50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3872 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_3872  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.709194  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3799  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274784  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  94.05 
 
 
448 aa  173  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  92.86 
 
 
448 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4317  hypothetical protein  94.05 
 
 
87 aa  168  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0667309  normal  0.918419 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  89.41 
 
 
492 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  89.41 
 
 
446 aa  167  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  88.24 
 
 
492 aa  167  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  88.24 
 
 
492 aa  167  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  88.51 
 
 
447 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  86.9 
 
 
444 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  86.9 
 
 
444 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  86.9 
 
 
444 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  85.88 
 
 
493 aa  163  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  93.51 
 
 
473 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  93.51 
 
 
473 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  90.91 
 
 
473 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  83.33 
 
 
490 aa  156  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  82.35 
 
 
442 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  82.35 
 
 
442 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  50.57 
 
 
464 aa  92  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  52.63 
 
 
495 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  51.32 
 
 
513 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  50 
 
 
518 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  50 
 
 
497 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13504  hypothetical protein  50 
 
 
239 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10095  hypothetical protein  48.78 
 
 
317 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391031  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  49.35 
 
 
454 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  48.81 
 
 
499 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  43.37 
 
 
454 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11604  REP13E12 repeat-containing protein  48.84 
 
 
240 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.81222e-18  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  44.58 
 
 
451 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  43.02 
 
 
508 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  43.02 
 
 
508 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  42.67 
 
 
506 aa  67.4  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  42.67 
 
 
501 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  42.67 
 
 
510 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  43.24 
 
 
489 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  41.33 
 
 
511 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  46.05 
 
 
552 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  42.67 
 
 
507 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  42.67 
 
 
507 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  41.33 
 
 
507 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  41.33 
 
 
507 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  41.33 
 
 
507 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  41.33 
 
 
519 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  41.33 
 
 
507 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  41.33 
 
 
519 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5365  hypothetical protein  41.33 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  37.31 
 
 
469 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>