More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3569 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_3569  phage integrase family protein  100 
 
 
300 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal  0.0892176 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1863  integrase family protein  55.84 
 
 
347 aa  260  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1515  integrase family protein  38.18 
 
 
308 aa  189  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3501  integrase family protein  38.95 
 
 
309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3692  integrase family protein  33.56 
 
 
296 aa  159  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.859862 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1619  integrase family protein  35.67 
 
 
325 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.771515  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1095  phage integrase  41.31 
 
 
242 aa  140  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_63  site-specific recombinase, phage integrase family  31.44 
 
 
332 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0214  site-specific recombinase XerD  32.44 
 
 
277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  27.33 
 
 
319 aa  119  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0272  phage integrase family site specific recombinase  29.97 
 
 
319 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0295  phage integrase family site specific recombinase  29.97 
 
 
319 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0905  phage integrase family site specific recombinase  29.97 
 
 
319 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.78 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.41 
 
 
296 aa  113  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.41 
 
 
296 aa  113  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.68 
 
 
296 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.68 
 
 
296 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.68 
 
 
296 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.68 
 
 
296 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.68 
 
 
296 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.68 
 
 
296 aa  112  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.68 
 
 
296 aa  112  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  27.54 
 
 
295 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.68 
 
 
296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  30.92 
 
 
286 aa  105  6e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  30.27 
 
 
297 aa  105  8e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.74 
 
 
299 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  29.14 
 
 
295 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  28.86 
 
 
292 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  29.27 
 
 
291 aa  102  9e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  24.71 
 
 
296 aa  102  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  30.42 
 
 
277 aa  102  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  28.52 
 
 
308 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2540  integrase family protein  31 
 
 
350 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  26.29 
 
 
296 aa  99.4  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  29.37 
 
 
301 aa  99  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  25.84 
 
 
305 aa  99  9e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  25.5 
 
 
294 aa  99  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1659  tyrosine recombinase XerD subunit  30.04 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  25.43 
 
 
297 aa  97.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  29.41 
 
 
295 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2473  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.33 
 
 
306 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3087  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.33 
 
 
306 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  27.14 
 
 
302 aa  97.1  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  28.34 
 
 
309 aa  96.3  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0170  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.86 
 
 
306 aa  95.9  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  29.41 
 
 
295 aa  95.9  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  29.41 
 
 
295 aa  95.9  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  24.34 
 
 
298 aa  95.5  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  24.34 
 
 
298 aa  95.5  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6437  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.69 
 
 
306 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2996  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.58 
 
 
306 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0374572 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3104  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.33 
 
 
306 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.494742 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  24.91 
 
 
329 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.69 
 
 
300 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05531  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.12 
 
 
347 aa  94  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  28.9 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  29.08 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  27.21 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  27.08 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.69 
 
 
300 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1777  tyrosine recombinase XerD  23.57 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  29.76 
 
 
311 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  27.34 
 
 
295 aa  94  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  26.88 
 
 
295 aa  94  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5891  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.57 
 
 
316 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  27.84 
 
 
292 aa  93.6  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  29.66 
 
 
310 aa  94  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.84 
 
 
302 aa  93.6  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2063  tyrosine recombinase XerD  23.93 
 
 
290 aa  93.6  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  29 
 
 
298 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3133  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.48 
 
 
306 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.89 
 
 
300 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  28.67 
 
 
293 aa  93.6  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3082  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.22 
 
 
306 aa  93.2  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.633641  normal  0.120316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  30.34 
 
 
342 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  28.93 
 
 
303 aa  93.2  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0056  phage integrase family protein  29.18 
 
 
332 aa  93.2  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.94 
 
 
300 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  29.89 
 
 
304 aa  92.8  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  29.43 
 
 
302 aa  92.8  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  28.88 
 
 
300 aa  92.8  7e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.72 
 
 
310 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3258  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.72 
 
 
310 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.706598  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  26.59 
 
 
301 aa  92.4  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0392  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.72 
 
 
310 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3428  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.72 
 
 
310 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  27 
 
 
284 aa  92.4  8e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0195  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.72 
 
 
310 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2920  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.72 
 
 
310 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.510567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2169  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.72 
 
 
310 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126979  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1948  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.32 
 
 
318 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.95 
 
 
300 aa  92.4  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2583  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.32 
 
 
318 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2559  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.32 
 
 
318 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  25.09 
 
 
295 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.66 
 
 
299 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  29.9 
 
 
343 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  29.9 
 
 
343 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>