311  1e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.145165  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1544  DNA primase  59.54 
 
 
461 aa  308  9e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.513524  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0307  DNA primase  58.78 
 
 
438 aa  306  3e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0531  DNA primase  58.4 
 
 
439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.956269  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0194  DNA primase  59.16 
 
 
537 aa  296  3e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.112469  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1321  DNA primase  37.76 
 
 
403 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0960  DNA primase  37.3 
 
 
405 aa  282  7.000000000000001e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.916463 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1050  DNA primase  38 
 
 
407 aa  273  6e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00972841 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0169  DNA primase  36.75 
 
 
452 aa  271  1e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0207779  normal  0.165101 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1059  TOPRIM domain protein  38.76 
 
 
402 aa  271  2e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0877165  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1886  DNA primase  36.6 
 
 
405 aa  265  8.999999999999999e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0501  DNA primase  37.96 
 
 
426 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2153  DNA primase  35.47 
 
 
413 aa  252  9.000000000000001e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000561406  hitchhiker  0.000473756 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1302  DNA primase  36.68 
 
 
380 aa  191  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000182826 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  33.71 
 
 
653 aa  47.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  37.93 
 
 
660 aa  47  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0175  DNA primase  38.89 
 
 
600 aa  45.4  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  36.59 
 
 
640 aa  44.3  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  31.29 
 
 
656 aa  44.3  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>