More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0094 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0094  50S ribosomal protein L5P  100 
 
 		 171 aa  352  1e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.496979 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2240  50S ribosomal protein L5P  54.39 
 
 		 168 aa  195  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000418435  normal  0.360377 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0455  50S ribosomal protein L5P  54.76 
 
 		 165 aa  191  5e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0122847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0545  50S ribosomal protein L5P  55.09 
 
 		 165 aa  189  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  0.364222 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0577  50S ribosomal protein L5P  54.12 
 
 		 167 aa  188  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111203  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0097  50S ribosomal protein L5P  51.5 
 
 		 169 aa  184  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000268421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0014  50S ribosomal protein L5P  51.19 
 
 		 169 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  5.43993e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1715  50S ribosomal protein L5P  52.44 
 
 		 169 aa  167  4e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0194222  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1397  50S ribosomal protein L5P  49.11 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0723  50S ribosomal protein L5P  49.4 
 
 		 181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.305719  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1261  50S ribosomal protein L5P  47.02 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0207186  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0657  50S ribosomal protein L5P  47.62 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15981  decreased coverage  0.0000704942 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0166  50S ribosomal protein L5P  45.24 
 
 		 181 aa  157  8e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000530308  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2305  50S ribosomal protein L5P  45.24 
 
 		 176 aa  157  9e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0223  ribosomal protein L5  46.43 
 
 		 179 aa  155  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2436  50S ribosomal protein L5P  44.64 
 
 		 174 aa  155  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1841  50S ribosomal protein L5P  45.83 
 
 		 175 aa  155  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2231  ribosomal protein L5  44.97 
 
 		 179 aa  154  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1508  ribosomal protein L5  46.47 
 
 		 178 aa  148  4e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.2694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0104  50S ribosomal protein L5P  43.71 
 
 		 174 aa  145  4.0000000000000006e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000310804  unclonable  0.000000485545 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0242  50S ribosomal protein L5P  42.51 
 
 		 182 aa  143  9e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1765  ribosomal protein L5  43.83 
 
 		 179 aa  141  6e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.553857  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2221  50S ribosomal protein L5P  44.05 
 
 		 179 aa  137  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.183607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0907  50S ribosomal protein L5P  42.26 
 
 		 179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.46697  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2000  50S ribosomal protein L5P  42.86 
 
 		 178 aa  133  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23324  predicted protein  43.67 
 
 		 176 aa  130  6.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0764  50S ribosomal protein L5P  42.26 
 
 		 179 aa  130  7.999999999999999e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.296859  normal  0.0880431 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30777  Ribosomal protein L11, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  42.68 
 
 		 177 aa  127  7.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.131413 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04475  60S ribosomal protein L11 (Broad)  40.49 
 
 		 175 aa  122  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.147456 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1831  50S ribosomal protein L5P  38.32 
 
 		 197 aa  121  5e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03370  60s ribosomal protein l11, putative  41.72 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0821316  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72706  predicted protein  39.52 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0797  50S ribosomal protein L5P  33.14 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.268265 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3172  50S ribosomal protein L5  39.86 
 
 		 185 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  42.11 
 
 		 187 aa  95.5  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 188 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  37.76 
 
 		 179 aa  94  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  40.77 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  41.54 
 
 		 179 aa  92.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  41.54 
 
 		 179 aa  93.2  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  41.54 
 
 		 179 aa  92.8  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  37.76 
 
 		 179 aa  93.2  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  39.16 
 
 		 179 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  39.46 
 
 		 185 aa  92  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  39.16 
 
 		 179 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  39.46 
 
 		 185 aa  92  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  40.46 
 
 		 179 aa  92  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  39.16 
 
 		 179 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  40 
 
 		 179 aa  92  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 188 aa  92  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  39.16 
 
 		 179 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  38.46 
 
 		 179 aa  92.4  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 188 aa  92  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  39.16 
 
 		 179 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0710  50S ribosomal protein L5  37.93 
 
 		 185 aa  92  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00257527  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  37.76 
 
 		 179 aa  91.7  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 188 aa  92  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  37.06 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  37.76 
 
 		 179 aa  91.7  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  37.06 
 
 		 179 aa  91.7  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  40.14 
 
 		 185 aa  91.7  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3655  50S ribosomal protein L5  38.46 
 
 		 185 aa  91.3  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  37.76 
 
 		 179 aa  90.9  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0669  50S ribosomal protein L5  40.31 
 
 		 177 aa  90.9  8e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.29336  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1968  50S ribosomal protein L5  39.46 
 
 		 185 aa  90.9  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0033895  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  39.69 
 
 		 179 aa  90.9  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  39.69 
 
 		 179 aa  90.9  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  39.69 
 
 		 179 aa  90.9  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2307  50S ribosomal protein L5  41.54 
 
 		 185 aa  90.5  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0101823  normal  0.115344 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  39.85 
 
 		 185 aa  90.1  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  40.56 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0998  50S ribosomal protein L5  36.81 
 
 		 185 aa  90.1  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0178085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  39.69 
 
 		 179 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  35.66 
 
 		 188 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  37.06 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  37.06 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0406  50S ribosomal protein L5  37.06 
 
 		 183 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0381  50S ribosomal protein L5  37.06 
 
 		 183 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  40 
 
 		 179 aa  89.4  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  39.86 
 
 		 191 aa  89.7  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  37.06 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  37.32 
 
 		 178 aa  89.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  40.46 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5058  50S ribosomal protein L5  40 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  37.06 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  40.46 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  36.36 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1626  50S ribosomal protein L5  36.55 
 
 		 185 aa  89  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317826  normal  0.302656 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  35.66 
 
 		 188 aa  89  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0445  50S ribosomal protein L5  39.53 
 
 		 179 aa  89  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0266949  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  37.76 
 
 		 180 aa  89  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04509  50S ribosomal protein L5  40 
 
 		 180 aa  89  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00526127  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2978  50S ribosomal protein L5  39.86 
 
 		 189 aa  88.6  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 179 aa  88.6  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3436  50S ribosomal protein L5  37.76 
 
 		 185 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160205  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  38.46 
 
 		 179 aa  88.6  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0506  50S ribosomal protein L5  39.53 
 
 		 179 aa  88.2  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0585941  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  37.16 
 
 		 180 aa  88.2  5e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  40 
 
 		 179 aa  87.8  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>