More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0140 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  60.26 
 
 
540 aa  678    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.81 
 
 
542 aa  673    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  60.07 
 
 
562 aa  688    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 
542 aa  1110    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.59 
 
 
543 aa  665    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  47.32 
 
 
539 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  47.98 
 
 
539 aa  450  1e-125  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  46.95 
 
 
546 aa  450  1e-125  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  47.05 
 
 
539 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  46.58 
 
 
552 aa  434  1e-120  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0011  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  44.07 
 
 
589 aa  392  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  43.52 
 
 
576 aa  385  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.3 
 
 
638 aa  382  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12591  succinate dehydrogenase  42.15 
 
 
584 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0949259  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.22 
 
 
608 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12651  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  41.75 
 
 
570 aa  365  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.39 
 
 
648 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.39 
 
 
648 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.39 
 
 
648 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.115771 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.63 
 
 
644 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1426  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.83 
 
 
623 aa  360  3e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2530  Succinate dehydrogenase (ubiquinone)  42.15 
 
 
609 aa  359  6e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.75 
 
 
646 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2214  Succinate dehydrogenase  43.2 
 
 
646 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0284  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.83 
 
 
627 aa  356  5.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3565  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.87 
 
 
644 aa  352  8e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.606678  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4026  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.3 
 
 
646 aa  349  6e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.941346  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3548  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.11 
 
 
621 aa  349  9e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.364565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2093  Succinate dehydrogenase  41.7 
 
 
576 aa  347  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1354  succinate dehydrogenase  39.42 
 
 
582 aa  345  1e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.63 
 
 
598 aa  342  8e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.710471 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.32 
 
 
637 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.052342  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  39.66 
 
 
568 aa  338  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4578  Succinate dehydrogenase  40.54 
 
 
575 aa  337  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1116  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  40.43 
 
 
643 aa  335  1e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1797  Succinate dehydrogenase  40.34 
 
 
598 aa  334  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3768  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.79 
 
 
637 aa  334  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0873813 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1440  Succinate dehydrogenase  41.25 
 
 
598 aa  333  4e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  41.33 
 
 
626 aa  328  2.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.21 
 
 
575 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0174  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  41.2 
 
 
542 aa  324  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0476634  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5984  L-aspartate oxidase  39.33 
 
 
574 aa  323  6e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.937659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5518  Succinate dehydrogenase  39.4 
 
 
641 aa  321  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.43 
 
 
575 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.71 
 
 
681 aa  320  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.533277  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3050  succinate dehydrogenase  41.1 
 
 
633 aa  319  9e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145782  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  42.3 
 
 
568 aa  319  1e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  37.68 
 
 
596 aa  318  1e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3926  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  38.72 
 
 
680 aa  316  7e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.75 
 
 
578 aa  315  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.79 
 
 
575 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.79 
 
 
575 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  40.98 
 
 
567 aa  311  2e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.41 
 
 
566 aa  309  6.999999999999999e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8464  Succinate dehydrogenase  40.77 
 
 
630 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2512  succinate dehydrogenase  37.13 
 
 
591 aa  309  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.069415  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2255  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  38.66 
 
 
584 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.794625  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.52 
 
 
566 aa  307  3e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0177  succinate dehydrogenase subunit A  40.41 
 
 
567 aa  307  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2474  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.41 
 
 
575 aa  306  4.0000000000000004e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00000557801  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  40.52 
 
 
567 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2832  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  40.27 
 
 
609 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0155951  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2514  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  37.43 
 
 
585 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136164  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.02 
 
 
598 aa  302  9e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.72 
 
 
567 aa  301  1e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  38 
 
 
533 aa  302  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.85 
 
 
563 aa  301  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26940  succinate dehydrogenase subunit A  39.8 
 
 
572 aa  301  2e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.898505  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  37.33 
 
 
532 aa  301  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2952  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.08 
 
 
600 aa  300  3e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090106  decreased coverage  0.000187391 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0308  succinate dehydrogenase subunit A  40.94 
 
 
567 aa  300  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.353372 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0679  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.42 
 
 
584 aa  300  6e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00348299  normal  0.0897043 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5615  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37.07 
 
 
579 aa  300  6e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.32 
 
 
579 aa  299  8e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2471  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.9 
 
 
587 aa  299  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.926493  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2344  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  40.93 
 
 
567 aa  298  1e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  38.79 
 
 
507 aa  298  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2029  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  36.97 
 
 
596 aa  298  2e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.21  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6464  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.15 
 
 
583 aa  298  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.723061  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1030  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit A  36.91 
 
 
570 aa  297  3e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144954  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0936  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.15 
 
 
612 aa  297  3e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  37.09 
 
 
542 aa  297  4e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  38.28 
 
 
545 aa  295  1e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2863  succinate dehydrogenase subunit A  37.1 
 
 
594 aa  295  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.76 
 
 
592 aa  294  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8670  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  35.39 
 
 
579 aa  294  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  39.45 
 
 
534 aa  293  4e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04830  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.23 
 
 
595 aa  293  5e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  37.67 
 
 
533 aa  293  6e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  37.76 
 
 
606 aa  293  7e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.92 
 
 
592 aa  292  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.92 
 
 
592 aa  292  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2104  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.56 
 
 
574 aa  292  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0119641 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4491  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.92 
 
 
592 aa  292  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238917 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1825  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.92 
 
 
592 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.231317  normal  0.587479 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1437  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.45 
 
 
577 aa  291  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.217137  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1309  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.84 
 
 
583 aa  291  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0985993  normal  0.361254 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3128  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.01 
 
 
610 aa  290  6e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.28 
 
 
605 aa  289  7e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.82 
 
 
591 aa  289  8e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>