More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5399 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  100 
 
 
124 aa  254  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  100 
 
 
124 aa  254  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  99.19 
 
 
124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  83.06 
 
 
124 aa  221  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  81.3 
 
 
125 aa  213  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  79.67 
 
 
125 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  67.21 
 
 
122 aa  174  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  61.67 
 
 
123 aa  158  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  67.59 
 
 
122 aa  157  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  63.48 
 
 
117 aa  155  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  55 
 
 
125 aa  155  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  61.74 
 
 
126 aa  155  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  59.48 
 
 
120 aa  154  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  57.14 
 
 
120 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  60.48 
 
 
123 aa  153  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  60.16 
 
 
123 aa  153  7e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  58.62 
 
 
124 aa  152  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  65.55 
 
 
126 aa  151  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  55.65 
 
 
154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  58.26 
 
 
126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  60.16 
 
 
143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  56.1 
 
 
123 aa  150  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  57.38 
 
 
125 aa  150  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  57.98 
 
 
130 aa  149  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  67.59 
 
 
121 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  67.59 
 
 
121 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  59.83 
 
 
121 aa  149  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  58.33 
 
 
123 aa  149  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  67.59 
 
 
121 aa  148  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  57.63 
 
 
120 aa  148  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  57.14 
 
 
126 aa  148  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  55.37 
 
 
131 aa  147  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  55 
 
 
123 aa  147  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  59.68 
 
 
130 aa  146  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  55.65 
 
 
125 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  55.08 
 
 
131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  52.89 
 
 
123 aa  145  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  52.89 
 
 
123 aa  145  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  51.67 
 
 
131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  57.14 
 
 
139 aa  142  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  54.03 
 
 
140 aa  142  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  52.89 
 
 
132 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  52.89 
 
 
132 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  50 
 
 
124 aa  141  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  55.17 
 
 
123 aa  140  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  61.86 
 
 
120 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  50.43 
 
 
127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  56.03 
 
 
137 aa  138  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  56.9 
 
 
122 aa  137  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  61.11 
 
 
123 aa  136  7.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  47.97 
 
 
126 aa  136  7.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  51.26 
 
 
122 aa  136  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  59.66 
 
 
120 aa  135  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  52.68 
 
 
153 aa  131  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  52.59 
 
 
149 aa  130  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  55.56 
 
 
120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  55.45 
 
 
123 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  46.34 
 
 
125 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  43.97 
 
 
123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  54.17 
 
 
120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  36.44 
 
 
120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11498  thioredoxin trxA  45.71 
 
 
124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000146148  normal  0.118625 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  36.44 
 
 
120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  48.04 
 
 
124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  46.53 
 
 
113 aa  106  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1185  thioredoxin-related  38.14 
 
 
121 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0751428  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1828  thioredoxin-related  39.29 
 
 
124 aa  101  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00237221  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  38.32 
 
 
121 aa  100  8e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  47.47 
 
 
140 aa  99.4  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  38.32 
 
 
121 aa  99.4  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  41.75 
 
 
135 aa  92.4  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  42.57 
 
 
178 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  44.33 
 
 
162 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  42.42 
 
 
140 aa  89  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  45.92 
 
 
170 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  45.1 
 
 
170 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  45.92 
 
 
170 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  48.78 
 
 
139 aa  88.2  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  45.92 
 
 
170 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0397  thioredoxin  43.48 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  47.83 
 
 
106 aa  87.4  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0588  thioredoxin  39.25 
 
 
141 aa  87  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.99153  normal  0.710013 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  47.56 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  47.56 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  47.56 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  47.56 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  47.56 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  47.56 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  47.56 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  45.92 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  45.92 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  41.05 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  40.52 
 
 
289 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  40.52 
 
 
289 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  47.56 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  47.56 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  42.57 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  36.36 
 
 
104 aa  85.5  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  43.48 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  49.06 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>