More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4443 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4737  extracellular solute-binding protein  97.36 
 
 		 455 aa  883    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 455 aa  932    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 455 aa  932    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  56.7 
 
 		 452 aa  503  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5309  extracellular solute-binding protein family 1  48 
 
 		 447 aa  401  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574903  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2796  extracellular solute-binding protein family 1  47.99 
 
 		 468 aa  396  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0720  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  49.42 
 
 		 440 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000241977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  49.18 
 
 		 440 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  45.94 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3777  extracellular solute-binding protein  48.05 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.253936  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0490  extracellular solute-binding protein  49.39 
 
 		 440 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000283806  hitchhiker  0.00214005 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0303  extracellular solute-binding protein family 1  48.11 
 
 		 478 aa  387  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1711  extracellular solute-binding protein family 1  47.87 
 
 		 450 aa  382  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.827618 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0158  extracellular solute-binding protein family 1  45.6 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.317406 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5926  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  49.25 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1985  extracellular solute-binding protein  49.38 
 
 		 441 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0378619  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2619  extracellular solute-binding protein  49.38 
 
 		 441 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2595  extracellular solute-binding protein  49.38 
 
 		 441 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13364  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  44.95 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0333  maltose/mannitol ABC transporter, periplasmic maltose/mannitol-binding protein, putative  49.01 
 
 		 442 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00410857  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1034  extracellular solute-binding protein  49.01 
 
 		 442 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0695  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  49.75 
 
 		 441 aa  378  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  45.73 
 
 		 447 aa  376  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2643  extracellular solute-binding protein  48.88 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0222782  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0876  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  49.01 
 
 		 442 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0755942  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2511  extracellular solute-binding protein  48.88 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464819  normal  0.359234 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0631  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  49.01 
 
 		 442 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0079  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  49.01 
 
 		 442 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2465  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  49.01 
 
 		 442 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0872  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  49.01 
 
 		 442 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0702  extracellular solute-binding protein  48.38 
 
 		 440 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.812706  normal  0.378032 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  46.35 
 
 		 436 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  45.94 
 
 		 439 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2144  sugar-binding periplasmic signal peptide protein  48.75 
 
 		 441 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000125903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  46 
 
 		 441 aa  372  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  46.34 
 
 		 437 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  46.7 
 
 		 436 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4845  extracellular solute-binding protein  46.03 
 
 		 434 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  44.52 
 
 		 443 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0459  extracellular solute-binding protein  44.04 
 
 		 436 aa  363  3e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.420805  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2440  extracellular solute-binding protein  45.66 
 
 		 440 aa  363  4e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0811647  decreased coverage  0.000336324 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0431  extracellular solute-binding protein  45.63 
 
 		 435 aa  362  6e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0364  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  44.27 
 
 		 438 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3854  extracellular solute-binding protein  47.23 
 
 		 439 aa  359  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2707  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  44.57 
 
 		 440 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.069342  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0138  extracellular solute-binding protein  44.15 
 
 		 434 aa  358  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  42.26 
 
 		 447 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  44.9 
 
 		 437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1727  extracellular solute-binding protein  45.22 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  44.99 
 
 		 436 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4812  extracellular solute-binding protein  44.69 
 
 		 438 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  44.32 
 
 		 437 aa  352  5e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1094  extracellular solute-binding protein  41.76 
 
 		 439 aa  352  7e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  0.028756 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2640  extracellular solute-binding protein  45.18 
 
 		 436 aa  352  8e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1108  extracellular solute-binding protein family 1  43.09 
 
 		 436 aa  352  8.999999999999999e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3415  extracellular solute-binding protein  42.59 
 
 		 438 aa  352  8.999999999999999e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1681  extracellular solute-binding protein  44.52 
 
 		 436 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.901925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3171  extracellular solute-binding protein  42.15 
 
 		 443 aa  351  1e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0974  extracellular solute-binding protein family 1  44.21 
 
 		 435 aa  345  1e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606433  normal  0.163223 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2041  extracellular solute-binding protein  42.56 
 
 		 436 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4468  extracellular solute-binding protein  43.1 
 
 		 436 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5596  extracellular solute-binding protein  43 
 
 		 436 aa  335  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.198436  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34420  putative binding protein component of ABC maltose/mannitol transporter  43.28 
 
 		 436 aa  333  5e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000870468  normal  0.425479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4325  extracellular solute-binding protein family 1  44.04 
 
 		 454 aa  332  7.000000000000001e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2925  putative maltose/mannitol ABC transporter binding protein subunit  43.03 
 
 		 436 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.732093  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27400  periplasmic mannitol-binding protein of mannitol ABC transporter  42.86 
 
 		 438 aa  328  9e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0848  extracellular solute-binding protein family 1  39.61 
 
 		 453 aa  327  4.0000000000000003e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0413942  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0889  extracellular solute-binding protein  42.82 
 
 		 435 aa  326  5e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4181  extracellular solute-binding protein  43.8 
 
 		 435 aa  325  7e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000770865  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2902  extracellular solute-binding protein  42.65 
 
 		 439 aa  315  1.9999999999999998e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  32.23 
 
 		 422 aa  171  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  32.24 
 
 		 422 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  32.23 
 
 		 422 aa  170  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03697  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.68 
 
 		 675 aa  164  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  31.49 
 
 		 428 aa  144  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3775  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 441 aa  127  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 424 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0954  extracellular solute-binding protein  30.33 
 
 		 397 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.233769  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2624  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 444 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4037  ABC sugar transporter, periplasmic lignad binding protein  26.52 
 
 		 429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0204263  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  27.86 
 
 		 440 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.83 
 
 		 496 aa  111  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 439 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 439 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2420  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 443 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.783182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2465  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 443 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2459  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 443 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.924766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 412 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 446 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.05 
 
 		 452 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  29.9 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03340  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3065  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.23 
 
 		 421 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1179  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.12 
 
 		 423 aa  103  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0916647  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1390  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 		 444 aa  103  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00129811  normal  0.103249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  27.66 
 
 		 426 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1232  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.2 
 
 		 426 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1073  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.2 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>