More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4035 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11283  oxidoreductase  78 
 
 		 455 aa  689    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  87.78 
 
 		 453 aa  800    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 457 aa  907    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153769  normal  0.0426559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3961  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 457 aa  907    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4035  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 457 aa  907    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4464  FAD linked oxidase domain-containing protein  87.33 
 
 		 453 aa  774    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4261  FAD linked oxidase domain protein  69.13 
 
 		 455 aa  621  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371962  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3277  FAD linked oxidase domain-containing protein  63.94 
 
 		 453 aa  513  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.450934  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  51.43 
 
 		 461 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  51.98 
 
 		 455 aa  414  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  48.89 
 
 		 460 aa  403  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  51.14 
 
 		 455 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.89 
 
 		 458 aa  391  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3056  FAD linked oxidase domain protein  52.58 
 
 		 482 aa  389  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  46.71 
 
 		 479 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0316  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.41 
 
 		 464 aa  365  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0273  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.19 
 
 		 464 aa  362  8e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22220  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  47.38 
 
 		 496 aa  357  1.9999999999999998e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10573  normal  0.191937 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1052  FAD linked oxidase domain protein  46.95 
 
 		 470 aa  352  1e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2008  FAD linked oxidase domain protein  46.49 
 
 		 460 aa  347  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.693468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5223  FAD linked oxidase domain protein  46.15 
 
 		 462 aa  343  4e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6354  putative glycolate oxidase  47.82 
 
 		 453 aa  342  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0353513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.3 
 
 		 451 aa  339  5.9999999999999996e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.75 
 
 		 470 aa  327  3e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.27 
 
 		 470 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0177  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.47 
 
 		 449 aa  319  6e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.03 
 
 		 470 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  42.79 
 
 		 470 aa  316  5e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  42.55 
 
 		 470 aa  316  7e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.55 
 
 		 470 aa  316  7e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.03 
 
 		 470 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  42.31 
 
 		 470 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.55 
 
 		 470 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  42.31 
 
 		 470 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.55 
 
 		 470 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0766  FAD linked oxidase domain protein  45.99 
 
 		 441 aa  313  2.9999999999999996e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0491548  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  39.74 
 
 		 466 aa  312  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2143  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.83 
 
 		 442 aa  310  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.165769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  43.65 
 
 		 472 aa  311  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.22 
 
 		 464 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.46 
 
 		 460 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  39.56 
 
 		 457 aa  305  7e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  40.18 
 
 		 461 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  38 
 
 		 456 aa  302  8.000000000000001e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  39.55 
 
 		 462 aa  302  9e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  46.14 
 
 		 459 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  39.04 
 
 		 457 aa  301  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  42.27 
 
 		 466 aa  300  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  41.32 
 
 		 499 aa  299  7e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.32 
 
 		 499 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  42.3 
 
 		 498 aa  298  2e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6132  glycolate oxidase subunit GlcD  43.03 
 
 		 499 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.22 
 
 		 457 aa  298  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  39.34 
 
 		 499 aa  296  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.7 
 
 		 460 aa  296  5e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  39.56 
 
 		 499 aa  296  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.67 
 
 		 456 aa  296  7e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.61 
 
 		 460 aa  295  8e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.61 
 
 		 460 aa  295  8e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  38.78 
 
 		 459 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.61 
 
 		 460 aa  295  1e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.24 
 
 		 456 aa  295  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7454  glycolate oxidase subunit GlcD  42.31 
 
 		 499 aa  295  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.108738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1780  FAD linked oxidase domain protein  43.51 
 
 		 506 aa  294  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000119799 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  41 
 
 		 499 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  42.79 
 
 		 499 aa  293  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  43 
 
 		 499 aa  293  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5643  glycolate oxidase subunit GlcD  41.83 
 
 		 499 aa  293  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  0.475418 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  38.85 
 
 		 461 aa  292  1e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  38.78 
 
 		 459 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  42.51 
 
 		 499 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  42.75 
 
 		 499 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  42.75 
 
 		 499 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.89 
 
 		 459 aa  290  4e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  42.31 
 
 		 499 aa  289  7e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  40.35 
 
 		 499 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  39.95 
 
 		 461 aa  289  8e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  40.8 
 
 		 503 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  39.37 
 
 		 462 aa  288  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  37.75 
 
 		 466 aa  288  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.68 
 
 		 459 aa  288  2e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  43 
 
 		 499 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  40.56 
 
 		 499 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.56 
 
 		 469 aa  286  4e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  37.05 
 
 		 460 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.3 
 
 		 459 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.36 
 
 		 464 aa  285  8e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1664  glycolate oxidase subunit GlcD  38.44 
 
 		 489 aa  285  1.0000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.922134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0717  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.55 
 
 		 499 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3152  glycolate oxidase subunit GlcD  41.55 
 
 		 496 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3439  glycolate oxidase subunit GlcD  41.55 
 
 		 496 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3257  glycolate oxidase subunit GlcD  41.55 
 
 		 496 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0721  glycolate oxidase subunit GlcD  41.55 
 
 		 499 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  37.39 
 
 		 462 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.92 
 
 		 495 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.92 
 
 		 495 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  38.91 
 
 		 483 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02848  glycolate oxidase subunit, FAD-linked  41.3 
 
 		 499 aa  282  8.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139975  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02798  hypothetical protein  41.3 
 
 		 499 aa  282  8.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160001  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  39.04 
 
 		 461 aa  282  9e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>