262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0165 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0165  nitrogenase iron protein subunit NifH  100 
 
 
268 aa  556  1e-157  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  69.26 
 
 
272 aa  390  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  67.41 
 
 
270 aa  383  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1937  nitrogenase  68.52 
 
 
272 aa  376  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.894359  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  65.19 
 
 
280 aa  365  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1201  nitrogenase iron protein  53.51 
 
 
273 aa  306  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  53.14 
 
 
273 aa  305  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0171  nitrogenase reductase  53.51 
 
 
273 aa  299  3e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217628  normal  0.670038 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0834  nitrogenase reductase  52.57 
 
 
276 aa  298  5e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2821  nitrogenase iron protein  53.76 
 
 
272 aa  291  5e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436411  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  53.33 
 
 
284 aa  290  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1616  NifH/frxC-family protein  51.47 
 
 
276 aa  290  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  53.01 
 
 
275 aa  289  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2008  nitrogenase iron protein  51.48 
 
 
324 aa  288  8e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.221735  normal  0.365396 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1142  nitrogenase iron protein  52.42 
 
 
276 aa  287  1e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.442855  normal  0.809863 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1434  nitrogenase iron protein  51.66 
 
 
283 aa  286  2e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2098  nitrogenase iron protein  48.9 
 
 
292 aa  286  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2120  nitrogenase iron protein  52.03 
 
 
299 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.109902 
 
 
-
 
NC_002936  DET1158  nitrogenase reductase  50.74 
 
 
274 aa  285  4e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0143  nitrogenase iron protein  51.47 
 
 
280 aa  285  4e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.343179  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0274  nitrogenase iron protein  48.9 
 
 
291 aa  285  5.999999999999999e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23577  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1949  nitrogenase reductase  54.83 
 
 
274 aa  285  5.999999999999999e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645764  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01380  Nitrogenase iron protein  49.26 
 
 
290 aa  284  9e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0491  nitrogenase iron protein  49.63 
 
 
293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1202  nitrogenase iron protein subunit NifH  49.63 
 
 
296 aa  284  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451718  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4488  nitrogenase iron protein subunit NifH  51.31 
 
 
287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3467  nitrogenase iron protein  50 
 
 
288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1627  nitrogenase reductase  53.67 
 
 
274 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000481616  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3090  nitrogenase reductase  51.28 
 
 
277 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0561  nitrogenase iron protein  52.04 
 
 
276 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000368653  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1803  nitrogenase reductase  50.36 
 
 
275 aa  281  6.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.736404  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4684  nitrogenase reductase  49.82 
 
 
275 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6881  nitrogenase iron protein  50.94 
 
 
289 aa  281  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2613  nitrogenase reductase  50.92 
 
 
276 aa  280  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2610  nitrogenase reductase  49.82 
 
 
275 aa  281  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.343866  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1019  nitrogenase reductase  51.49 
 
 
274 aa  280  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855562  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3030  nitrogenase iron protein  47.79 
 
 
288 aa  279  3e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0658  nitrogenase reductase  49.26 
 
 
275 aa  279  3e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0493156  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1751  nitrogenase reductase  52.51 
 
 
274 aa  279  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.555016  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1623  nitrogenase reductase  48.71 
 
 
275 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1244  nitrogenase reductase  54.05 
 
 
274 aa  278  5e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000240583  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0229  nitrogenase reductase  51.49 
 
 
293 aa  277  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0685  nitrogenase reductase  54.05 
 
 
274 aa  277  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49000  nitrogenase reductase  49.08 
 
 
275 aa  278  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2907  nitrogenase iron protein  48.52 
 
 
289 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2281  nitrogenase reductase  50.18 
 
 
275 aa  277  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000562599  normal  0.173141 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3916  nitrogenase reductase  50.18 
 
 
295 aa  277  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4247  nitrogenase iron protein subunit NifH  50.19 
 
 
296 aa  277  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.252394  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1528  nitrogenase reductase  53.67 
 
 
274 aa  276  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0098  nitrogenase reductase  49.64 
 
 
275 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.380897  normal  0.0345089 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1354  nitrogenase iron protein  50.19 
 
 
296 aa  276  3e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0795  nitrogenase iron protein  48.7 
 
 
291 aa  275  5e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.835028  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1353  nitrogenase iron protein  48.52 
 
 
292 aa  275  6e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220216  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2597  nitrogenase iron protein  48.15 
 
 
289 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.036256  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0744  nitrogenase reductase  52.9 
 
 
274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0065  nitrogenase reductase  48.91 
 
 
275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0095  Nitrogenase  50.19 
 
 
299 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1395  nitrogenase reductase  47.97 
 
 
275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3855  nitrogenase iron protein  49.44 
 
 
326 aa  273  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430007  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2364  nitrogenase iron protein  50.56 
 
 
298 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4054  nitrogenase iron protein subunit NifH  49.25 
 
 
324 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00458685  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1240  nitrogenase reductase  49.26 
 
 
296 aa  271  6e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.118183 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1522  nitrogenase reductase  49.26 
 
 
296 aa  271  6e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0650  nitrogenase iron protein  49.81 
 
 
288 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4478  nitrogenase reductase  51.35 
 
 
297 aa  270  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0662  nitrogenase iron protein subunit NifH  49.81 
 
 
289 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.24324  normal  0.221237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3771  nitrogenase iron protein  51.15 
 
 
299 aa  270  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0377842  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1430  nitrogenase reductase  49.63 
 
 
293 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1465  nitrogenase reductase  50 
 
 
293 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375574  hitchhiker  0.00132251 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0088  nitrogenase reductase  49.44 
 
 
303 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1049  nitrogenase iron protein  48.16 
 
 
275 aa  270  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2821  nitrogenase iron protein  49.42 
 
 
289 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0143  nitrogenase reductase  49.44 
 
 
293 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3632  nitrogenase reductase  50 
 
 
293 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.664822 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2074  nitrogenase iron protein  49.43 
 
 
289 aa  269  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1415  nitrogenase iron protein subunit NifH  49.24 
 
 
296 aa  268  5.9999999999999995e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2145  nitrogenase iron protein  49.04 
 
 
289 aa  268  7e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02660  vanadium nitrogenase iron protein  50.19 
 
 
290 aa  268  8.999999999999999e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7753  nitrogenase reductase  49.25 
 
 
293 aa  267  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73881  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1813  nitrogenase iron protein  51.29 
 
 
296 aa  267  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7808  nitrogenase reductase  49.25 
 
 
293 aa  267  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220892  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1785  nitrogenase iron protein  51.29 
 
 
296 aa  267  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3534  nitrogenase reductase  50.93 
 
 
299 aa  266  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332377  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1175  nitrogenase iron protein  49.81 
 
 
289 aa  267  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4046  nitrogenase iron protein  49.63 
 
 
275 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.316801  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0473  nitrogenase reductase  49.44 
 
 
290 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686958  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2345  nitrogenase reductase  47.79 
 
 
296 aa  265  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.383855  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1570  nitrogenase reductase  49.45 
 
 
298 aa  265  8e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4930  nitrogenase reductase  49.81 
 
 
295 aa  265  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1178  nitrogenase  47.19 
 
 
264 aa  264  1e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0774  nitrogenase  49.63 
 
 
290 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5925  nitrogenase reductase  49.07 
 
 
295 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5879  nitrogenase reductase  49.07 
 
 
295 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0809019  normal  0.897591 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3203  nitrogenase iron protein  48.66 
 
 
288 aa  262  4e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4463  nitrogenase reductase  50.94 
 
 
300 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5101  nitrogenase reductase  49.81 
 
 
298 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0969  nitrogenase reductase  50.56 
 
 
299 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1073  nitrogenase reductase  50.56 
 
 
299 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1038  nitrogenase iron protein subunit NifH  46.62 
 
 
264 aa  261  1e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1815  Nitrogenase  54.22 
 
 
251 aa  260  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>