More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4446 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  100 
 
 
317 aa  618  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
317 aa  618  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  99.05 
 
 
317 aa  609  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  70.96 
 
 
309 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  70.3 
 
 
309 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  50.16 
 
 
346 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  48.81 
 
 
311 aa  251  8.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  48.14 
 
 
303 aa  244  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  46.69 
 
 
316 aa  240  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  46.53 
 
 
335 aa  239  5e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  46.05 
 
 
334 aa  237  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  46.15 
 
 
303 aa  230  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  47.81 
 
 
317 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  44.19 
 
 
329 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  44.92 
 
 
306 aa  215  8e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  44.33 
 
 
316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  45.93 
 
 
310 aa  212  7.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  44.11 
 
 
326 aa  208  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  44.82 
 
 
300 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  43.41 
 
 
316 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  47.27 
 
 
328 aa  204  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  42.67 
 
 
317 aa  202  8e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  41.18 
 
 
332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0424  ribokinase-like domain-containing protein  42.9 
 
 
333 aa  193  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.808327  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  42.43 
 
 
306 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  40.85 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  39.93 
 
 
326 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  38.91 
 
 
306 aa  162  9e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  39.61 
 
 
309 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  36.25 
 
 
321 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  38.44 
 
 
320 aa  153  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  38.02 
 
 
308 aa  152  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  40.45 
 
 
322 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  35.74 
 
 
308 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  36.57 
 
 
306 aa  145  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  37.38 
 
 
306 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  37.34 
 
 
311 aa  144  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  35.08 
 
 
308 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  36.89 
 
 
312 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  37.54 
 
 
314 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  37.38 
 
 
306 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  37.86 
 
 
320 aa  142  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  37.38 
 
 
312 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  32.67 
 
 
315 aa  142  7e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  36.25 
 
 
316 aa  142  9e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  37.25 
 
 
306 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  38.56 
 
 
308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  36.22 
 
 
315 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  36.33 
 
 
317 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  35.2 
 
 
309 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  33.77 
 
 
308 aa  139  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7036  fructokinase  45.85 
 
 
251 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  38.04 
 
 
312 aa  139  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  35.41 
 
 
308 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  30.62 
 
 
319 aa  135  7.000000000000001e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  35.5 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  33.77 
 
 
308 aa  134  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  33.77 
 
 
308 aa  133  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  35.53 
 
 
313 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  36.92 
 
 
315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  35.06 
 
 
310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  35.28 
 
 
312 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  35.39 
 
 
310 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  34.74 
 
 
321 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  34.67 
 
 
306 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  34.53 
 
 
338 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  32.23 
 
 
307 aa  123  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  37.83 
 
 
312 aa  122  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  34.63 
 
 
312 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  33.66 
 
 
322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  28.75 
 
 
323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  39.81 
 
 
315 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  34.04 
 
 
323 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  32.81 
 
 
319 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  31.75 
 
 
319 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  32.27 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  35.25 
 
 
316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  34.21 
 
 
316 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  33.82 
 
 
314 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  29.13 
 
 
323 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  30.42 
 
 
306 aa  107  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  31.48 
 
 
304 aa  106  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  27.6 
 
 
319 aa  105  9e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  34.21 
 
 
316 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  29.43 
 
 
333 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  31.48 
 
 
304 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  29.14 
 
 
333 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  25.81 
 
 
322 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3202  PfkB  33.64 
 
 
344 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  25.49 
 
 
315 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  28.46 
 
 
315 aa  99.8  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  35.82 
 
 
316 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  28.46 
 
 
315 aa  99.8  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  30.45 
 
 
317 aa  99.4  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  33.66 
 
 
298 aa  99  9e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  30.15 
 
 
337 aa  98.6  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  26.14 
 
 
315 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  28.44 
 
 
321 aa  99  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2601  ribokinase-like domain-containing protein  33.98 
 
 
332 aa  97.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000338156  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  32.55 
 
 
298 aa  96.7  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>