199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0112 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  341  2e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  73.49 
 
 		 168 aa  265  2e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  52.41 
 
 		 166 aa  183  8e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  50.6 
 
 		 166 aa  172  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  51.52 
 
 		 167 aa  170  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  50.91 
 
 		 173 aa  166  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  46.3 
 
 		 166 aa  148  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  45.68 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  43.64 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  43.83 
 
 		 166 aa  144  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  43.03 
 
 		 165 aa  143  9e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  45.06 
 
 		 166 aa  143  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  44.16 
 
 		 158 aa  137  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  46.1 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  40.61 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  43.48 
 
 		 165 aa  134  7.000000000000001e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  43.12 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  45.1 
 
 		 164 aa  130  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  40.49 
 
 		 167 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  39.02 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  41.46 
 
 		 166 aa  127  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  44.1 
 
 		 165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  43.83 
 
 		 168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  40.85 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  42.95 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  40.99 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  40.24 
 
 		 166 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  41.82 
 
 		 166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  39.76 
 
 		 166 aa  124  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  38.75 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  41.21 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  40.62 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  40.36 
 
 		 172 aa  122  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  38.75 
 
 		 166 aa  120  9e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  37.58 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  35.98 
 
 		 184 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  42.04 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  38.27 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  38.27 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  43.75 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  39.63 
 
 		 164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  42.5 
 
 		 164 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  42.17 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  36.65 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  38.04 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  35.12 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  37.27 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  37.5 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  38.55 
 
 		 168 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  35.12 
 
 		 184 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  37.89 
 
 		 170 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  39.75 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  40.61 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  34.48 
 
 		 182 aa  108  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  33.33 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  40.85 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  36.52 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  40.13 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  35.56 
 
 		 182 aa  104  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  33.89 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2089  Rubrerythrin  36 
 
 		 202 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  36.81 
 
 		 228 aa  94.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  34.3 
 
 		 184 aa  94.4  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2183  rubrerythrin  36.53 
 
 		 167 aa  91.3  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000223416  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  30.73 
 
 		 192 aa  90.5  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3337  nigerythrin  36.57 
 
 		 202 aa  89  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  34.09 
 
 		 202 aa  89  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  34.13 
 
 		 263 aa  88.2  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  32.34 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  28.49 
 
 		 191 aa  85.9  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  33.33 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  30.73 
 
 		 192 aa  86.3  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  33.12 
 
 		 180 aa  85.9  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  31.14 
 
 		 179 aa  85.5  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  31.93 
 
 		 178 aa  84.7  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  29.73 
 
 		 197 aa  84.3  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  38.36 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  30 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  28.49 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0633  Rubrerythrin  31.64 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000654398  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  31.11 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0398  Rubrerythrin  36 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.849916 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  30.72 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  33.33 
 
 		 696 aa  81.3  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  31.93 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  34.34 
 
 		 215 aa  80.9  0.000000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  31.64 
 
 		 192 aa  80.5  0.000000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  31.28 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  28.89 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  27.93 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  31.95 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  31.65 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  32.73 
 
 		 696 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  31.93 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0568  Rubrerythrin  29.71 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  33.93 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  32.52 
 
 		 178 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  30.34 
 
 		 190 aa  77.4  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  28.66 
 
 		 233 aa  77.4  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  28.14 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.249013 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>