123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3710 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3637  major facilitator transporter  100 
 
 		 454 aa  887    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3710  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 454 aa  887    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.417195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3642  major facilitator transporter  100 
 
 		 454 aa  887    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  69.4 
 
 		 449 aa  579  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4097  major facilitator superfamily transporter  69.37 
 
 		 443 aa  546  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12530  leucine and alanine rich integral membrane protein  63.53 
 
 		 445 aa  488  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0104482 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  52.57 
 
 		 445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  51.07 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  44.62 
 
 		 440 aa  307  2.0000000000000002e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  41.7 
 
 		 467 aa  291  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  39.82 
 
 		 468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  42.45 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  42.12 
 
 		 462 aa  267  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  39.35 
 
 		 467 aa  261  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  36.61 
 
 		 449 aa  259  9e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  36.82 
 
 		 472 aa  246  8e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  32.81 
 
 		 435 aa  219  6e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 429 aa  210  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  36.5 
 
 		 451 aa  206  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  29.59 
 
 		 435 aa  204  4e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  29.59 
 
 		 460 aa  199  6e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  33.89 
 
 		 426 aa  188  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  28.64 
 
 		 424 aa  180  4e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  28.47 
 
 		 424 aa  176  9e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 465 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 462 aa  167  5e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 462 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  29.42 
 
 		 463 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 469 aa  161  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  31.66 
 
 		 443 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 467 aa  156  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 465 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 416 aa  150  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 462 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 426 aa  146  9e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 421 aa  146  9e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  29.75 
 
 		 458 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 469 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  27.77 
 
 		 440 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 419 aa  133  5e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  29.81 
 
 		 425 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 428 aa  131  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2662  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 460 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 466 aa  129  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 474 aa  129  8.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0020  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 456 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 463 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  27.13 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  24.57 
 
 		 455 aa  117  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 493 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  28.63 
 
 		 460 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 444 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 492 aa  109  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 447 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  27.52 
 
 		 448 aa  108  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1362  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 456 aa  107  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0030  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 456 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  25.36 
 
 		 430 aa  103  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  25.45 
 
 		 453 aa  103  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 439 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 433 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  22.82 
 
 		 427 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  23.06 
 
 		 427 aa  100  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  23.06 
 
 		 427 aa  100  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  23.06 
 
 		 427 aa  100  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  23.06 
 
 		 427 aa  100  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  23.06 
 
 		 427 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 		 424 aa  99.8  9e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  24.55 
 
 		 453 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  23.06 
 
 		 427 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  22.82 
 
 		 427 aa  99  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  23.24 
 
 		 427 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  22.38 
 
 		 412 aa  98.2  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  23.28 
 
 		 427 aa  97.8  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  22.25 
 
 		 427 aa  97.1  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0657  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 449 aa  96.7  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.651323  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 450 aa  94.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 572 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3264  hypothetical protein  25.77 
 
 		 408 aa  89.7  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  23.41 
 
 		 425 aa  89  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0387  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0133748  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2485  hypothetical protein  24.95 
 
 		 464 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  23.93 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 426 aa  85.1  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  26.5 
 
 		 446 aa  84.3  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4202  hypothetical protein  22.57 
 
 		 479 aa  83.2  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  25.22 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1276  hypothetical protein  23.18 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  25.11 
 
 		 451 aa  79.7  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2342  hypothetical protein  24.35 
 
 		 464 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968844 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 458 aa  79.7  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  24.04 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 460 aa  77.4  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1217  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14630  major facilitator superfamily permease  24.89 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415319 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>