42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0128 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0128  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  270  5.000000000000001e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1652  hypothetical protein  41.61 
 
 
135 aa  102  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1793  hypothetical protein  39.42 
 
 
135 aa  99.4  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3180  hypothetical protein  38.69 
 
 
135 aa  88.6  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1019  protein of unknown function DUF101  36.62 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0479  hypothetical protein  29.85 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.541748  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1747  protein of unknown function DUF101  29.93 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0121  hypothetical protein  30.66 
 
 
135 aa  63.2  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000001565  hitchhiker  0.0000415863 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0271  hypothetical protein  31.43 
 
 
165 aa  62.4  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0688  hypothetical protein  28.47 
 
 
150 aa  61.2  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0414002  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1264  protein of unknown function DUF101  26.81 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1729  hypothetical protein  27.27 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1078  protein of unknown function DUF101  27.34 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0655  protein of unknown function DUF101  30.15 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2152  hypothetical protein  24.44 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1251  archease family protein  25.71 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0569  hypothetical protein  29.2 
 
 
147 aa  53.5  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1685  hypothetical protein  29.2 
 
 
147 aa  52  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0257186 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2360  metal dependent phosphohydrolase  25.4 
 
 
542 aa  50.4  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0707  hypothetical protein  27.74 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0987  hypothetical protein  27.01 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2756  protein of unknown function DUF101  24.14 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.905523  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1373  hypothetical protein  26.89 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0988  protein of unknown function DUF101  22.73 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1580  hypothetical protein  23.74 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.986242  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1949  protein of unknown function DUF101  22.79 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000093626  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2208  archease family protein  28.06 
 
 
146 aa  47  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000144175  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4796  protein of unknown function DUF101  27.61 
 
 
140 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0018  hypothetical protein  30.95 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000044858  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2022  protein of unknown function DUF101  23.13 
 
 
148 aa  46.2  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.367905 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1392  hypothetical protein  24.48 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0957  archease family protein  27.14 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.395937  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3272  protein of unknown function DUF101  22.73 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0129  hypothetical protein  25.34 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.011827  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0196  hypothetical protein  20.71 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30479  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1831  hypothetical protein  28.26 
 
 
150 aa  43.5  0.0009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000057693  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_726  hypothetical protein  24.64 
 
 
138 aa  43.5  0.0009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0242  hypothetical protein  27.14 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2126  hypothetical protein  22.02 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40293  predicted protein  30.65 
 
 
159 aa  40.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0822  hypothetical protein  24.64 
 
 
138 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.303013  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1546  hypothetical protein  22.7 
 
 
140 aa  40  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>