22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5967 on replicon NC_008704
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5564  hypothetical protein  100 
 
 
472 aa  896    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0944737  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5967  hypothetical protein  100 
 
 
472 aa  896    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10297  transmembrane protein  41.86 
 
 
472 aa  265  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000883477  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0420  hypothetical protein  36.31 
 
 
485 aa  208  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0388  hypothetical protein  38.67 
 
 
464 aa  203  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45366 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0379  hypothetical protein  38.17 
 
 
459 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0367  hypothetical protein  38.36 
 
 
444 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0321  hypothetical protein  36.44 
 
 
482 aa  192  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50668  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0081  hypothetical protein  25.15 
 
 
508 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0282118  normal  0.0438022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6572  secretion protein snm4  23.95 
 
 
464 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1682  secretion protein snm4  25.25 
 
 
515 aa  64.3  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0678  secretion protein snm4  26.68 
 
 
465 aa  60.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.939743  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04370  secretion protein snm4  25.1 
 
 
464 aa  60.5  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.435165 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1209  secretion protein snm4  25.29 
 
 
472 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0990  secretion protein snm4  25.78 
 
 
470 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0265679  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0332  secretion protein snm4  25.11 
 
 
528 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5455  Fis family transcriptional regulator  27.79 
 
 
473 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5431  protein of unknown function DUF571  34.58 
 
 
444 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55205  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0764  hypothetical protein  23.65 
 
 
486 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13912  transmembrane protein  25.47 
 
 
479 aa  45.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000584195  normal  0.954546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0608  secretion protein snm4  32.77 
 
 
468 aa  43.9  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0693  secretion protein snm4  25.6 
 
 
473 aa  43.5  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>