More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5111 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  100 
 
 
271 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  100 
 
 
271 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  99.26 
 
 
271 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  81.65 
 
 
270 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  80.45 
 
 
267 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13847  hypothetical protein  75.46 
 
 
273 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.320421 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0158  Cof-like hydrolase  56.88 
 
 
277 aa  296  2e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0193  Cof-like hydrolase  57.2 
 
 
277 aa  287  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  49.82 
 
 
273 aa  256  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  47.41 
 
 
278 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0293  Cof-like hydrolase  41.04 
 
 
268 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4318  Cof protein  41.04 
 
 
264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.873657 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0228  Cof-like hydrolase  40.89 
 
 
272 aa  180  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0111  Cof-like hydrolase  39.19 
 
 
272 aa  175  8e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0277  Cof-like hydrolase  40.6 
 
 
259 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  40.75 
 
 
281 aa  171  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07610  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.08 
 
 
265 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0517229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0144  phosphatase YbhA  39.49 
 
 
265 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101549  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  42.8 
 
 
290 aa  162  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0126  Cof-like hydrolase  37 
 
 
285 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0074  HAD-superfamily hydrolase  36.92 
 
 
269 aa  155  8e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.542278  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  38.35 
 
 
264 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1954  Cof-like hydrolase  42.12 
 
 
274 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5588  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase type 3  37.28 
 
 
272 aa  152  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16228  normal  0.729842 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0280  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.06 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0560  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.46 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.67 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452319  hitchhiker  0.00105022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4106  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.09 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.607815  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  30.4 
 
 
267 aa  126  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0505  Cof-like hydrolase  37.81 
 
 
303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.930441  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.27 
 
 
282 aa  125  5e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4525  Cof-like hydrolase  37.13 
 
 
273 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  30.88 
 
 
281 aa  122  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  28.11 
 
 
273 aa  122  8e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  31.18 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3183  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.73 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0375981 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0279  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.13 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.333001  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0141  Cof-like hydrolase  35.34 
 
 
284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3241  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.96 
 
 
274 aa  119  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01160  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.34 
 
 
269 aa  119  6e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  30.82 
 
 
276 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0299  Cof-like hydrolase  34.7 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5035  HAD family hydrolase  36.63 
 
 
273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2937  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  36.06 
 
 
261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0182848  hitchhiker  0.000402295 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  29.45 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0175  HAD family hydrolase  32.14 
 
 
282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6169  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  35.34 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  28.73 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0380  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.19 
 
 
295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.890791 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  26.16 
 
 
274 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  30.07 
 
 
273 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  30.26 
 
 
268 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.44 
 
 
261 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00675343  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  30.88 
 
 
271 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01700  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.07 
 
 
275 aa  106  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.616457 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  28.25 
 
 
273 aa  106  4e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  30.29 
 
 
267 aa  106  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  27.27 
 
 
273 aa  106  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  27.24 
 
 
279 aa  105  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01730  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.08 
 
 
311 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  29.2 
 
 
269 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  29.37 
 
 
271 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  28.62 
 
 
268 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1400  HAD superfamily hydrolase  30.66 
 
 
272 aa  103  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  29.09 
 
 
269 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  28.78 
 
 
270 aa  103  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6168  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  31.07 
 
 
268 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  29.63 
 
 
269 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  27.8 
 
 
274 aa  103  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  29.09 
 
 
269 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  23.13 
 
 
269 aa  102  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  28.89 
 
 
269 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  28.89 
 
 
269 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  28.89 
 
 
269 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  28.89 
 
 
269 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.89 
 
 
269 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.89 
 
 
269 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06840  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.69 
 
 
288 aa  102  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.324919  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  25.67 
 
 
279 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  28.21 
 
 
268 aa  102  8e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  29.09 
 
 
269 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  28.52 
 
 
269 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  29.03 
 
 
279 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  30.47 
 
 
281 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  25.5 
 
 
279 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1678  HAD superfamily hydrolase  28.62 
 
 
460 aa  100  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  29.67 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  25.61 
 
 
274 aa  99.8  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  25.61 
 
 
274 aa  99.8  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  30.11 
 
 
281 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  29.23 
 
 
273 aa  99.4  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.23 
 
 
273 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  29.23 
 
 
273 aa  99.4  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  30.11 
 
 
281 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  29.23 
 
 
273 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  29.23 
 
 
273 aa  99.4  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0414  Cof-like hydrolase  26.1 
 
 
268 aa  99  7e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0522924  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.63 
 
 
269 aa  99  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  29.62 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0156  Cof-like hydrolase  31.21 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.937674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>