More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4712 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1549  acyl-CoA synthetase  70.36 
 
 		 512 aa  712    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00257603  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4624  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 500 aa  1007    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13540  acyl-CoA synthetase  69.22 
 
 		 502 aa  688    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.55264e-46  hitchhiker  0.0000144188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5007  acyl-CoA synthetase  87.03 
 
 		 501 aa  857    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223508  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4712  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 500 aa  1007    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5208  acyl-CoA synthetase  73.25 
 
 		 503 aa  679    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3957  AMP-dependent synthetase and ligase  57.23 
 
 		 518 aa  503  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4341  acyl-CoA synthetase  51.79 
 
 		 526 aa  479  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227386  normal  0.0335846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3835  AMP-dependent synthetase and ligase  50.39 
 
 		 532 aa  472  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11768  acyl-CoA synthetase  52.09 
 
 		 532 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365626 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2305  acyl-CoA synthetase  50.7 
 
 		 525 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.918677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3877  acyl-CoA synthetase  53.16 
 
 		 527 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.133257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3891  acyl-CoA synthetase  53.16 
 
 		 527 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3965  acyl-CoA synthetase  53.16 
 
 		 527 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.551618  normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3512  AMP-dependent synthetase and ligase  47.54 
 
 		 539 aa  426  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5900  acyl-CoA synthetase  47.95 
 
 		 543 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8199  AMP-dependent synthetase and ligase  45.04 
 
 		 522 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3484  AMP-dependent synthetase and ligase  42.08 
 
 		 551 aa  362  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.436889  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1548  acyl-CoA synthetase  42.89 
 
 		 557 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0453148  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5209  acyl-CoA synthetase  43.56 
 
 		 554 aa  345  8.999999999999999e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0206  acyl-CoA synthetase  44.68 
 
 		 549 aa  340  2.9999999999999998e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0112  AMP-dependent synthetase and ligase  34.57 
 
 		 572 aa  228  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0040  AMP-dependent synthetase and ligase  33.19 
 
 		 708 aa  208  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3316  long-chain-acyl-CoA synthetase  35.23 
 
 		 608 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390941  hitchhiker  0.0000571786 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2118  AMP-dependent synthetase and ligase  30.85 
 
 		 613 aa  183  7e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000346834  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1300  DitJ-like CoA ligase  29.88 
 
 		 547 aa  176  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11230  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.87 
 
 		 597 aa  172  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0151554  normal  0.367156 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2688  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.65 
 
 		 534 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.204709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2709  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.65 
 
 		 534 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.710965  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1103  long-chain-acyl-CoA synthetase  33.25 
 
 		 630 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 		 525 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3338  long-chain-acyl-CoA synthetase  34.46 
 
 		 593 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2809  long-chain-acyl-CoA synthetase  27.92 
 
 		 609 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4035  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  32.77 
 
 		 517 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.948769  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  27.12 
 
 		 662 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  30.05 
 
 		 532 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1832  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.88 
 
 		 537 aa  160  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.603335 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  29.78 
 
 		 520 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  32.49 
 
 		 552 aa  159  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3639  AMP-dependent synthetase and ligase  28.73 
 
 		 512 aa  159  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.917263  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2150  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.33 
 
 		 621 aa  159  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  29.57 
 
 		 509 aa  159  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  29.59 
 
 		 503 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4510  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.02 
 
 		 601 aa  159  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  33.24 
 
 		 487 aa  157  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0832  AMP-dependent synthetase and ligase  30.99 
 
 		 551 aa  157  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4007  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.37 
 
 		 592 aa  156  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.657785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4081  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.37 
 
 		 592 aa  156  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0876602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4237  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.37 
 
 		 592 aa  156  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.168634 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2757  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.85 
 
 		 538 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679806  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3258  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.32 
 
 		 545 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1000  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.77 
 
 		 622 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4204  AMP-dependent synthetase and ligase  27.86 
 
 		 533 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0576  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  31.05 
 
 		 516 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1508  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  33.43 
 
 		 535 aa  153  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4318  long-chain-acyl-CoA synthetase  33.16 
 
 		 592 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3226  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  32.01 
 
 		 517 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4608  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  30.02 
 
 		 550 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05192  long-chain fatty acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07270)  28.65 
 
 		 723 aa  152  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.311287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  30.84 
 
 		 521 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  28.86 
 
 		 498 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6217  AMP-dependent synthetase and ligase  27.94 
 
 		 546 aa  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1150  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.59 
 
 		 509 aa  151  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.794043  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1645  long-chain-acyl-CoA synthetase  29.2 
 
 		 600 aa  150  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  29.21 
 
 		 504 aa  150  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  30.55 
 
 		 512 aa  149  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4383  AMP-dependent synthetase and ligase  28.48 
 
 		 553 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.647475 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.16 
 
 		 514 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3832  AMP-dependent synthetase and ligase  29.02 
 
 		 509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2673  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  32.51 
 
 		 518 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5072  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.19 
 
 		 605 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0947195  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  28.79 
 
 		 495 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1473  AMP-dependent synthetase and ligase  29.48 
 
 		 536 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4281  AMP-dependent synthetase and ligase  32.07 
 
 		 524 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3540  long-chain-acyl-CoA synthetase  32.11 
 
 		 596 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.498772 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0702  putative acyl-CoA synthetase  28.4 
 
 		 553 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345543  normal  0.0324755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4801  hypothetical protein  28.81 
 
 		 2167 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.97 
 
 		 491 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2202  AMP-dependent synthetase and ligase  27.49 
 
 		 525 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2261  long-chain-acyl-CoA synthetase  32.69 
 
 		 608 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.982772  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  29.11 
 
 		 506 aa  145  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  27.48 
 
 		 552 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2185  long-chain-acyl-CoA synthetase  29.32 
 
 		 600 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00664297  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  30.83 
 
 		 505 aa  144  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5067  long-chain-acyl-CoA synthetase  29.88 
 
 		 610 aa  143  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.7 
 
 		 517 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4606  long-chain-acyl-CoA synthetase  30.35 
 
 		 610 aa  143  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.515883  normal  0.042259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  31.41 
 
 		 549 aa  143  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  29.59 
 
 		 511 aa  143  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0077  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.7 
 
 		 517 aa  143  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0079  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.25 
 
 		 517 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.187597  normal  0.982419 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2884  AMP-dependent synthetase and ligase  30.72 
 
 		 807 aa  142  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.17736  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26640  long-chain-acyl-CoA synthetase  32.42 
 
 		 608 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06649  very-long-chain acyl-CoA synthetase family protein (CefD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03630)  29.59 
 
 		 710 aa  141  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0078  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  27.67 
 
 		 517 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  27.67 
 
 		 517 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.672086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2100  AMP-dependent synthetase and ligase  27.9 
 
 		 526 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.467333 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  28.63 
 
 		 585 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2696  long-chain-acyl-CoA synthetase  33.15 
 
 		 608 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.22324 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  31.01 
 
 		 521 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>