198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0111 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  349  1e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  73.49 
 
 
166 aa  265  2e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  58.43 
 
 
166 aa  201  6e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  54.82 
 
 
166 aa  187  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  55.69 
 
 
173 aa  185  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  52.12 
 
 
167 aa  184  6e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  48.77 
 
 
166 aa  165  3e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  47.88 
 
 
165 aa  161  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  48.77 
 
 
166 aa  159  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  47.88 
 
 
165 aa  160  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  47.74 
 
 
158 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  47.53 
 
 
166 aa  155  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  50.94 
 
 
164 aa  152  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.60498e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  50 
 
 
165 aa  152  3e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  46.3 
 
 
166 aa  152  3e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  45.45 
 
 
165 aa  151  4e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  45.12 
 
 
166 aa  145  2e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  47.5 
 
 
166 aa  145  2e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  49.07 
 
 
165 aa  145  3e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  47.74 
 
 
165 aa  143  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  41.36 
 
 
167 aa  143  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.56568e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  45.62 
 
 
166 aa  141  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  42.77 
 
 
166 aa  140  1e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  44.72 
 
 
166 aa  139  2e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  44.79 
 
 
163 aa  138  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  43.29 
 
 
166 aa  138  4e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  43.64 
 
 
165 aa  137  5e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  44.24 
 
 
166 aa  136  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  43.64 
 
 
166 aa  136  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.42552e-33 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  46.06 
 
 
168 aa  136  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  44.58 
 
 
172 aa  135  3e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  42.07 
 
 
166 aa  135  3e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  42.07 
 
 
166 aa  135  3e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  38.46 
 
 
184 aa  135  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  44.38 
 
 
166 aa  134  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  44.23 
 
 
166 aa  132  2e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  38.29 
 
 
185 aa  130  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  37.71 
 
 
184 aa  130  8e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  37.14 
 
 
184 aa  130  8e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  38.75 
 
 
167 aa  129  2e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  2.49666e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  46.63 
 
 
164 aa  129  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  45.45 
 
 
168 aa  128  5e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  36.57 
 
 
182 aa  127  1e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  45.62 
 
 
167 aa  125  4e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  1.70126e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  42.68 
 
 
164 aa  124  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  41.36 
 
 
168 aa  123  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  2.01822e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  44.17 
 
 
164 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  43.51 
 
 
168 aa  122  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  38.12 
 
 
169 aa  122  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  37.65 
 
 
170 aa  121  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  37.65 
 
 
170 aa  121  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  2.07736e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  43.98 
 
 
163 aa  121  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  38.51 
 
 
168 aa  120  8e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  3.46492e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  43.64 
 
 
165 aa  120  1e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  3.83486e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  36.02 
 
 
169 aa  120  1e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  38.37 
 
 
185 aa  119  2e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  44.17 
 
 
164 aa  118  4e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  37.65 
 
 
170 aa  116  1e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2089  Rubrerythrin  38.86 
 
 
202 aa  112  2e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  37.36 
 
 
182 aa  112  2e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  34.48 
 
 
182 aa  110  8e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  39.53 
 
 
184 aa  110  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  38.65 
 
 
228 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.98251e-06 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  36.97 
 
 
178 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.418e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  38.29 
 
 
202 aa  106  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  37.13 
 
 
180 aa  105  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  45.06 
 
 
169 aa  104  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  34.64 
 
 
190 aa  102  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3337  nigerythrin  37.5 
 
 
202 aa  101  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2183  rubrerythrin  40.83 
 
 
167 aa  100  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  2.23416e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  35.33 
 
 
263 aa  100  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  36.97 
 
 
696 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  32.96 
 
 
191 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  3.77128e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  36.36 
 
 
696 aa  99.4  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  34.73 
 
 
179 aa  98.2  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0398  Rubrerythrin  37.5 
 
 
200 aa  97.1  9e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.849916 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  34.13 
 
 
181 aa  97.1  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  1.48271e-09  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  33.94 
 
 
178 aa  95.5  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  35.98 
 
 
178 aa  95.5  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  3.07395e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  36.67 
 
 
182 aa  95.1  4e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  37.65 
 
 
179 aa  94.7  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  34.73 
 
 
179 aa  94.7  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  34.34 
 
 
178 aa  94  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  31.84 
 
 
190 aa  94  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  32.43 
 
 
197 aa  93.6  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  33.89 
 
 
190 aa  93.6  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  36.09 
 
 
179 aa  94  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  35.76 
 
 
392 aa  92.8  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1565  rubrerythrin  33.51 
 
 
194 aa  93.2  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  35.37 
 
 
178 aa  92.8  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  34.05 
 
 
194 aa  92.8  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  34.08 
 
 
191 aa  92.4  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  6.72055e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  31.28 
 
 
191 aa  91.7  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  31.28 
 
 
192 aa  92  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  35.58 
 
 
183 aa  91.7  4e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0568  Rubrerythrin  32.95 
 
 
179 aa  92  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  35.58 
 
 
183 aa  91.7  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  35.98 
 
 
215 aa  91.3  5e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  35.58 
 
 
183 aa  91.3  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  34.34 
 
 
221 aa  91.3  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  2.56435e-05  normal  0.664088 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>