More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0266 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  811    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  67.87 
 
 
404 aa  559  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  64.01 
 
 
399 aa  536  1e-151  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  65.36 
 
 
396 aa  525  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  63.71 
 
 
398 aa  518  1e-146  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  63.4 
 
 
394 aa  521  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  61.44 
 
 
398 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  60.31 
 
 
396 aa  504  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  61.56 
 
 
394 aa  494  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  57.72 
 
 
398 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  57.72 
 
 
398 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  61.05 
 
 
384 aa  489  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  60.26 
 
 
384 aa  486  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  59.37 
 
 
392 aa  486  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  59.69 
 
 
398 aa  478  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  60.84 
 
 
390 aa  476  1e-133  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  59.32 
 
 
392 aa  470  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  59.74 
 
 
393 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  58.38 
 
 
400 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  55.04 
 
 
398 aa  443  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  57.59 
 
 
394 aa  443  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  56.17 
 
 
402 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  56.05 
 
 
382 aa  434  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  55.76 
 
 
414 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  55.47 
 
 
403 aa  431  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  54.22 
 
 
409 aa  428  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  58.18 
 
 
392 aa  431  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  54.86 
 
 
382 aa  427  1e-118  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  54.45 
 
 
396 aa  419  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  52.79 
 
 
395 aa  418  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  51.32 
 
 
388 aa  419  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  52.47 
 
 
389 aa  409  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  51.05 
 
 
383 aa  397  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  49.49 
 
 
406 aa  395  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  50 
 
 
383 aa  392  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  51.3 
 
 
388 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  49.09 
 
 
400 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  50 
 
 
407 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  50.27 
 
 
379 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1297  aminotransferase class V  47.93 
 
 
403 aa  380  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.216598  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  50.52 
 
 
384 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  49.61 
 
 
393 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  47.46 
 
 
402 aa  377  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  49.74 
 
 
404 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  51.17 
 
 
386 aa  377  1e-103  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  50 
 
 
405 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  50.39 
 
 
396 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  48.58 
 
 
401 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  48.58 
 
 
401 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  48.44 
 
 
386 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  49.22 
 
 
400 aa  372  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  50 
 
 
407 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  50.52 
 
 
398 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  49.74 
 
 
407 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  49.21 
 
 
389 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  50 
 
 
407 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  50 
 
 
407 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  50 
 
 
407 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  50 
 
 
407 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  49.74 
 
 
407 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  49.21 
 
 
402 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  49.21 
 
 
407 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  47.07 
 
 
394 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  49.22 
 
 
401 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  49.48 
 
 
407 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  48.95 
 
 
389 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  48.71 
 
 
388 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  48.95 
 
 
389 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  48.95 
 
 
407 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  47.22 
 
 
403 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  49.74 
 
 
407 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  49.74 
 
 
407 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  49.21 
 
 
407 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  49.21 
 
 
407 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  49.48 
 
 
407 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  49.21 
 
 
407 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  49.48 
 
 
407 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  46.84 
 
 
436 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  46.84 
 
 
436 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  47.66 
 
 
391 aa  363  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  49.21 
 
 
407 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  48.69 
 
 
405 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  46.21 
 
 
403 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  47.64 
 
 
405 aa  361  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  46.84 
 
 
400 aa  361  1e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  50.26 
 
 
394 aa  360  3e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  47.91 
 
 
405 aa  360  3e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  48.71 
 
 
507 aa  359  4e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  48.44 
 
 
408 aa  359  4e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  48.81 
 
 
381 aa  359  5e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  48.05 
 
 
391 aa  358  7e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  48.83 
 
 
405 aa  358  9e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  49.87 
 
 
380 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2177  cysteine desulfurase IscS  47.38 
 
 
430 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  49.08 
 
 
400 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  47.66 
 
 
417 aa  357  2.9999999999999997e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  47.12 
 
 
391 aa  355  5e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  47.91 
 
 
388 aa  355  5.999999999999999e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  48.44 
 
 
422 aa  355  6.999999999999999e-97  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  46.35 
 
 
388 aa  355  6.999999999999999e-97  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>