More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4551 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4847  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 
370 aa  739    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599568  normal  0.0428667 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10901  phosphoserine aminotransferase  83.47 
 
 
376 aa  634    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1718  phosphoserine aminotransferase  88.14 
 
 
395 aa  671    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017199  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4464  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 
370 aa  739    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4551  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 
370 aa  739    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.413402  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5033  phosphoserine aminotransferase  86.25 
 
 
371 aa  657    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621605  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0847  phosphoserine aminotransferase  74.18 
 
 
374 aa  567  1e-161  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0514  phosphoserine aminotransferase  71.74 
 
 
377 aa  547  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238654  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1258  phosphoserine aminotransferase  69.33 
 
 
381 aa  547  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4709  phosphoserine aminotransferase  71.27 
 
 
375 aa  540  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1004  Phosphoserine aminotransferase-like protein  67.65 
 
 
369 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33860  phosphoserine aminotransferase  68.11 
 
 
376 aa  531  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0832  phosphoserine aminotransferase  68.19 
 
 
370 aa  529  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.588102  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04180  phosphoserine aminotransferase  67.03 
 
 
375 aa  510  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305971  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0829  phosphoserine aminotransferase  67.66 
 
 
370 aa  503  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726132  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0246  phosphoserine aminotransferase  63.98 
 
 
373 aa  501  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132433  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4171  phosphoserine aminotransferase  67.57 
 
 
376 aa  502  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309749  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0325  phosphoserine aminotransferase  68.94 
 
 
372 aa  501  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0459701 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8790  phosphoserine aminotransferase  63.98 
 
 
373 aa  495  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0519  phosphoserine aminotransferase  64.15 
 
 
370 aa  496  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.300823  normal  0.0573772 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0910  phosphoserine aminotransferase  65.04 
 
 
376 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.412993 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0114  phosphoserine aminotransferase  62.97 
 
 
377 aa  488  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0793  phosphoserine aminotransferase  63.34 
 
 
376 aa  484  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7228  phosphoserine aminotransferase  65.41 
 
 
374 aa  479  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0082  phosphoserine aminotransferase  62.6 
 
 
374 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1990  phosphoserine aminotransferase  59.78 
 
 
372 aa  459  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30790  phosphoserine aminotransferase  65.12 
 
 
378 aa  457  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.514499  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0730  phosphoserine aminotransferase  63.78 
 
 
374 aa  457  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.835116  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0422  phosphoserine aminotransferase  60.43 
 
 
417 aa  442  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0510  phosphoserine aminotransferase  60.43 
 
 
375 aa  443  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00655495  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0771  phosphoserine aminotransferase  60.05 
 
 
393 aa  429  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13530  phosphoserine aminotransferase  57.88 
 
 
387 aa  429  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39837  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3591  phosphoserine aminotransferase  60.05 
 
 
385 aa  428  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.465609  normal  0.244351 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2846  phosphoserine aminotransferase  58.62 
 
 
379 aa  421  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0557  phosphoserine aminotransferase  59.03 
 
 
369 aa  419  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6132  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1783  phosphoserine aminotransferase  56.38 
 
 
380 aa  411  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1532  phosphoserine aminotransferase  55.98 
 
 
382 aa  408  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0880  phosphoserine aminotransferase  58.81 
 
 
378 aa  401  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00411134  normal  0.22946 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0020  aminotransferase class V  39.67 
 
 
373 aa  266  5.999999999999999e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0711  phosphoserine transaminase  28.17 
 
 
383 aa  137  4e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000109089 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  27.2 
 
 
375 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1088  Alanine--glyoxylate transaminase  28.77 
 
 
370 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110462  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1381  phosphoserine aminotransferase  27.84 
 
 
391 aa  105  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.705513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2434  aminotransferase class V  29.75 
 
 
338 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4691  aminotransferase class V  26.84 
 
 
357 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439088  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1073  aminotransferase class V  26.43 
 
 
363 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.662635  normal  0.844475 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1759  phosphoserine aminotransferase  27.54 
 
 
390 aa  103  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2704  phosphoserine aminotransferase  27.37 
 
 
346 aa  100  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0995  phosphoserine aminotransferase  25.42 
 
 
361 aa  100  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1118  phosphoserine aminotransferase  26.93 
 
 
390 aa  99.4  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.837238  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1332  phosphoserine aminotransferase  24.73 
 
 
371 aa  99.4  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0019  phosphoserine aminotransferase  28.65 
 
 
385 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.625481  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0670  phosphoserine aminotransferase  26.53 
 
 
391 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.786402  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1351  phosphoserine aminotransferase  28.65 
 
 
385 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3162  phosphoserine aminotransferase  27.84 
 
 
390 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  27.12 
 
 
370 aa  98.6  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0638  phosphoserine aminotransferase  26.33 
 
 
391 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.612941  normal  0.204061 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0059  aminotransferase class V  26.37 
 
 
370 aa  97.4  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5460  phosphoserine aminotransferase  27.66 
 
 
385 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4686  phosphoserine aminotransferase  27.68 
 
 
385 aa  97.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0966475  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0260  phosphoserine aminotransferase  29 
 
 
389 aa  96.7  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4790  phosphoserine aminotransferase  26.96 
 
 
390 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3906  phosphoserine aminotransferase  25.77 
 
 
389 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42458  phosphoserine transaminase  26.4 
 
 
409 aa  95.9  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.809086  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1876  aminotransferase class V  27.66 
 
 
373 aa  95.9  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.544025  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  25.48 
 
 
360 aa  95.9  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1203  phosphoserine aminotransferase  27.39 
 
 
391 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.509685  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2651  phosphoserine aminotransferase  28.2 
 
 
396 aa  95.1  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.311061  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  28.22 
 
 
357 aa  94.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2679  phosphoserine aminotransferase  28.27 
 
 
379 aa  94.4  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0617  phosphoserine aminotransferase  27.47 
 
 
376 aa  93.6  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0555  phosphoserine aminotransferase  25.25 
 
 
410 aa  93.6  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0659  phosphoserine aminotransferase  26.26 
 
 
391 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.381901 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3596  phosphoserine aminotransferase  26.22 
 
 
392 aa  93.2  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2969  phosphoserine aminotransferase  25.33 
 
 
390 aa  92  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  27.3 
 
 
357 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1314  phosphoserine aminotransferase  26.61 
 
 
390 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4107  phosphoserine aminotransferase  25.59 
 
 
390 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5113  aminotransferase class V  28.29 
 
 
352 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0009  phosphoserine aminotransferase  27.86 
 
 
385 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00470966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2619  phosphoserine aminotransferase  25.93 
 
 
392 aa  90.1  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.790284  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0508  phosphoserine aminotransferase  23.8 
 
 
374 aa  89  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.957618  normal  0.349025 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1104  phosphoserine aminotransferase  27.13 
 
 
384 aa  88.2  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3020  phosphoserine aminotransferase  26.15 
 
 
381 aa  88.2  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3193  phosphoserine aminotransferase  25.77 
 
 
392 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6961  phosphoserine aminotransferase  26.26 
 
 
399 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1825  phosphoserine aminotransferase  25.4 
 
 
390 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1687  phosphoserine aminotransferase  27.2 
 
 
391 aa  87  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1631  phosphoserine aminotransferase  27.2 
 
 
391 aa  87  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  26.92 
 
 
357 aa  87  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3625  phosphoserine aminotransferase  26.47 
 
 
389 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0111727 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1270  phosphoserine aminotransferase  25.78 
 
 
390 aa  85.5  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.722575  normal  0.0220026 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  26.9 
 
 
356 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3487  phosphoserine aminotransferase  25.58 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.146301 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6395  phosphoserine aminotransferase  26.44 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0702265  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1171  phosphoserine aminotransferase  26.11 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0861672  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6799  phosphoserine aminotransferase  26.18 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1294  phosphoserine aminotransferase  22.55 
 
 
370 aa  84  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.303177  normal  0.291609 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  27.17 
 
 
356 aa  84  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4468  phosphoserine aminotransferase  25.19 
 
 
395 aa  84  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0805419  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>