36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0021 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0021  hypothetical protein  100 
 
 
382 aa  780    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0732  hypothetical protein  44.36 
 
 
382 aa  335  5e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2522  hypothetical protein  41.19 
 
 
404 aa  288  7e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.101837  normal  0.542859 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2315  hypothetical protein  38.48 
 
 
397 aa  278  8e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2120  hypothetical protein  39.53 
 
 
389 aa  262  6e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04270  hypothetical protein  36.01 
 
 
388 aa  261  2e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  26.35 
 
 
411 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.14 
 
 
407 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  26.11 
 
 
437 aa  57  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0177  hypothetical protein  28.57 
 
 
411 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4142  hypothetical protein  22.42 
 
 
414 aa  51.2  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16964  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4090  hypothetical protein  22.42 
 
 
414 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.572464  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  25.82 
 
 
1033 aa  50.8  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0072  hypothetical protein  24.37 
 
 
414 aa  50.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.7 
 
 
403 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.7 
 
 
403 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  25.1 
 
 
398 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  22.73 
 
 
389 aa  47.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  23.32 
 
 
896 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  23.32 
 
 
894 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  23.32 
 
 
926 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  23.32 
 
 
904 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  23.32 
 
 
924 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  24.1 
 
 
401 aa  46.6  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  26.92 
 
 
402 aa  46.6  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  28.71 
 
 
407 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  23.32 
 
 
912 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  23.32 
 
 
904 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  28.71 
 
 
407 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  26.74 
 
 
321 aa  46.2  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1553  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp, putative  24.6 
 
 
267 aa  45.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  22.8 
 
 
891 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6391  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.97 
 
 
403 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782672  normal  0.167257 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  24.37 
 
 
414 aa  44.3  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3748  protein of unknown function DUF201  28.95 
 
 
388 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.58 
 
 
412 aa  43.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>