More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0064 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0064  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 336 aa  685    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000115242  hitchhiker  0.000142172 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2232  adenylosuccinate synthetase  69.35 
 
 		 350 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.463237  normal  0.0169384 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0005  adenylosuccinate synthetase  68.15 
 
 		 346 aa  481  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0004  adenylosuccinate synthetase  67.46 
 
 		 337 aa  472  1e-132  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2319  adenylosuccinate synthetase  66.87 
 
 		 337 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0743  adenylosuccinate synthetase  55.62 
 
 		 338 aa  387  1e-106  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00140834  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1241  adenylosuccinate synthetase  54.17 
 
 		 337 aa  383  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0114647  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0677  adenylosuccinate synthetase  54.14 
 
 		 338 aa  381  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0033  adenylosuccinate synthetase  54.17 
 
 		 336 aa  378  1e-104  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0146  adenylosuccinate synthetase  54.17 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00393443  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1420  adenylosuccinate synthetase  50.9 
 
 		 333 aa  335  7e-91  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1964  adenylosuccinate synthetase  47.59 
 
 		 337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0019  adenylosuccinate synthetase  42.69 
 
 		 336 aa  283  4.0000000000000003e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.617132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0128  adenylosuccinate synthetase  43.07 
 
 		 334 aa  282  5.000000000000001e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0162  adenylosuccinate synthetase  43.2 
 
 		 334 aa  282  7.000000000000001e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1220  Adenylosuccinate synthase  41.57 
 
 		 335 aa  280  3e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0146  adenylosuccinate synthetase  42.3 
 
 		 332 aa  271  1e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.531372  normal  0.191753 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1196  adenylosuccinate synthetase  41.39 
 
 		 334 aa  270  2e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0015  adenylosuccinate synthetase  39.27 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000196036  normal  0.0126394 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1359  adenylosuccinate synthase  39.03 
 
 		 338 aa  206  6e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  31.78 
 
 		 451 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  32.38 
 
 		 435 aa  197  3e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  32.14 
 
 		 435 aa  195  1e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  32.47 
 
 		 430 aa  193  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  36.69 
 
 		 447 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  36.69 
 
 		 447 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2004  adenylosuccinate synthase  33.8 
 
 		 561 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00819563  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2585  adenylosuccinate synthase  31.06 
 
 		 431 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  36.2 
 
 		 432 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0215  adenylosuccinate synthetase  31.46 
 
 		 432 aa  189  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  36.2 
 
 		 432 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  35.71 
 
 		 432 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  29.41 
 
 		 430 aa  188  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  30.52 
 
 		 432 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  30.75 
 
 		 432 aa  188  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000472279 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  30.75 
 
 		 432 aa  188  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  30.52 
 
 		 432 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0550  adenylosuccinate synthetase  31.22 
 
 		 431 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1927  adenylosuccinate synthetase  32.53 
 
 		 415 aa  187  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  30.73 
 
 		 431 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  30.28 
 
 		 432 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  31.76 
 
 		 431 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0526  adenylosuccinate synthetase  30.99 
 
 		 431 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  32.09 
 
 		 431 aa  186  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  29.74 
 
 		 428 aa  187  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2266  adenylosuccinate synthetase  31.53 
 
 		 425 aa  186  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  35.48 
 
 		 447 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  31.54 
 
 		 428 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  31.53 
 
 		 430 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  31.53 
 
 		 430 aa  186  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  31.69 
 
 		 427 aa  185  8e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  31.91 
 
 		 431 aa  185  9e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  30.05 
 
 		 432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  30.05 
 
 		 432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  30.05 
 
 		 432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  30.05 
 
 		 432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  30.05 
 
 		 432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  30.05 
 
 		 432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3357  adenylosuccinate synthetase  31.21 
 
 		 431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0113184  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  30.05 
 
 		 432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  31.4 
 
 		 442 aa  184  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  30.05 
 
 		 432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  30.05 
 
 		 432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  31.6 
 
 		 432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  30.73 
 
 		 432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1068  adenylosuccinate synthetase  30.54 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  31.29 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3868  adenylosuccinate synthetase  30.9 
 
 		 442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  31.31 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  29.81 
 
 		 432 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  34.62 
 
 		 444 aa  183  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  29.81 
 
 		 432 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  29.81 
 
 		 432 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  30.99 
 
 		 432 aa  184  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  29.81 
 
 		 432 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  30.44 
 
 		 428 aa  183  3e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  29.81 
 
 		 432 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  31.68 
 
 		 431 aa  183  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000376094  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  30.26 
 
 		 430 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  32.55 
 
 		 427 aa  183  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  30.44 
 
 		 432 aa  183  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0705  adenylosuccinate synthetase  30.97 
 
 		 431 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343177  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  29.84 
 
 		 432 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  31.28 
 
 		 426 aa  182  5.0000000000000004e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  31.22 
 
 		 431 aa  182  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  36.12 
 
 		 429 aa  182  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0735  adenylosuccinate synthetase  30.73 
 
 		 431 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000671232  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0645  adenylosuccinate synthetase  32.15 
 
 		 429 aa  182  7e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0726  adenylosuccinate synthetase  30.73 
 
 		 431 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0654832  hitchhiker  0.0000471969 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  30.9 
 
 		 429 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2416  adenylosuccinate synthetase  29.6 
 
 		 428 aa  182  8.000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  31.31 
 
 		 430 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3649  adenylosuccinate synthetase  30.73 
 
 		 431 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000709559  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  35.4 
 
 		 439 aa  181  1e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1784  adenylosuccinate synthetase  31.6 
 
 		 430 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2857  adenylosuccinate synthetase  29.4 
 
 		 445 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0509  adenylosuccinate synthetase  31.91 
 
 		 431 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567032  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0747  adenylosuccinate synthetase  30.97 
 
 		 431 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000703533  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  30.91 
 
 		 431 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110825  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  30.91 
 
 		 431 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>