More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0090 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0090  30S ribosomal protein S17P  100 
 
 
108 aa  223  6e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.467837 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2244  30S ribosomal protein S17P  76.19 
 
 
108 aa  174  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000047062  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0573  30S ribosomal protein S17P  73.15 
 
 
108 aa  174  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.400743  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0541  30S ribosomal protein S17P  73.33 
 
 
108 aa  168  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.148109  normal  0.632275 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0451  30S ribosomal protein S17P  71.03 
 
 
108 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0222846  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1719  ribosomal protein S17  61.9 
 
 
106 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000289202  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0010  30S ribosomal protein S17P  62.5 
 
 
109 aa  141  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000332515  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0101  30S ribosomal protein S17P  58.65 
 
 
109 aa  138  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.269064  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1393  30S ribosomal protein S17P  53.33 
 
 
109 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0719  30S ribosomal protein S17P  52.48 
 
 
109 aa  122  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00113927  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1837  30S ribosomal protein S17P  57.43 
 
 
108 aa  119  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1265  30S ribosomal protein S17P  50.5 
 
 
109 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000120679  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0170  30S ribosomal protein S17P  50.5 
 
 
109 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000623487  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0653  30S ribosomal protein S17P  50.5 
 
 
109 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000821144  decreased coverage  0.0000578449 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2301  30S ribosomal protein S17P  57.58 
 
 
108 aa  117  7e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1769  ribosomal protein S17P  51.04 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1512  ribosomal protein S17P  54.29 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.87974e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0801  30S ribosomal protein S17  44.76 
 
 
107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.273968 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0100  30S ribosomal protein S17P  47.57 
 
 
111 aa  105  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000585841  unclonable  0.000000466105 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2227  ribosomal protein S17P  60.67 
 
 
144 aa  103  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0219  ribosomal protein S17P  52.73 
 
 
147 aa  103  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05222  40S ribosomal protein S11 (Broad)  39.81 
 
 
160 aa  100  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.410848 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2440  30S ribosomal protein S17P  52.83 
 
 
114 aa  100  9e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.78188 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82998  predicted protein  40.19 
 
 
155 aa  99.8  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.290781 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32090  Ribosomal protein S11, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  40.74 
 
 
158 aa  99.4  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0918087 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06500  ribosomal protein S11, putative  39.45 
 
 
153 aa  95.9  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28562  predicted protein  39.45 
 
 
166 aa  94.4  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0484  ribosomal protein S17  44.12 
 
 
111 aa  92  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16507  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0773  30S ribosomal protein S17P  43.14 
 
 
124 aa  91.3  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0516  ribosomal protein S17  43.14 
 
 
152 aa  89  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0579006  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0628  30S ribosomal protein S17P  40.2 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  45 
 
 
86 aa  68.6  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1706  30S ribosomal protein S17P  40.78 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0141131 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0725  30S ribosomal protein S17P  42.16 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  46.75 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  46.75 
 
 
88 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  46.75 
 
 
88 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  46.75 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1176  30S ribosomal protein S17  46.15 
 
 
86 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198665  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4017  30S ribosomal protein S17  46.15 
 
 
86 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.05961  hitchhiker  0.00000469312 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0403  30S ribosomal protein S17  46.15 
 
 
84 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0378  30S ribosomal protein S17  46.15 
 
 
84 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  45.45 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0968  30S ribosomal protein S17  44.74 
 
 
88 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132893  hitchhiker  0.000000938527 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  44 
 
 
84 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  42.31 
 
 
88 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  41.03 
 
 
88 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  41.03 
 
 
88 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  46.75 
 
 
91 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0157  ribosomal protein S17  40.51 
 
 
82 aa  57.8  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000117396  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  46.75 
 
 
91 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  42.67 
 
 
84 aa  57  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  45.57 
 
 
82 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  41.03 
 
 
88 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  41.03 
 
 
88 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06340  30S ribosomal protein S17  43.84 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543967  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  44.3 
 
 
82 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  43.42 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4047  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100461  unclonable  0.00000000000380928 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3900  30S ribosomal protein S17  43.84 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00230536  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3750  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000077178  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0209  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000139872  unclonable  0.00000794162 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  44.44 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0205  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000179685  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4161  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038185  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  44.3 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000864007  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  40 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2315  30S ribosomal protein S17  35.44 
 
 
87 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0524873  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0167  30S ribosomal protein S17  44.3 
 
 
82 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350413  hitchhiker  0.000281031 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0503  30S ribosomal protein S17  44.44 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00731463  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0179  ribosomal protein S17  41.56 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000265086  n/a   
 
 
 
NC_008709  Ping_3515  ribosomal protein S17  37.97 
 
 
83 aa  55.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000390975  hitchhiker  0.000000987028 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0765  30S ribosomal protein S17  46.15 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000334352  normal  0.110836 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2160  30S ribosomal protein S17  36 
 
 
88 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0103749  normal  0.166866 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0332  ribosomal protein S17  40.51 
 
 
84 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000873863  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  39.24 
 
 
84 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  39.24 
 
 
84 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  39.24 
 
 
84 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  39.24 
 
 
84 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4535  30S ribosomal protein S17  37.97 
 
 
84 aa  53.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011061  hitchhiker  0.0016313 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  39.24 
 
 
84 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  39.24 
 
 
84 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  39.24 
 
 
84 aa  53.5  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  39.24 
 
 
84 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  39.24 
 
 
84 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4267  ribosomal protein S17  38.27 
 
 
86 aa  53.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000045276  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0346  30S ribosomal protein S17  45.83 
 
 
89 aa  52.8  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000061792  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2055  30S ribosomal protein S17  44 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000336499  normal  0.395653 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3627  30S ribosomal protein S17  39.24 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167821  normal  0.881176 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00454  30S ribosomal protein S17  40.51 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.301377  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3798  30S ribosomal protein S17  39.24 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0301634  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3700  30S ribosomal protein S17  39.24 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000665408  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3735  30S ribosomal protein S17  39.24 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000974473  normal  0.0213342 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0062  30S ribosomal protein S17  40.96 
 
 
89 aa  52.8  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000414135  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3627  30S ribosomal protein S17  39.24 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000562694  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0222  30S ribosomal subunit protein S17  41.77 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000618059  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>