More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3510 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  100 
 
 
131 aa  266  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  100 
 
 
131 aa  266  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  100 
 
 
131 aa  266  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  77.34 
 
 
131 aa  211  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  73.44 
 
 
134 aa  206  8e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  75 
 
 
130 aa  202  9e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1261  ferric uptake regulator, Fur family  69.6 
 
 
141 aa  179  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13670  zinc uptake regulator, Fur family  63.36 
 
 
142 aa  169  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7037  ferric uptake regulator, Fur family  65.35 
 
 
150 aa  168  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  62.6 
 
 
135 aa  167  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  61.6 
 
 
133 aa  163  6.9999999999999995e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  60.48 
 
 
138 aa  159  9e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  59.38 
 
 
135 aa  159  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1536  ferric uptake regulator, Fur family  60.32 
 
 
130 aa  159  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.451133  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2373  ferric uptake regulator, Fur family  55.47 
 
 
154 aa  156  7e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000416204 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  57.94 
 
 
154 aa  156  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  56.92 
 
 
167 aa  155  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1772  ferric uptake regulator, Fur family  56.91 
 
 
141 aa  153  7e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431388  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13650  zinc uptake regulator, Fur family  60.17 
 
 
136 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3150  ferric-uptake regulator  61.29 
 
 
137 aa  147  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0061  zinc uptake regulator  54.81 
 
 
142 aa  146  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  55.38 
 
 
134 aa  146  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7263  ferric uptake regulator family protein  55.56 
 
 
175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11800  zinc uptake regulator, Fur family  56.8 
 
 
129 aa  144  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00894406  normal  0.765019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  54.47 
 
 
135 aa  142  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07800  zinc uptake regulator, Fur family  54.2 
 
 
148 aa  141  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0734  ferric uptake regulator, Fur family  55.83 
 
 
123 aa  141  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264881  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  55.28 
 
 
129 aa  141  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  54.26 
 
 
150 aa  141  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2085  zinc uptake regulator  54.4 
 
 
138 aa  140  7e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  53.6 
 
 
137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3230  ferric uptake regulator, Fur family  54.03 
 
 
150 aa  138  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0854036  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  53.97 
 
 
187 aa  137  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  51.2 
 
 
131 aa  136  7.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1179  Fur family ferric uptake regulator  54.03 
 
 
142 aa  135  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.462177  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17110  zinc uptake regulator, Fur family  50.79 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184262  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  49.19 
 
 
142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1040  transcriptional regulator, Fur family  44.62 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  38.4 
 
 
146 aa  94.4  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  38.89 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  37.1 
 
 
143 aa  90.9  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  35.66 
 
 
153 aa  90.9  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  35.2 
 
 
146 aa  89.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0405  ferric uptake regulator family protein  36.67 
 
 
134 aa  88.2  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  30.77 
 
 
145 aa  88.2  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  34.38 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2248  ferric uptake regulator, Fur family  40.83 
 
 
133 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  35.71 
 
 
143 aa  87.8  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  35.2 
 
 
144 aa  87  8e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0817  ferric uptake regulator family protein  36.29 
 
 
130 aa  84.7  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  35.2 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  30.53 
 
 
156 aa  84.7  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  29.69 
 
 
157 aa  84.3  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  29.69 
 
 
157 aa  84.3  5e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  29.69 
 
 
157 aa  84.3  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 
159 aa  84  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4134  ferric uptake regulator, Fur family  38.33 
 
 
132 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4174  ferric uptake regulator, Fur family  38.33 
 
 
132 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  35.04 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  30.71 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  32.26 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  28.91 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0135  ferric uptake regulator, Fur family  35.88 
 
 
139 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000297915  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  32.03 
 
 
143 aa  82  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  32.03 
 
 
147 aa  82  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4413  ferric uptake regulator, Fur family  39.2 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00116957  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  32.59 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  31.75 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3508  ferric uptake regulator  35.2 
 
 
134 aa  82.4  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  34.35 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  31.71 
 
 
139 aa  82  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  29.69 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  33.59 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  31.25 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  37.01 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  32.81 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11321  ferric uptake regulator family protein  36.72 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.948862  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  31.25 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  31.25 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  31.25 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  31.25 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1033  ferric uptake regulator family  34.62 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  34.68 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  34.15 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  31.25 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  32.28 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1373  ferric uptake regulator, Fur family  31.5 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000536701  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  33.59 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  33.59 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  33.59 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  33.59 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  32.06 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  33.59 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  33.59 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  33.59 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  32.06 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  33.59 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  33.59 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  30.47 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  29.92 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>