More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5727 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009339  Mflv_5281  histidine kinase  100 
 
 
151 aa  314  3e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.263883  normal  0.386303 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5727  histidine kinase  100 
 
 
151 aa  314  3e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.21896  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1255  integrase catalytic subunit  79.78 
 
 
329 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2416  integrase catalytic subunit  79.78 
 
 
329 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571149  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1272  integrase catalytic subunit  79.78 
 
 
329 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4349  transposase  69.33 
 
 
329 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  86.15 
 
 
394 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1813  Integrase catalytic region  71.05 
 
 
332 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1107  Integrase catalytic region  69.74 
 
 
332 aa  116  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.528266 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  84.62 
 
 
395 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  84.62 
 
 
394 aa  110  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24520  integrase family protein  64.38 
 
 
328 aa  107  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4847  Integrase catalytic region  64.38 
 
 
328 aa  106  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1120  integrase catalytic subunit  61.64 
 
 
358 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1137  integrase catalytic subunit  61.64 
 
 
358 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1052  integrase catalytic subunit  62.5 
 
 
358 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1652  integrase catalytic subunit  62.5 
 
 
358 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1510  integrase catalytic subunit  61.33 
 
 
325 aa  105  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1068  integrase catalytic subunit  62.5 
 
 
358 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17960  integrase family protein  62.67 
 
 
422 aa  105  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  0.82846 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22790  integrase family protein  59.72 
 
 
318 aa  99.4  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.582156  normal  0.782085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  49.14 
 
 
481 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.1 
 
 
380 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  0.259549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1833  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  67.69 
 
 
395 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.210479 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.54 
 
 
379 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  61.54 
 
 
379 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.54 
 
 
379 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  66.15 
 
 
394 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210229  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.15 
 
 
394 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60 
 
 
385 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  56 
 
 
330 aa  88.2  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  56 
 
 
330 aa  88.2  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  56 
 
 
347 aa  88.6  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  55.13 
 
 
330 aa  88.2  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  55.13 
 
 
330 aa  88.2  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  54.26 
 
 
367 aa  88.2  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1610  Integrase catalytic region  45.63 
 
 
335 aa  87  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.18 
 
 
370 aa  86.7  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.805184 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3273  Integrase catalytic region  44.66 
 
 
335 aa  86.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0797  Integrase catalytic region  44.66 
 
 
335 aa  86.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4313  integrase catalytic subunit  66.07 
 
 
309 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0419733  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0313  ATPase domain-containing protein  62.32 
 
 
363 aa  85.1  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0134516  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1334  Integrase catalytic region  43.69 
 
 
335 aa  84.3  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.661987  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3283  Integrase catalytic region  43.14 
 
 
351 aa  82.8  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3687  Integrase catalytic region  43.14 
 
 
351 aa  82.8  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.54 
 
 
379 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203937  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  41.9 
 
 
316 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  59.42 
 
 
389 aa  81.3  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  41.9 
 
 
316 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.54 
 
 
381 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748065  normal  0.851667 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  41.9 
 
 
316 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3295  integrase catalytic subunit  41.9 
 
 
316 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.54 
 
 
381 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  59.42 
 
 
389 aa  81.3  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6848  integrase catalytic subunit  52.94 
 
 
316 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  41.9 
 
 
316 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  54.41 
 
 
314 aa  80.5  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  54.41 
 
 
314 aa  80.5  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  54.41 
 
 
314 aa  80.5  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  54.41 
 
 
314 aa  80.5  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  54.41 
 
 
314 aa  80.5  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2137  integrase catalytic subunit  42.73 
 
 
315 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4445  integrase catalytic subunit  42.73 
 
 
315 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.730618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3352  integrase catalytic subunit  42.73 
 
 
315 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2560  integrase catalytic subunit  42.73 
 
 
315 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278482  decreased coverage  0.00231503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3658  integrase catalytic subunit  42.73 
 
 
315 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1990  integrase catalytic subunit  42.73 
 
 
315 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1870  integrase catalytic subunit  42.73 
 
 
315 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4504  integrase catalytic subunit  42.73 
 
 
315 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.23514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4598  integrase catalytic subunit  42.73 
 
 
315 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4025  integrase catalytic subunit  42.73 
 
 
315 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3424  integrase catalytic subunit  42.73 
 
 
315 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.821983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2654  integrase catalytic subunit  42.73 
 
 
315 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  0.067102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3207  integrase catalytic subunit  42.73 
 
 
315 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249137  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2979  integrase catalytic subunit  42.73 
 
 
315 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161528  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3394  integrase catalytic subunit  42.73 
 
 
315 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0179  integrase catalytic subunit  42.73 
 
 
315 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0485  integrase catalytic subunit  42.73 
 
 
315 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0549  integrase catalytic subunit  42.73 
 
 
315 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0673  integrase catalytic subunit  42.73 
 
 
315 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.946577 
 
 
-
 
NC_004310  BR0513  ISBm3, transposase, programmed frameshift  40.95 
 
 
313 aa  78.6  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0754  integrase catalytic subunit  37.5 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  53.16 
 
 
369 aa  77.8  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0490  transposase  47.37 
 
 
99 aa  78.2  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0088  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  57.35 
 
 
359 aa  77.8  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0287  Integrase catalytic region  35.71 
 
 
318 aa  77.4  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1133  Integrase catalytic region  35.71 
 
 
318 aa  77.4  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1036  Integrase catalytic region  35.71 
 
 
318 aa  77.4  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21500  transposase  41.82 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2597  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.016689  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.9 
 
 
369 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05300  transposase  40.54 
 
 
335 aa  75.5  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14260  transposase  39.32 
 
 
335 aa  75.9  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00196593  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03170  transposase  45.57 
 
 
320 aa  74.3  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.82 
 
 
375 aa  73.9  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.75 
 
 
460 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0353  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  55.07 
 
 
332 aa  73.6  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.56 
 
 
475 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3793  integrase catalytic subunit  52.38 
 
 
321 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338369  normal  0.128891 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4011  integrase catalytic subunit  52.38 
 
 
333 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141418  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>