60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5797 on replicon NC_008704
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  70.14 
 
 		 1594 aa  708    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  100 
 
 		 577 aa  1132    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  32.3 
 
 		 1606 aa  213  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  35.37 
 
 		 1697 aa  212  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  33.95 
 
 		 1748 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  31.28 
 
 		 1693 aa  208  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  33.64 
 
 		 1700 aa  207  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  33.07 
 
 		 1575 aa  200  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  34.19 
 
 		 1417 aa  197  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  33.21 
 
 		 1703 aa  194  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  31.14 
 
 		 1669 aa  190  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  33.74 
 
 		 1516 aa  189  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  30.57 
 
 		 1702 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  31.85 
 
 		 1701 aa  188  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  30.94 
 
 		 1642 aa  184  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  30.41 
 
 		 1956 aa  182  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  29.83 
 
 		 1697 aa  179  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  30.68 
 
 		 1669 aa  178  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  25.8 
 
 		 2077 aa  170  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  36.21 
 
 		 2005 aa  167  5.9999999999999996e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 		 1674 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  26.88 
 
 		 1726 aa  160  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  38.71 
 
 		 1722 aa  151  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  28.23 
 
 		 1706 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  26 
 
 		 1649 aa  143  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  24.31 
 
 		 2098 aa  139  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  35.06 
 
 		 470 aa  134  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  39.26 
 
 		 1925 aa  134  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  28.7 
 
 		 2274 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  25.14 
 
 		 2570 aa  110  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  23.85 
 
 		 1932 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  23.91 
 
 		 1934 aa  100  7e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  43.9 
 
 		 284 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  31.25 
 
 		 1211 aa  74.7  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0796  hypothetical protein  31.67 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  24.49 
 
 		 1328 aa  67.8  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  26.14 
 
 		 2117 aa  65.1  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1468  adenine-specific DNA methylase  24.77 
 
 		 254 aa  56.6  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771536 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2349  hypothetical protein  24.29 
 
 		 341 aa  55.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0743518  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  27.27 
 
 		 423 aa  54.7  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1570  hypothetical protein  24.7 
 
 		 341 aa  54.3  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.447914  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0237  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 248 aa  52.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  29.08 
 
 		 347 aa  50.4  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  30.82 
 
 		 466 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0563  methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 270 aa  47.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2083  methyltransferase small  32.08 
 
 		 204 aa  47  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.33 
 
 		 252 aa  46.6  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  34.59 
 
 		 262 aa  47  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  33.94 
 
 		 201 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  37.14 
 
 		 298 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0279  hypothetical protein  36.46 
 
 		 285 aa  44.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.062823 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0671  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  32.17 
 
 		 333 aa  44.7  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  33.04 
 
 		 263 aa  44.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2552  23S rRNA methyltransferase A  29.14 
 
 		 269 aa  44.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000580084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  32.95 
 
 		 213 aa  44.3  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3453  methyltransferase small  31.53 
 
 		 301 aa  44.3  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.424927  normal  0.835639 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  33.78 
 
 		 242 aa  43.9  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01792  23S rRNA m1G745 methyltransferase  28.57 
 
 		 269 aa  43.5  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000732176  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01780  hypothetical protein  28.57 
 
 		 269 aa  43.5  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000118677  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1810  23S rRNA methyltransferase A  28.57 
 
 		 269 aa  43.5  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00511797  normal  0.361683 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>