185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4043 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  49.02 
 
 		 1228 aa  952    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  48.87 
 
 		 1250 aa  981    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  46.61 
 
 		 1215 aa  894    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  100 
 
 		 1143 aa  2299    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  46.43 
 
 		 1215 aa  890    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  100 
 
 		 1143 aa  2299    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  72.58 
 
 		 1151 aa  1634    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  98.78 
 
 		 1143 aa  2276    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  41.75 
 
 		 1270 aa  765    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  71.18 
 
 		 1163 aa  1589    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  44.01 
 
 		 1196 aa  799    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  67.92 
 
 		 1139 aa  1506    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  39.05 
 
 		 1247 aa  683    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  47.19 
 
 		 1324 aa  711    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  38.36 
 
 		 1153 aa  603  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  37.98 
 
 		 1082 aa  545  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  37.07 
 
 		 1198 aa  536  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  34.46 
 
 		 1118 aa  510  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  33.28 
 
 		 1126 aa  496  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  33.1 
 
 		 1116 aa  487  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  45.02 
 
 		 1350 aa  473  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  31.16 
 
 		 1172 aa  468  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1529  hypothetical protein  37.47 
 
 		 1175 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0907559  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4059  hypothetical protein  43.22 
 
 		 522 aa  358  3.9999999999999996e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  38.08 
 
 		 1280 aa  309  3e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  40.62 
 
 		 1121 aa  236  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  30.73 
 
 		 902 aa  125  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  30.3 
 
 		 934 aa  117  8.999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  27.13 
 
 		 1271 aa  107  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  29.46 
 
 		 1259 aa  103  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  28.57 
 
 		 986 aa  103  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  29.46 
 
 		 606 aa  103  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  26.94 
 
 		 1038 aa  103  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  29.83 
 
 		 901 aa  102  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  26.03 
 
 		 636 aa  99.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  29.19 
 
 		 902 aa  99.8  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  30.08 
 
 		 752 aa  97.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  28.91 
 
 		 480 aa  92.4  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  25.64 
 
 		 632 aa  89  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  29.55 
 
 		 609 aa  87.4  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  33.33 
 
 		 553 aa  85.1  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  33.33 
 
 		 553 aa  85.1  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  32.21 
 
 		 521 aa  83.2  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  25.31 
 
 		 1255 aa  82.8  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  27.52 
 
 		 1099 aa  82.8  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  26.64 
 
 		 494 aa  81.6  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  26.42 
 
 		 636 aa  80.1  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  25.44 
 
 		 512 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  26.12 
 
 		 487 aa  80.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  22.5 
 
 		 1090 aa  79.7  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  31.58 
 
 		 659 aa  79.3  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  24.93 
 
 		 479 aa  79  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  24.45 
 
 		 797 aa  79  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  27.56 
 
 		 635 aa  77.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  25.17 
 
 		 1427 aa  77.8  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  24.81 
 
 		 486 aa  77.8  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0518  RecB family-like nuclease  25.09 
 
 		 390 aa  76.6  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13317  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  27.88 
 
 		 754 aa  76.3  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  24.88 
 
 		 1077 aa  75.1  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  25.09 
 
 		 650 aa  74.7  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2280  AAA ATPase  24.02 
 
 		 1403 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00184905  decreased coverage  0.00000493751 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  29.14 
 
 		 1189 aa  73.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03101  RecB family nuclease  22.2 
 
 		 446 aa  73.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  24.31 
 
 		 1048 aa  72.8  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  24.72 
 
 		 650 aa  72.8  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  25.27 
 
 		 1999 aa  72  0.00000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  26.95 
 
 		 2245 aa  71.2  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  25.09 
 
 		 932 aa  71.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  27.2 
 
 		 629 aa  70.5  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  25.54 
 
 		 925 aa  69.7  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  25.19 
 
 		 1653 aa  69.7  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0719  RecB family-like nuclease  24.56 
 
 		 495 aa  69.7  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253334  hitchhiker  0.0000000430551 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  27.06 
 
 		 585 aa  69.3  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  27.59 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  24.72 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  27.59 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  28.17 
 
 		 914 aa  68.9  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  26.01 
 
 		 686 aa  68.2  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0186  hypothetical protein  20.82 
 
 		 512 aa  68.2  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  24.16 
 
 		 486 aa  68.2  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2796  transcription factor jumonji, jmjC  58.82 
 
 		 193 aa  67.8  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132584  hitchhiker  0.00000604093 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  23.83 
 
 		 611 aa  67.8  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  23.31 
 
 		 715 aa  67.8  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  28.37 
 
 		 464 aa  67.4  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  23.38 
 
 		 1408 aa  67.8  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  24.82 
 
 		 1097 aa  66.2  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  27.2 
 
 		 795 aa  66.6  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  23.67 
 
 		 388 aa  66.2  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  24.33 
 
 		 1111 aa  65.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24981  RecB family nuclease  26.74 
 
 		 535 aa  65.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3922  superfamily I DNA/RNA helicase  23.86 
 
 		 1261 aa  64.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  28.9 
 
 		 1275 aa  63.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  29.78 
 
 		 946 aa  63.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  26.84 
 
 		 716 aa  63.9  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  26.97 
 
 		 748 aa  63.2  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  26.01 
 
 		 1126 aa  63.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0570  superfamily I DNA/RNA helicase  25.85 
 
 		 1457 aa  63.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.010636 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  24.33 
 
 		 922 aa  62.8  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03001  RecB family nuclease  21.43 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  29.15 
 
 		 619 aa  62  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>