169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0226 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0226  endonuclease IV  100 
 
 		 281 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  54.61 
 
 		 282 aa  301  7.000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  51.43 
 
 		 281 aa  285  5e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  51.23 
 
 		 286 aa  278  7e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1782  apurinic endonuclease (APN1)  48.57 
 
 		 286 aa  248  6e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  44.6 
 
 		 291 aa  235  7e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  41.84 
 
 		 279 aa  216  4e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  36.65 
 
 		 282 aa  189  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  39.01 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  38.01 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  38.65 
 
 		 293 aa  179  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  39.43 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  39.36 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0356  apurinic endonuclease Apn1  39.36 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248399  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  39.47 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2402  endonuclease IV  36.69 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0690778  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  38.41 
 
 		 283 aa  169  6e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  35 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  36.52 
 
 		 282 aa  166  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  34.05 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  36.2 
 
 		 275 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  36.2 
 
 		 275 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  35 
 
 		 293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  37.92 
 
 		 296 aa  159  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  36.06 
 
 		 283 aa  159  6e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  35.84 
 
 		 275 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  35.96 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1326  endonuclease IV  35.87 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  34.51 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0185  apurinic endonuclease Apn1  36.88 
 
 		 276 aa  155  7e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0835  apurinic endonuclease Apn1  35.93 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.995182  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  34.46 
 
 		 280 aa  155  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1083  apurinic endonuclease Apn1  34.93 
 
 		 283 aa  153  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0228384  normal  0.0872132 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2994  endonuclease IV  36.97 
 
 		 285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.097029  normal  0.446678 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  34.4 
 
 		 326 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1939  endonuclease IV  34.2 
 
 		 286 aa  153  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102323  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0529  endonuclease IV  35.88 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  35.51 
 
 		 287 aa  152  5e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1685  apurinic endonuclease Apn1  36.26 
 
 		 296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1738  apurinic endonuclease Apn1  34.84 
 
 		 279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000624135  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1100  apurinic endonuclease Apn1  35.25 
 
 		 280 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  36.17 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0969  apurinic endonuclease Apn1  35.27 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0245  endonuclease IV  33.33 
 
 		 282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1927  endonuclease IV  33.7 
 
 		 281 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0277  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1274  apurinic endonuclease Apn1  32.97 
 
 		 289 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  36.2 
 
 		 282 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2442  endonuclease IV  32.51 
 
 		 285 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155245  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  32.51 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  33.21 
 
 		 287 aa  146  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  32.62 
 
 		 280 aa  145  5e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3227  endonuclease IV  32.97 
 
 		 279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476079 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  32.51 
 
 		 285 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  33.96 
 
 		 281 aa  145  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2553  endonuclease IV  32.51 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  hitchhiker  0.000695113 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2351  endonuclease IV  32.51 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000082686  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  33.21 
 
 		 287 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  32.72 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00944  endonuclease IV  32.73 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  33.94 
 
 		 284 aa  143  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  32.97 
 
 		 282 aa  142  5e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  32.96 
 
 		 284 aa  142  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2033  apurinic endonuclease Apn1  36.56 
 
 		 282 aa  142  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.576144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2988  apurinic endonuclease Apn1  35.36 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2483  apurinic endonuclease Apn1  34.52 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004452  endonuclease IV  32 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.034826  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1124  endonuclease IV  33.69 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30161  predicted protein  32.58 
 
 		 379 aa  140  3e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2760  endonuclease IV  34.07 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  33.21 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1655  endonuclease IV  31.87 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  32.21 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  34.84 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2552  endonuclease IV  31.12 
 
 		 282 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2421  endonuclease IV  31.6 
 
 		 283 aa  136  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  35.14 
 
 		 282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3012  endonuclease IV  33.46 
 
 		 298 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00931491  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1936  endonuclease IV  31.18 
 
 		 282 aa  135  8e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.904759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  32.09 
 
 		 290 aa  135  8e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4402  endonuclease IV  33.08 
 
 		 298 aa  135  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00437545  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0834  endonuclease IV  33.08 
 
 		 298 aa  135  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  0.000000117515 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4137  endonuclease IV  33.08 
 
 		 298 aa  135  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1499  apurinic endonuclease Apn1  32.71 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3295  endonuclease IV  32.71 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.11698  normal  0.148014 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  32.45 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0486  endonuclease IV  31.91 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4186  endonuclease IV  32.71 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000147247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4508  endonuclease IV  32.71 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000301022  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3605  apurinic endonuclease Apn1  37.31 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4306  endonuclease IV  32.71 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61822e-23 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  31.6 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2295  endonuclease IV  32.23 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2456  endonuclease IV  32.23 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0531  apurinic endonuclease Apn1  33.9 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.888127 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1489  endonuclease IV  32.23 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000729188  normal  0.0153717 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02088  endonuclease IV  32.23 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0380549  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4024  endonuclease IV  32.71 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.98136e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4034  endonuclease IV  32.71 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000210603  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02047  hypothetical protein  32.23 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302541  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0735  apurinic endonuclease Apn1  32.48 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>