267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4107 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  64.88 
 
 
860 aa  1063    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  62.75 
 
 
871 aa  1074    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  75.85 
 
 
863 aa  1292    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  87.16 
 
 
856 aa  1494    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  64.04 
 
 
875 aa  1083    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  49.1 
 
 
800 aa  731    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  65.05 
 
 
838 aa  1032    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  50.78 
 
 
811 aa  722    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  65.23 
 
 
836 aa  1085    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  65.76 
 
 
899 aa  1063    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  100 
 
 
859 aa  1742    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  50.77 
 
 
792 aa  713    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  64.71 
 
 
881 aa  1063    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  63.36 
 
 
867 aa  1068    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  64.4 
 
 
872 aa  1073    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  63.07 
 
 
884 aa  1016    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  49.29 
 
 
779 aa  681    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  66.04 
 
 
842 aa  1117    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  65.42 
 
 
852 aa  1079    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  68.53 
 
 
841 aa  1129    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  100 
 
 
859 aa  1742    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  91.5 
 
 
859 aa  1585    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  64.76 
 
 
859 aa  1072    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  65.76 
 
 
857 aa  1103    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  99.65 
 
 
859 aa  1737    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  47.88 
 
 
826 aa  657    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  92.2 
 
 
859 aa  1584    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  43.78 
 
 
841 aa  601  1e-170  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  66.89 
 
 
944 aa  562  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  43.62 
 
 
757 aa  557  1e-157  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  66.1 
 
 
416 aa  553  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  61.01 
 
 
430 aa  448  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  52.62 
 
 
429 aa  371  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  54.7 
 
 
435 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  47.01 
 
 
392 aa  354  2.9999999999999997e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  52.8 
 
 
418 aa  353  5.9999999999999994e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  50 
 
 
820 aa  353  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  48.35 
 
 
380 aa  344  4e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  49.24 
 
 
359 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  49.54 
 
 
370 aa  336  1e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  49.24 
 
 
359 aa  335  2e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  45.57 
 
 
359 aa  327  7e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  43.82 
 
 
362 aa  326  1e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  51.9 
 
 
386 aa  325  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  45.48 
 
 
419 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  47.35 
 
 
376 aa  317  4e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  47.59 
 
 
453 aa  311  2.9999999999999997e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  46.26 
 
 
367 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  48.92 
 
 
356 aa  298  2e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  47.2 
 
 
358 aa  293  1e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  42.81 
 
 
366 aa  292  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  43.49 
 
 
384 aa  290  8e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  42.61 
 
 
382 aa  287  5.999999999999999e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  40.57 
 
 
565 aa  287  7e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1072  FO synthase subunit 2  43.29 
 
 
358 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  46.4 
 
 
419 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1054  FO synthase subunit 2  44.68 
 
 
358 aa  286  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  44.7 
 
 
737 aa  285  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.17 
 
 
741 aa  284  4.0000000000000003e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.17 
 
 
737 aa  283  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  42.51 
 
 
362 aa  282  2e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  41.28 
 
 
352 aa  282  2e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0775  FO synthase subunit 2  41.69 
 
 
391 aa  281  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.848355  hitchhiker  0.00153433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  42.7 
 
 
381 aa  281  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  41.74 
 
 
365 aa  279  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  43.5 
 
 
380 aa  278  2e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  40.67 
 
 
352 aa  279  2e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  40.06 
 
 
352 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  42.81 
 
 
329 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  39.63 
 
 
390 aa  273  7e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1620  FO synthase subunit 2  43.16 
 
 
358 aa  273  9e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  40.93 
 
 
364 aa  273  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  40.37 
 
 
351 aa  271  5e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  41.5 
 
 
376 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  41.9 
 
 
362 aa  268  4e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  43.15 
 
 
325 aa  266  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  43.58 
 
 
321 aa  265  2e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0686  FO synthase subunit 2  42.22 
 
 
386 aa  265  3e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  38.7 
 
 
384 aa  264  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  38.7 
 
 
384 aa  264  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  43.66 
 
 
331 aa  264  6.999999999999999e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  40.3 
 
 
362 aa  262  3e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2116  FO synthase subunit 2  41.28 
 
 
398 aa  259  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  37.05 
 
 
356 aa  254  7e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3326  FO synthase  40.64 
 
 
372 aa  253  8.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.9768  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  42.39 
 
 
327 aa  248  3e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  45.03 
 
 
393 aa  246  9e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  44.3 
 
 
355 aa  246  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  41.62 
 
 
389 aa  245  3e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  42.26 
 
 
330 aa  244  7e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  43.25 
 
 
355 aa  243  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  38.73 
 
 
360 aa  242  2e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  40.71 
 
 
358 aa  242  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  40.71 
 
 
358 aa  242  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  37.79 
 
 
361 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  41.77 
 
 
361 aa  241  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  37.78 
 
 
367 aa  241  4e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  38.33 
 
 
361 aa  240  8e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  39.22 
 
 
360 aa  240  9e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  42.09 
 
 
387 aa  240  1e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.373224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>