53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0086 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0086  50S ribosomal protein L22P  100 
 
 
157 aa  323  4.0000000000000003e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.438509 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0537  50S ribosomal protein L22P  56.41 
 
 
154 aa  186  8e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.63908 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0569  50S ribosomal protein L22P  57.05 
 
 
153 aa  186  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0413889  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0447  50S ribosomal protein L22P  54.49 
 
 
156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0102501  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2248  50S ribosomal protein L22P  52.26 
 
 
154 aa  170  6.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000896212  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0006  50S ribosomal protein L22P  45.22 
 
 
151 aa  140  8e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000018702  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1723  ribosomal protein L22  49.04 
 
 
152 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00000443469  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0105  50S ribosomal protein L22P  45.22 
 
 
151 aa  134  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379943  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1388  50S ribosomal protein L22P  42.58 
 
 
153 aa  127  6e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0175  50S ribosomal protein L22P  41.94 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000281865  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0714  50S ribosomal protein L22P  41.29 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00766872  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0648  50S ribosomal protein L22P  41.94 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000866939  hitchhiker  0.000275224 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1270  50S ribosomal protein L22P  41.94 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000000869512  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0556  50S ribosomal protein L22P  40.13 
 
 
168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2297  50S ribosomal protein L22P  43.42 
 
 
156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1930  50S ribosomal protein L22P  35.26 
 
 
185 aa  111  4.0000000000000004e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.70908  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1833  ribosomal protein L22  41.72 
 
 
153 aa  107  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.271117 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1732  50S ribosomal protein L22P  37.5 
 
 
198 aa  107  6e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0770  50S ribosomal protein L22P  36.84 
 
 
185 aa  105  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0748  50S ribosomal protein L22P  36.84 
 
 
185 aa  105  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1773  ribosomal protein L22  36.36 
 
 
157 aa  102  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1516  ribosomal protein L22  38 
 
 
151 aa  99  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  9.68145e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0805  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0489  ribosomal protein L22  40.6 
 
 
127 aa  92  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0096  50S ribosomal protein L22P  32.65 
 
 
156 aa  85.5  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000729368  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2223  ribosomal protein L22  34.81 
 
 
159 aa  84  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0215  ribosomal protein L22  37.5 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2444  50S ribosomal protein L22P  29.61 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29177  predicted protein  29.37 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669765  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00776  60S ribosomal protein L17 (AFU_orthologue; AFUA_1G14410)  32.86 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.844288  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89240  ribosomal protein L17B  31.72 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32234  Ribosomal protein L17, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  32.14 
 
 
183 aa  67.4  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01720  60s ribosomal protein l17, putative  29.08 
 
 
182 aa  60.8  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0270  ribosomal protein L22  42.03 
 
 
121 aa  52  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000922526  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  37.88 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1345  ribosomal protein L22  39.71 
 
 
212 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  37.88 
 
 
117 aa  43.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  31.4 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17441  50S ribosomal protein L22  36.36 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23071  50S ribosomal protein L22  36.36 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  33.72 
 
 
110 aa  42  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  32.86 
 
 
111 aa  42  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4021  50S ribosomal protein L22  39.44 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552506  hitchhiker  0.00000514416 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17601  50S ribosomal protein L22  36.36 
 
 
128 aa  41.6  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0371  50S ribosomal protein L22  36.36 
 
 
121 aa  41.6  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.300281  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17351  50S ribosomal protein L22  34.85 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0696  50S ribosomal protein L22  37.88 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00931457  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0231  50S ribosomal protein L22/unknown domain fusion protein  30.19 
 
 
311 aa  40.8  0.006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.415119  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1180  50S ribosomal protein L22  38.03 
 
 
113 aa  41.2  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78172  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1645  50S ribosomal protein L22  34.85 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  33.72 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1280  ribosomal protein L22  44.23 
 
 
110 aa  40.4  0.01  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0713  50S ribosomal protein L22  32.18 
 
 
114 aa  40.4  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.41885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>