More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5662 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
197 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
197 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
197 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  98.48 
 
 
197 aa  390  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  97.46 
 
 
197 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  91.37 
 
 
203 aa  359  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  91.37 
 
 
203 aa  359  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  89.34 
 
 
220 aa  357  9e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  88.32 
 
 
220 aa  352  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  84.26 
 
 
203 aa  339  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  82.91 
 
 
205 aa  334  5e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  91.11 
 
 
180 aa  324  5e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  73.6 
 
 
208 aa  292  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  67.98 
 
 
209 aa  289  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  71.28 
 
 
206 aa  282  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  70.92 
 
 
204 aa  279  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  71.43 
 
 
200 aa  276  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  65.33 
 
 
199 aa  264  7e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  65.83 
 
 
199 aa  264  8e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  70.72 
 
 
181 aa  257  8e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  62.37 
 
 
239 aa  240  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  60.82 
 
 
212 aa  236  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  64.55 
 
 
208 aa  234  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  59.79 
 
 
194 aa  227  8e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  62.9 
 
 
205 aa  226  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  62.37 
 
 
206 aa  226  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  59.6 
 
 
224 aa  224  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  58.1 
 
 
215 aa  224  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  58.69 
 
 
213 aa  224  7e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  58.5 
 
 
205 aa  222  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  56.6 
 
 
212 aa  221  7e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  57.35 
 
 
213 aa  218  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  58.29 
 
 
218 aa  218  7e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  59.09 
 
 
215 aa  217  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  52.63 
 
 
223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  56.57 
 
 
219 aa  208  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  53.81 
 
 
211 aa  206  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  53.3 
 
 
217 aa  203  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  55.1 
 
 
212 aa  202  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  58.49 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  47.6 
 
 
244 aa  179  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  45.65 
 
 
198 aa  150  8.999999999999999e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  39.49 
 
 
211 aa  144  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  40.33 
 
 
210 aa  131  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  38.38 
 
 
197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  38.14 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  37.5 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  36.87 
 
 
198 aa  122  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  39.04 
 
 
207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  37 
 
 
205 aa  117  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  37 
 
 
205 aa  117  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  34.87 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  37.69 
 
 
195 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  37.97 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  33 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3521  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  35.16 
 
 
204 aa  111  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  34.05 
 
 
206 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0616  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit III  30.56 
 
 
200 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  37.71 
 
 
283 aa  101  7e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  34.22 
 
 
292 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4602  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  31.11 
 
 
200 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.397621  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001555  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit III  34.91 
 
 
200 aa  99.8  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0654  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.96 
 
 
202 aa  99.8  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  36.57 
 
 
298 aa  99.8  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  35.26 
 
 
204 aa  99  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0770  quinol oxidase, subunit III  31.11 
 
 
200 aa  99  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0667  quinol oxidase subunit III  31.11 
 
 
200 aa  99  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0611  quinol oxidase, subunit III (cytochrome c oxidase, subunit III)  31.11 
 
 
200 aa  99  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0612  quinol oxidase, subunit III (cytochrome c oxidase, subunit III)  31.11 
 
 
200 aa  99  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0701  quinol oxidase subunit III  31.11 
 
 
200 aa  99  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.33 
 
 
204 aa  99  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0735  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  31.11 
 
 
200 aa  99  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.33 
 
 
204 aa  99  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0828  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit III  31.11 
 
 
200 aa  99  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.517619  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  34.22 
 
 
292 aa  99  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  36.61 
 
 
273 aa  98.6  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.15 
 
 
211 aa  98.2  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05493  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.5 
 
 
199 aa  98.2  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  30.85 
 
 
208 aa  97.8  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0589  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit III  30.05 
 
 
200 aa  97.8  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369089  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  33.68 
 
 
201 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0513  cytochrome c oxidase subunit III  34.32 
 
 
202 aa  97.1  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  32.95 
 
 
198 aa  96.3  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  38.31 
 
 
279 aa  96.3  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  35.33 
 
 
743 aa  96.7  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  34.72 
 
 
295 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4776  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.57 
 
 
222 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485675  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  41.09 
 
 
294 aa  96.7  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  37.5 
 
 
296 aa  96.7  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0739  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.75 
 
 
202 aa  96.3  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346867  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  33.51 
 
 
200 aa  95.9  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4852  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.92 
 
 
215 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0958681  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4335  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.43 
 
 
215 aa  94.7  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4704  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.43 
 
 
215 aa  94.7  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0566641  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.74 
 
 
209 aa  94.7  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  34.59 
 
 
204 aa  94.4  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  34.72 
 
 
295 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1142  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.23 
 
 
212 aa  94  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0473851  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1088  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.16 
 
 
205 aa  94  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000882712  hitchhiker  0.00000399844 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5106  cytochrome c oxidase, subunit III  31.82 
 
 
205 aa  94  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0670031  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>