90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4689 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4984  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 
240 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.990283 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4689  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 
240 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.969168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4601  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 
240 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1572  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  69.17 
 
 
241 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615405  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5184  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  73.28 
 
 
232 aa  294  9e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3210  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.15 
 
 
237 aa  191  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.924727  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4922  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  58.62 
 
 
295 aa  178  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102122  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4709  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  57.72 
 
 
240 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1865  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40 
 
 
254 aa  164  8e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1217  hypothetical protein  47.03 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  42.55 
 
 
251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0494  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50 
 
 
222 aa  161  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462994  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0483  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50 
 
 
222 aa  161  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0505  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50 
 
 
222 aa  161  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0593  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  55.63 
 
 
244 aa  161  8.000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1563  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.89 
 
 
234 aa  159  5e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  40 
 
 
200 aa  155  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0120  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.26 
 
 
212 aa  154  9e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.391115  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0119  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.62 
 
 
147 aa  154  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4318  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.17 
 
 
225 aa  150  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.531167  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13140  hypothetical protein  38.71 
 
 
262 aa  148  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4237  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.34 
 
 
469 aa  146  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3967  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.72 
 
 
246 aa  132  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5312  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.62 
 
 
232 aa  132  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0232  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40.34 
 
 
198 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.37 
 
 
225 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0343994  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4106  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  41.67 
 
 
208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.875742  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1636  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.13 
 
 
237 aa  109  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2034  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.36 
 
 
241 aa  108  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4562  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.58 
 
 
306 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.45 
 
 
185 aa  95.1  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4285  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.61 
 
 
405 aa  82.4  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  30.15 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.262475 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3792  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding:carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.5 
 
 
390 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100636  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  29.66 
 
 
1027 aa  79  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  27.11 
 
 
208 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3140  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.22 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0169757  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2945  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.87 
 
 
182 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0435616  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.57 
 
 
182 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.128419  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0646  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.28 
 
 
405 aa  65.9  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28 
 
 
157 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4550  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.25 
 
 
227 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735777  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1056  hypothetical protein  28.9 
 
 
241 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184946  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5697  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  30.07 
 
 
400 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407946 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.1 
 
 
193 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.85 
 
 
155 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.08 
 
 
182 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0023  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.92 
 
 
152 aa  55.5  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.17 
 
 
241 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.27 
 
 
216 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.09 
 
 
147 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  28.38 
 
 
148 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5832  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  28.47 
 
 
399 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671661  hitchhiker  0.00379539 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0298  hypothetical protein  29.79 
 
 
150 aa  53.5  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.34 
 
 
148 aa  53.1  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0284  hypothetical protein  29.79 
 
 
150 aa  53.1  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.67 
 
 
151 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.88 
 
 
198 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  27.39 
 
 
161 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.4 
 
 
249 aa  52  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.67 
 
 
197 aa  52  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.67 
 
 
153 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.03 
 
 
148 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.81 
 
 
156 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.75 
 
 
155 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.74 
 
 
154 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1445  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.08 
 
 
158 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.101992  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1176  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.82 
 
 
144 aa  51.2  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.551592 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1283  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.08 
 
 
158 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.112632  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.61 
 
 
154 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.35 
 
 
154 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0368  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.36 
 
 
152 aa  49.3  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1598  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.34 
 
 
204 aa  48.9  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.08 
 
 
152 aa  48.9  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000000688113  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.31 
 
 
187 aa  48.5  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  26.21 
 
 
232 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.78 
 
 
202 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.81 
 
 
158 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.34 
 
 
213 aa  47  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8407  hypothetical protein  28.99 
 
 
279 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.795849  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2253  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.65 
 
 
243 aa  45.8  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.85 
 
 
151 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.85 
 
 
151 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2661  putative carbon monoxide dehydrogenase  25 
 
 
176 aa  45.8  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0213  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.79 
 
 
154 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6656  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.76 
 
 
222 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.33 
 
 
254 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3719  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  27.33 
 
 
983 aa  43.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2694  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.07 
 
 
153 aa  43.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0998879  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0168  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.64 
 
 
220 aa  42.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>