151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5370 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  100 
 
 
202 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5281  BioY protein  100 
 
 
202 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5370  BioY protein  100 
 
 
202 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  81.22 
 
 
205 aa  308  3e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  81.62 
 
 
201 aa  297  8e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  65.62 
 
 
208 aa  224  8e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  49.46 
 
 
210 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  36.17 
 
 
191 aa  120  2e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  40.64 
 
 
224 aa  115  4e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  35.64 
 
 
191 aa  114  8e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  7.0307e-10  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  35.71 
 
 
191 aa  113  2e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.66456e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  43.18 
 
 
187 aa  111  7e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2314  hypothetical protein  50.27 
 
 
222 aa  110  1e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.462217  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  42.7 
 
 
187 aa  110  2e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  35.91 
 
 
191 aa  108  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  4.23922e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  35.91 
 
 
191 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  42.27 
 
 
207 aa  108  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  35.36 
 
 
191 aa  107  9e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  35.36 
 
 
191 aa  107  9e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.18504e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  35.36 
 
 
191 aa  107  9e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  5.93466e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  34.57 
 
 
191 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  38.55 
 
 
197 aa  106  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  36.46 
 
 
191 aa  105  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5454  BioY protein  46.15 
 
 
215 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0263826  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  39.06 
 
 
212 aa  99.8  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  37.02 
 
 
189 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  44.26 
 
 
202 aa  99.4  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  44 
 
 
180 aa  98.2  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  35.57 
 
 
216 aa  96.7  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1193  biotin transport protein BioY  37.57 
 
 
184 aa  95.1  6e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  41.71 
 
 
189 aa  92.8  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  42.22 
 
 
188 aa  92.8  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  37.79 
 
 
192 aa  92  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  32.49 
 
 
231 aa  92  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  39.26 
 
 
179 aa  90.9  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20560  hypothetical protein  39.8 
 
 
221 aa  90.5  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  38.12 
 
 
192 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  34.76 
 
 
184 aa  87.8  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  40.88 
 
 
225 aa  87.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  40 
 
 
199 aa  86.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  37.58 
 
 
187 aa  84.3  1e-15  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  34.68 
 
 
182 aa  83.6  2e-15  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  3.03529e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  37.14 
 
 
187 aa  83.6  2e-15  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  33.33 
 
 
184 aa  82.8  3e-15  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  33.33 
 
 
184 aa  82.8  3e-15  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1540  BioY protein  40 
 
 
194 aa  82.4  5e-15  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  35.84 
 
 
180 aa  82  5e-15  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  31.03 
 
 
184 aa  82  6e-15  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.66759e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  31.32 
 
 
189 aa  81.3  9e-15  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2319  BioY protein  41.95 
 
 
194 aa  81.3  1e-14  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3386  BioY protein  39.04 
 
 
182 aa  80.5  1e-14  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.812512  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  32.94 
 
 
179 aa  80.5  2e-14  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  9.49175e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  31.21 
 
 
187 aa  79.3  3e-14  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0501  BioY protein  37.85 
 
 
187 aa  78.2  7e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0382459  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5033  BioY protein  43.32 
 
 
191 aa  78.2  9e-14  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0733  BioY protein  31.87 
 
 
190 aa  74.7  8e-13  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.307469  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  39.19 
 
 
179 aa  73.6  2e-12  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  34.41 
 
 
203 aa  72.4  4e-12  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  4.63296e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0845  BioY protein  42.93 
 
 
181 aa  72  6e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2173  hypothetical protein  44.2 
 
 
181 aa  70.9  1e-11  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3071  BioY protein  43.68 
 
 
204 aa  70.5  1e-11  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01740  hypothetical protein  42.66 
 
 
204 aa  69.3  4e-11  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.770223 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  33.85 
 
 
187 aa  69.3  4e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4652  BioY protein  58.24 
 
 
198 aa  68.6  6e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.113128  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  34.74 
 
 
189 aa  67.8  1e-10  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  34.66 
 
 
197 aa  67.8  1e-10  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  33.53 
 
 
169 aa  67  2e-10  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  37.23 
 
 
197 aa  66.6  2e-10  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  29.94 
 
 
182 aa  67  2e-10  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  33.53 
 
 
169 aa  67  2e-10  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  34.35 
 
 
178 aa  65.9  4e-10  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  34.18 
 
 
189 aa  64.3  1e-09  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  28.34 
 
 
182 aa  63.9  1e-09  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.2911e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  48.19 
 
 
182 aa  63.5  2e-09  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0185  bioY family protein  29.78 
 
 
197 aa  63.9  2e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  28.65 
 
 
197 aa  63.2  3e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.01818e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  30 
 
 
197 aa  63.2  3e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  36.57 
 
 
192 aa  62.8  4e-09  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5049  bioY family protein  28.8 
 
 
197 aa  62.4  4e-09  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  29.07 
 
 
179 aa  62.4  4e-09  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  29.21 
 
 
197 aa  62.4  5e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  30.1 
 
 
216 aa  62  6e-09  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3254e-06 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  30.46 
 
 
169 aa  60.5  1e-08  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  29.03 
 
 
197 aa  60.1  2e-08  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  3.60294e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  29.03 
 
 
197 aa  60.1  2e-08  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  30.94 
 
 
198 aa  60.1  2e-08  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  41.59 
 
 
169 aa  60.1  2e-08  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  30.64 
 
 
182 aa  59.3  3e-08  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  29.79 
 
 
192 aa  59.3  3e-08  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  2.69732e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  48.05 
 
 
205 aa  59.7  3e-08  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4649  biotin synthesis BioY protein  29.03 
 
 
197 aa  58.9  4e-08  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.12597e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  28.65 
 
 
197 aa  58.9  4e-08  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5028  bioY family protein  28.65 
 
 
197 aa  58.9  4e-08  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  31.25 
 
 
179 aa  59.3  4e-08  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  1.4315e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  29.63 
 
 
187 aa  58.5  6e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  9.89963e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  28.73 
 
 
182 aa  58.5  7e-08  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  9.40294e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  38.6 
 
 
202 aa  58.2  9e-08  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  9.12957e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  43.75 
 
 
180 aa  57.4  1e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  38.89 
 
 
201 aa  57.4  1e-07  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  30.77 
 
 
175 aa  57  2e-07  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>