90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0016 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0016  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  696    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0157  hypothetical protein  34.49 
 
 
411 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0683  hypothetical protein  33.42 
 
 
405 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1273  hypothetical protein  33.25 
 
 
405 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1403  hypothetical protein  33.17 
 
 
405 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1281  hypothetical protein  32.92 
 
 
405 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1544  protein of unknown function DUF111  32.17 
 
 
389 aa  133  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0339  hypothetical protein  29.46 
 
 
406 aa  133  6e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1127  hypothetical protein  31.94 
 
 
392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2031  hypothetical protein  35.75 
 
 
462 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0369  hypothetical protein  33.07 
 
 
407 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2204  protein of unknown function DUF111  33.78 
 
 
432 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1165  hypothetical protein  38.53 
 
 
395 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189277  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0761  hypothetical protein  33.62 
 
 
396 aa  109  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000360196 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2428  hypothetical protein  34.03 
 
 
401 aa  110  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3163  protein of unknown function DUF111  36.14 
 
 
394 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0903  hypothetical protein  33.72 
 
 
426 aa  107  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3737  hypothetical protein  31.72 
 
 
410 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173337  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0590  hypothetical protein  30.71 
 
 
411 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.297044  hitchhiker  0.000815956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4915  protein of unknown function DUF111  32.59 
 
 
386 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2265  hypothetical protein  27.37 
 
 
396 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1654  hypothetical protein  30.4 
 
 
492 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.10098 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0261  hypothetical protein  31.11 
 
 
396 aa  99.4  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.991646 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1404  protein of unknown function DUF111  32.78 
 
 
404 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2400  protein of unknown function DUF111  31.91 
 
 
475 aa  97.8  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3696  hypothetical protein  34.23 
 
 
419 aa  95.9  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2415  hypothetical protein  34.23 
 
 
419 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1782  hypothetical protein  29.84 
 
 
435 aa  95.1  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.139108  normal  0.205062 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1783  hypothetical protein  32.23 
 
 
397 aa  94  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00757644  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2864  protein of unknown function DUF111  29.66 
 
 
395 aa  94  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000578609 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0253  hypothetical protein  29.49 
 
 
395 aa  93.6  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4936  hypothetical protein  35.12 
 
 
420 aa  94  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1273  hypothetical protein  31.86 
 
 
387 aa  92.8  8e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2227  hypothetical protein  34.67 
 
 
408 aa  92.4  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2158  hypothetical protein  30.68 
 
 
397 aa  92  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2452  hypothetical protein  29.09 
 
 
395 aa  92  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0215  hypothetical protein  31.19 
 
 
390 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3548  hypothetical protein  32.17 
 
 
427 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0626  hypothetical protein  33 
 
 
392 aa  91.3  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3731  hypothetical protein  35.64 
 
 
385 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3626  hypothetical protein  34.16 
 
 
385 aa  90.1  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.405616  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0652  hypothetical protein  29.44 
 
 
446 aa  89.7  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3339  hypothetical protein  29.06 
 
 
402 aa  89.4  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000998709  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1278  protein of unknown function DUF111  30.26 
 
 
408 aa  89.4  8e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1474  hypothetical protein  32.26 
 
 
407 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0123523 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0175  protein of unknown function DUF111  29.53 
 
 
480 aa  89  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1826  hypothetical protein  31.43 
 
 
402 aa  87.8  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2531  hypothetical protein  35.68 
 
 
388 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.385418  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1719  hypothetical protein  31.49 
 
 
394 aa  87.8  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2692  hypothetical protein  31.6 
 
 
429 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4468  protein of unknown function DUF111  29.56 
 
 
395 aa  86.3  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0284485  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0194  hypothetical protein  30.23 
 
 
390 aa  86.3  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  0.707381 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0528  protein of unknown function DUF111  29.05 
 
 
499 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659474 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0176  hypothetical protein  32.22 
 
 
384 aa  84  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2177  protein of unknown function DUF111  29.84 
 
 
468 aa  83.6  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3317  hypothetical protein  33.8 
 
 
391 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4449  protein of unknown function DUF111  29.25 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.438751  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4313  hypothetical protein  29.25 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1635  protein of unknown function DUF111  27.8 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.165553  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4458  hypothetical protein  29.1 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0141  hypothetical protein  32.55 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2401  hypothetical protein  30.45 
 
 
394 aa  80.5  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2351  hypothetical protein  31.84 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2215  hypothetical protein  30.84 
 
 
394 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00110232  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1561  protein of unknown function DUF111  27.96 
 
 
408 aa  76.3  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42597  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26870  conserved hypothetical protein TIGR00299  31.07 
 
 
525 aa  75.9  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.487711  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2512  hypothetical protein  28.29 
 
 
396 aa  75.5  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0156591 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0099  protein of unknown function DUF111  31.68 
 
 
386 aa  74.3  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.663305  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0709  hypothetical protein  32.09 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1002  hypothetical protein  29.41 
 
 
396 aa  70.5  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0715  hypothetical protein  31 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.356802  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0168  hypothetical protein  27.31 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0766  hypothetical protein  41.11 
 
 
379 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1596  protein of unknown function DUF111  30.96 
 
 
406 aa  64.7  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42941  predicted protein  31.39 
 
 
461 aa  60.1  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31470  hypothetical protein  25.24 
 
 
463 aa  59.7  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6460  hypothetical protein  30.94 
 
 
414 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07031  hypothetical protein  26.81 
 
 
410 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4211  hypothetical protein  27.23 
 
 
437 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05431  hypothetical protein  30.09 
 
 
410 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0488  hypothetical protein  29.28 
 
 
408 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2562  protein of unknown function DUF111  28.88 
 
 
458 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000210764 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0537  hypothetical protein  36.05 
 
 
435 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.968061  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1915  hypothetical protein  33.54 
 
 
398 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05511  hypothetical protein  29.02 
 
 
407 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.584195  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05141  hypothetical protein  30.52 
 
 
410 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05441  hypothetical protein  26.11 
 
 
408 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.307892 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1358  hypothetical protein  26.19 
 
 
450 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00955528 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1820  hypothetical protein  24.18 
 
 
407 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.493848  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0666  hypothetical protein  25.15 
 
 
387 aa  43.5  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.62938  normal  0.89141 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>