More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0070 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0070  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  289  7e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000421347 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2636  transcriptional regulator, HxlR family  59.13 
 
 		 124 aa  140  8e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0214616  hitchhiker  0.00638714 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0977  HxlR family transcriptional regulator  50.89 
 
 		 124 aa  124  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.363566  normal  0.0295243 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1884  hypothetical protein  42.45 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.226318  normal  0.614663 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0690  transcriptional regulator, HxlR family  40.95 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0241  putative transcriptional regulator  38.68 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0603552  normal  0.811077 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2995  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  40.2 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  42.11 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  37.62 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2848  transcriptional regulator, HxlR family  39.13 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2608  transcriptional regulator, HxlR family  38.68 
 
 		 175 aa  73.6  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  36.96 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0580  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0795968 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  34 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  41.76 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  35.85 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  30.4 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  36.67 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  39.13 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  38.14 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  34.21 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  36.63 
 
 		 112 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  37.63 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  33.68 
 
 		 138 aa  67  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  36.7 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  36.7 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  36.63 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1769  transcriptional regulator superfamily  37.36 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  35.05 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5131  transcriptional regulator, HxlR family  34.69 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0956366  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  36.63 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  36.63 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  38.04 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  38.04 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  35.04 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2009  transcriptional regulator  43.9 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  32.97 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  39.77 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  33.98 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  39.13 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0500  hypothetical protein  36.84 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  37.89 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3369  hypothetical protein  41.05 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0346683  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  32.61 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2054  transcriptional regulator, HxlR family  34.78 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  37.78 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  35.56 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  35.14 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  32.97 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  35.56 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  35.56 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  35.56 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  35.56 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  38.46 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  35.56 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  35.16 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  39.56 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3592  HxlR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  36.67 
 
 		 114 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2460  transcriptional regulator, HxlR family  37.89 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2669  transcriptional regulator, HxlR family  37.23 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  36.67 
 
 		 114 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  38.46 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0341  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45733  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  35.87 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>