43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3878 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_4311  phage major capsid protein, HK97  100 
 
 		 285 aa  571  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101318  normal  0.740598 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3878  phage major capsid protein, HK97  100 
 
 		 285 aa  571  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3805  phage major capsid protein, HK97  100 
 
 		 285 aa  571  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2518  phage major capsid protein, HK97  38.81 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728933 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  28.93 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  29.15 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  29.15 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  29.65 
 
 		 399 aa  79  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  26.02 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  26.33 
 
 		 420 aa  69.3  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  24.49 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2954  phage major capsid protein, HK97  26.6 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.624972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2910  phage major capsid protein, HK97  26.6 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1284  major capsid protein HK97  24.47 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0461297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3078  phage major capsid protein, HK97  26.22 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  26.11 
 
 		 392 aa  62.4  0.000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  25.89 
 
 		 400 aa  59.3  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  25.35 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  25.63 
 
 		 382 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  25.63 
 
 		 382 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2686  phage major capsid protein, HK97 family  21.93 
 
 		 466 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  27.4 
 
 		 389 aa  50.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  25.42 
 
 		 385 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0411  hypothetical protein  25.95 
 
 		 624 aa  49.7  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1150  hypothetical protein  25.95 
 
 		 624 aa  49.7  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  26.4 
 
 		 384 aa  48.9  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5150  putative phage-related protein  23.34 
 
 		 409 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.788402  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0892  hypothetical protein  20.53 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0910  phage-related head protein  20.53 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2015  putative phage-related protein  26.9 
 
 		 446 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0608266 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1170  peptidase U35 phage prohead HK97  25.19 
 
 		 624 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0369  peptidase U35 phage prohead HK97  25.95 
 
 		 624 aa  47.4  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0840  major capsid protein HK97  20.36 
 
 		 313 aa  46.2  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  26.88 
 
 		 403 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  24.54 
 
 		 380 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  24.72 
 
 		 385 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0580  major capsid protein HK97  26.79 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0637425 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  23.74 
 
 		 388 aa  43.5  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  20.09 
 
 		 401 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  20.09 
 
 		 401 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  30.24 
 
 		 645 aa  42.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  30.24 
 
 		 645 aa  42.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  30.24 
 
 		 645 aa  42.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204536 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>