More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4243 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4399  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  99.43 
 
 
525 aa  1032    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262296  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4177  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  100 
 
 
525 aa  1037    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0530735  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4243  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  100 
 
 
525 aa  1037    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0209492  normal  0.158943 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4697  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  75.1 
 
 
527 aa  752    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.269439  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2036  ATP-binding region ATPase domain protein  57.01 
 
 
536 aa  462  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3596  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  49.9 
 
 
519 aa  418  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3869  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  48.1 
 
 
540 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0780654  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25730  PAS domain S-box  46.23 
 
 
520 aa  382  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2258  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  46.79 
 
 
542 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0498367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8198  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  43.6 
 
 
538 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4414  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  45.75 
 
 
558 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1529  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  37.03 
 
 
543 aa  302  8.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1529  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  40.57 
 
 
569 aa  301  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000208522 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0516  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  47.25 
 
 
551 aa  298  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.494756  normal  0.0577704 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1162  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  41.52 
 
 
528 aa  288  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.308176  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8065  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  37.48 
 
 
583 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5600  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.77 
 
 
549 aa  240  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0065  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  38.53 
 
 
529 aa  238  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633378  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1959  sensory histidine kinase DcuS  29.77 
 
 
533 aa  221  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516955 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3624  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  37.29 
 
 
534 aa  219  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37840  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.02 
 
 
527 aa  215  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.183307 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5077  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.61 
 
 
558 aa  213  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.669392 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2789  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.6 
 
 
536 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0038  sensory histidine kinase DcuS  30.14 
 
 
542 aa  211  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0044  sensory histidine kinase DcuS  29.74 
 
 
542 aa  208  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0489  sensory histidine kinase DcuS  27.76 
 
 
534 aa  206  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0487  sensory histidine kinase DcuS  30.43 
 
 
534 aa  206  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0632  sensory histidine kinase DcuS  27.76 
 
 
534 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0597  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.85 
 
 
524 aa  205  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1396  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.89 
 
 
556 aa  205  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0792453  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4102  sensory histidine kinase DcuS  28.27 
 
 
537 aa  204  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2325  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.87 
 
 
531 aa  204  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.18048  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0639  sensory histidine kinase DcuS  28.31 
 
 
534 aa  204  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0545  sensory histidine kinase DcuS  27.81 
 
 
534 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.847766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0965  sensor histidine kinase  27.82 
 
 
529 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4725  sensory histidine kinase DcuS  27.76 
 
 
534 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.678206  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0576  sensory histidine kinase DcuS  27.81 
 
 
534 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2555  sensory histidine kinase DcuS  28.27 
 
 
538 aa  202  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.129089 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4346  sensor histidine kinase  28.01 
 
 
529 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149156  hitchhiker  0.000000000000186115 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3705  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.68 
 
 
527 aa  202  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0490  sensory histidine kinase DcuS  27.94 
 
 
534 aa  201  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0614  sensory histidine kinase DcuS  30.64 
 
 
534 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0496  sensory histidine kinase DcuS  29.21 
 
 
528 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2224  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.84 
 
 
541 aa  196  8.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.691075  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1009  sensor histidine kinase  27.26 
 
 
529 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0472  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.72 
 
 
532 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0876  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.7 
 
 
537 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0928  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.7 
 
 
537 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0837  sensor histidine kinase  27.07 
 
 
529 aa  192  9e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0904  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.7 
 
 
537 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1004  sensor histidine kinase  27.12 
 
 
529 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.68776e-61 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0938  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.7 
 
 
537 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.101589 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3096  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.1 
 
 
537 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3432  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.49 
 
 
537 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0869  sensor histidine kinase  26.55 
 
 
529 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0923  sensor histidine kinase  26.55 
 
 
529 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0811  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.15 
 
 
529 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3378  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.22 
 
 
545 aa  189  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.960766  normal  0.505448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3249  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.96 
 
 
539 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.710576  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0527  sensor histidine kinase  26 
 
 
536 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02431  sensor kinase CitA  30.09 
 
 
541 aa  188  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0559  sensor histidine kinase  26 
 
 
536 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3238  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.71 
 
 
539 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.698752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3300  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.71 
 
 
539 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.814205  hitchhiker  0.00983464 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0688  sensor histidine kinase  25.8 
 
 
534 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0470  sensor histidine kinase  25.8 
 
 
536 aa  187  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.974367  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0595  sensor protein CitS  26 
 
 
533 aa  187  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3991  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.25 
 
 
553 aa  186  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00164194  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1089  sensor histidine kinase  26.32 
 
 
529 aa  186  9e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0470  sensor histidine kinase  26.4 
 
 
536 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398861  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0620  sensor histidine kinase  26.3 
 
 
536 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0700  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.94 
 
 
543 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0615  sensor histidine kinase  26.2 
 
 
534 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4744  sensor protein CitS  25.68 
 
 
533 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2441  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.94 
 
 
540 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3910  sensory histidine kinase DcuS  27.2 
 
 
537 aa  182  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0515  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.05 
 
 
526 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1749  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.19 
 
 
534 aa  180  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000244457  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0511  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.54 
 
 
521 aa  180  7e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0671541  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4650  sensory histidine kinase DcuS  26.42 
 
 
543 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.414572  normal  0.461897 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4650  sensory histidine kinase DcuS  26.42 
 
 
543 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2898  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.83 
 
 
553 aa  177  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3731  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.88 
 
 
532 aa  177  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.95506  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2021  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.14 
 
 
534 aa  177  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1377  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.27 
 
 
525 aa  177  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1041  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.87 
 
 
563 aa  176  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4699  sensory histidine kinase DcuS  26.23 
 
 
543 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4559  sensory histidine kinase DcuS  26.23 
 
 
543 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4645  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.88 
 
 
529 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0010254  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3003  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.26 
 
 
503 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0343689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4567  sensory histidine kinase DcuS  26.04 
 
 
543 aa  174  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0511  sensor histidine kinase  24.6 
 
 
516 aa  173  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0500  sensor histidine kinase  24.4 
 
 
516 aa  172  9e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3503  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.71 
 
 
546 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.243231 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4311  sensory histidine kinase DcuS  29.7 
 
 
533 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412968  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3025  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.76 
 
 
552 aa  171  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0642  sensor histidine kinase DpiB  25.76 
 
 
552 aa  171  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0459667  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3006  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.76 
 
 
552 aa  170  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00589  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with citB  25.76 
 
 
552 aa  170  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0638  sensor histidine kinase DpiB  25.76 
 
 
552 aa  170  7e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.736103  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>