More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5461 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0871  glycosyl transferase family protein  84.54 
 
 
815 aa  1136    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5461  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
806 aa  1619    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4192  Peptidoglycan glycosyltransferase  55.23 
 
 
950 aa  681    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495608  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
806 aa  1619    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.409444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6036  glycosyl transferase family protein  81.94 
 
 
830 aa  1169    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852412  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5372  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
806 aa  1619    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187051  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10049  bifunctional penicillin-binding protein 1A/1B ponA1: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  72.06 
 
 
821 aa  1108    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.57903  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4745  Peptidoglycan glycosyltransferase  49.93 
 
 
769 aa  607  9.999999999999999e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.21 
 
 
725 aa  451  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7034  glycosyl transferase family 51  42.3 
 
 
838 aa  443  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39340  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  39.78 
 
 
814 aa  420  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.794703 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  41.22 
 
 
695 aa  387  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5078  glycosyl transferase family protein  36.43 
 
 
979 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  36.51 
 
 
975 aa  371  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  38.01 
 
 
836 aa  364  3e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  39.94 
 
 
764 aa  342  2e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.66 
 
 
764 aa  339  9.999999999999999e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  37.64 
 
 
1065 aa  332  1e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  36.21 
 
 
1245 aa  328  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  37.33 
 
 
719 aa  326  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.73 
 
 
859 aa  324  4e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.05 
 
 
890 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.74 
 
 
1129 aa  319  1e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4955  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.31 
 
 
747 aa  318  3e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4676  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 
778 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  37.24 
 
 
724 aa  305  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  35.31 
 
 
825 aa  302  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5193  glycosyl transferase family 51  38.27 
 
 
752 aa  300  5e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272717  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1268  glycosyl transferase family 51  36.3 
 
 
1306 aa  291  4e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796636  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5918  glycosyl transferase family 51  32.94 
 
 
927 aa  290  5.0000000000000004e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3701  glycosyl transferase family 51  37.46 
 
 
803 aa  291  5.0000000000000004e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  34 
 
 
761 aa  289  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  33.58 
 
 
808 aa  283  8.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3097  putative penicillin-binding protein  33.94 
 
 
961 aa  282  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0388  glycosyl transferase family 51  33.93 
 
 
1117 aa  278  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.62292  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  33.18 
 
 
750 aa  274  5.000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  32.97 
 
 
723 aa  272  2e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  35.51 
 
 
704 aa  270  8.999999999999999e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9363  Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  32.5 
 
 
822 aa  270  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  31.92 
 
 
776 aa  267  7e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  34.01 
 
 
648 aa  266  8e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  31.58 
 
 
784 aa  263  1e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  35.13 
 
 
770 aa  263  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  30.1 
 
 
811 aa  261  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2691  glycosyl transferase family 51  34.33 
 
 
711 aa  260  8e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0728241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  35.24 
 
 
819 aa  260  8e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  32.95 
 
 
723 aa  259  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1278  membrane carboxypeptidase  31.64 
 
 
727 aa  258  3e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  34.59 
 
 
730 aa  258  4e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  34.41 
 
 
763 aa  256  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  32.43 
 
 
712 aa  255  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  34.18 
 
 
880 aa  254  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  31.86 
 
 
801 aa  251  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  32.14 
 
 
789 aa  249  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4845  glycosyl transferase family 51  30.31 
 
 
978 aa  248  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398226  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  32.12 
 
 
720 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  31.02 
 
 
735 aa  247  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  32.24 
 
 
658 aa  246  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  30.81 
 
 
661 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  32.65 
 
 
739 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1277  transglycosylase  31.8 
 
 
774 aa  243  1e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  33.22 
 
 
833 aa  242  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  32.65 
 
 
734 aa  242  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  32.08 
 
 
626 aa  241  4e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  30.48 
 
 
683 aa  241  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  32.82 
 
 
779 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  30.91 
 
 
732 aa  240  6.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  30.5 
 
 
649 aa  239  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  29.81 
 
 
755 aa  239  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  31.38 
 
 
744 aa  239  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  30.36 
 
 
905 aa  239  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  32.17 
 
 
732 aa  239  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  30.58 
 
 
683 aa  238  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  30.16 
 
 
683 aa  238  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  31.35 
 
 
712 aa  238  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  30.44 
 
 
817 aa  238  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  32.86 
 
 
761 aa  238  4e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  30 
 
 
683 aa  237  6e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  31.55 
 
 
727 aa  237  6e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  32.64 
 
 
776 aa  237  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  28.53 
 
 
806 aa  237  7e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  29.89 
 
 
734 aa  237  8e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  28.97 
 
 
683 aa  236  9e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  30.58 
 
 
683 aa  236  9e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  31.13 
 
 
710 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  31.74 
 
 
712 aa  236  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  29.84 
 
 
683 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  32.49 
 
 
722 aa  235  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  29.84 
 
 
683 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  31.7 
 
 
727 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  29.84 
 
 
683 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  32.3 
 
 
728 aa  232  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  30.57 
 
 
680 aa  232  2e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  31.11 
 
 
855 aa  232  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  30.86 
 
 
681 aa  231  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  30.18 
 
 
683 aa  230  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  30.94 
 
 
765 aa  230  7e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  32.93 
 
 
654 aa  230  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  30.63 
 
 
651 aa  230  9e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  31.19 
 
 
773 aa  229  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>