More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5958 on replicon NC_008704
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5555  AAA ATPase, central region  100 
 
 
612 aa  1221    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5958  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
612 aa  1221    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0411  ATPase central domain-containing protein  43.86 
 
 
615 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.448945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0359  ATPase central domain-containing protein  43.4 
 
 
594 aa  405  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0702866  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0370  AAA ATPase, central region  43.22 
 
 
594 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0380  ATPase central domain-containing protein  43.22 
 
 
594 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0329  ATPase central domain-containing protein  42.76 
 
 
616 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351983  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10289  hypothetical protein  42.29 
 
 
631 aa  396  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000685477  normal  0.631153 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0072  ATPase central domain-containing protein  35.24 
 
 
574 aa  263  8e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.927916  normal  0.0298572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0773  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 
574 aa  255  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13903  hypothetical protein  35.2 
 
 
573 aa  239  8e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11829  hypothetical protein  32.5 
 
 
610 aa  239  9e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0054  ATPase central domain-containing protein  35.16 
 
 
573 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0220398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0064  AAA ATPase, central region  34.98 
 
 
573 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0073  ATPase central domain-containing protein  34.98 
 
 
573 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183052  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5463  ATPase central domain-containing protein  33.39 
 
 
599 aa  233  6e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0936  AAA ATPase central domain protein  33.39 
 
 
591 aa  226  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.522064  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5503  ATPase central domain-containing protein  31.33 
 
 
593 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000401305 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13919  hypothetical protein  29.48 
 
 
619 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0831137  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3318  AAA ATPase central domain protein  38.81 
 
 
823 aa  167  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.488425  normal  0.919341 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4389  ATPase central domain-containing protein  44.44 
 
 
466 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2144  ATPase  38.75 
 
 
802 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844898  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2403  AAA ATPase central domain-containing protein  39.16 
 
 
779 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1592  AAA ATPase central domain protein  38.68 
 
 
819 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00365213  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7100  ATPase central domain-containing protein  38.3 
 
 
780 aa  163  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3584  AAA ATPase central domain protein  36.9 
 
 
678 aa  162  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.883196  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1880  ATPase central domain-containing protein  36.56 
 
 
318 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00868854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1144  stage V sporulation protein K  35.55 
 
 
1930 aa  159  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4841  ATPase central domain-containing protein  37.37 
 
 
1105 aa  159  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585558  hitchhiker  0.0091693 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0467  ATPase central domain-containing protein  38.51 
 
 
564 aa  158  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.12935 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1071  ATPase central domain-containing protein  42.34 
 
 
596 aa  156  9e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1867  ATPase central domain-containing protein  39.65 
 
 
344 aa  155  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0460326  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0226  AAA ATPase central domain protein  39.51 
 
 
344 aa  154  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12600  AAA+ family ATPase  41.15 
 
 
681 aa  154  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.37602  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0394  AAA ATPase central domain protein  42.86 
 
 
558 aa  153  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0521615  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2798  ATPase central domain-containing protein  39.71 
 
 
855 aa  151  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  0.219212 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  37.33 
 
 
839 aa  150  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1619  ATPase central domain-containing protein  35.09 
 
 
298 aa  150  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.684878  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3737  stage V sporulation protein K  41 
 
 
318 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3555  stage V sporulation protein K  41 
 
 
318 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3454  stage V sporulation protein K  41 
 
 
318 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3467  stage V sporulation protein K  41 
 
 
318 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3719  stage V sporulation protein K  41 
 
 
318 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0200700000000003e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3839  stage V sporulation protein K  41 
 
 
318 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3760  stage V sporulation protein K  41 
 
 
318 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000531501  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17420  AAA+ family ATPase  42.02 
 
 
466 aa  148  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.131578  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3526  AAA ATPase central domain protein  39.93 
 
 
341 aa  147  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1396  AAA ATPase central domain protein  39.93 
 
 
341 aa  147  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3809  stage V sporulation protein K  41 
 
 
318 aa  147  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1496  stage V sporulation protein K  41 
 
 
318 aa  147  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0780968  normal  0.0751264 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2104  stage V sporulation protein K  38.17 
 
 
310 aa  146  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2067  ATPases of the AAA+ class-like protein  37.56 
 
 
365 aa  146  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3475  sporulation stage V protein K  40 
 
 
318 aa  146  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0352307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3309  AAA ATPase central domain protein  36.51 
 
 
617 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0170  stage V sporulation protein K  34.18 
 
 
550 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.129019  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1988  ATPase central domain-containing protein  41.12 
 
 
664 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.204493  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2862  AAA ATPase central domain protein  38.87 
 
 
379 aa  145  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1502  AAA ATPase central domain protein  42.25 
 
 
321 aa  144  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000852955 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1224  stage V sporulation protein K  43.85 
 
 
310 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000254018  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2725  AAA ATPase central domain protein  42.19 
 
 
321 aa  144  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00914326  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0029  AAA+ class-like ATPase  35.64 
 
 
469 aa  144  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.509013  hitchhiker  0.00474583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1627  AAA ATPase central domain protein  41.26 
 
 
1110 aa  143  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.856063  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11610  AAA ATPase central domain protein  40.11 
 
 
348 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1566  AAA ATPase central domain protein  39.27 
 
 
329 aa  141  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.201221  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4241  AAA ATPase, central region  41.38 
 
 
390 aa  140  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.434554  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3253  phosphoribulokinase/uridine kinase  34.46 
 
 
312 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346779  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2387  sporulation stage V protein K  39.9 
 
 
318 aa  139  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0379773  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2132  AAA ATPase central domain protein  41.15 
 
 
322 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.474775  normal  0.0176248 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4249  AAA ATPase, central region  38.81 
 
 
846 aa  137  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1603  ATPase  34.66 
 
 
301 aa  137  6.0000000000000005e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1118  AAA ATPase  33.53 
 
 
331 aa  137  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000607625  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3926  CbxX/CfqX monofunctional  36.08 
 
 
311 aa  137  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1455  ATPase central domain-containing protein  39.53 
 
 
653 aa  135  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.183766  hitchhiker  0.0000524636 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2710  ATPase central domain-containing protein  35.74 
 
 
309 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.947167 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0763  ATPase  34.19 
 
 
301 aa  134  6e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1454  ATPase central domain-containing protein  40.31 
 
 
366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000393055 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2451  CbbX-like protein, putative AAA ATPase  37.99 
 
 
349 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.349953 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1280  CbbX protein  40.22 
 
 
341 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0325141  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6495  CbbX protein  38.77 
 
 
329 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0684  AAA ATPase, central region  35.14 
 
 
320 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2939  ATPase central domain-containing protein  39.67 
 
 
309 aa  130  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.949786  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0983  hypothetical protein  37.76 
 
 
299 aa  130  6e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00278176  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1916  CbxX/CfqX monofunctional  40.39 
 
 
317 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.931527 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1517  spoVK domain-containing protein  35.37 
 
 
1133 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.885165  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1701  ATPase central domain-containing protein  40 
 
 
308 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164899  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3030  CbbX protein  41.08 
 
 
310 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00687874  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0673  AAA ATPase, central region  30.28 
 
 
487 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.265099 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3720  AAA ATPase, central region  39.67 
 
 
307 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.220422  hitchhiker  0.00179613 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6840  ATPase central domain-containing protein  36.59 
 
 
354 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153796  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08171  RuBisCo-expression protein CbbX  33.94 
 
 
305 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2784  AAA type ATPase  41.08 
 
 
298 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1283  AAA ATPase central domain protein  31.64 
 
 
389 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1312  AAA ATPase central domain protein  31.64 
 
 
389 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.505447 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1749  CbbX protein  39.13 
 
 
308 aa  127  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42728  predicted protein  31.63 
 
 
505 aa  127  7e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3060  AAA ATPase central domain protein  34.01 
 
 
541 aa  127  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000283109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0453  CbbX-like protein  34.19 
 
 
334 aa  126  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.127977 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1197  CbbX protein  39.6 
 
 
307 aa  126  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1480  AAA type ATPase  39.13 
 
 
318 aa  126  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0826  ATPase central domain-containing protein  34.8 
 
 
306 aa  125  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>