20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0004 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0004  DNA polymerase II small subunit  100 
 
 
471 aa  967    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2412  DNA polymerase II small subunit  52.65 
 
 
474 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0035  DNA polymerase II small subunit  52.87 
 
 
465 aa  502  1e-141  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0409  DNA polymerase II small subunit  52.99 
 
 
467 aa  498  1e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.894742  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0045  DNA polymerase II small subunit  52.68 
 
 
467 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1005  DNA polymerase II small subunit  46.17 
 
 
674 aa  355  1e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0659  DNA polymerase II small subunit  40.52 
 
 
487 aa  353  4e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.629258  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0817  DNA-directed DNA polymerase  42.38 
 
 
527 aa  324  2e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0685678  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0004  DNA-directed DNA polymerase  41.6 
 
 
517 aa  313  4.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1610  DNA polymerase II small subunit  42.32 
 
 
537 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1933  DNA-directed DNA polymerase  40.1 
 
 
514 aa  305  1.0000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0003  DNA polymerase II small subunit  42.13 
 
 
588 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.626198 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0612  DNA-directed DNA polymerase  35.11 
 
 
466 aa  288  1e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1212  DNA polymerase II small subunit  40.16 
 
 
594 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1166  DNA polymerase II small subunit  39.74 
 
 
640 aa  276  6e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1005  DNA polymerase II small subunit  39.84 
 
 
578 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1676  DNA polymerase II small subunit  39.84 
 
 
583 aa  271  2e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0941  DNA polymerase II small subunit  39.58 
 
 
584 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0002  DNA polymerase II small subunit  37.3 
 
 
481 aa  264  2e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3012  hypothetical protein  21.38 
 
 
315 aa  45.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.905594  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>