More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3440 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  100 
 
 
355 aa  719    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  100 
 
 
355 aa  719    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  100 
 
 
355 aa  719    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  80.28 
 
 
376 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  76.39 
 
 
360 aa  556  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  72.91 
 
 
353 aa  524  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  60.88 
 
 
369 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  59.12 
 
 
360 aa  395  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  51.74 
 
 
344 aa  390  1e-107  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  53.14 
 
 
365 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  57.14 
 
 
356 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  49.71 
 
 
356 aa  376  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  49.71 
 
 
356 aa  376  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  53.87 
 
 
380 aa  371  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  50.28 
 
 
363 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  52.16 
 
 
365 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  48.14 
 
 
360 aa  344  1e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  44.79 
 
 
363 aa  312  5.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  46.42 
 
 
360 aa  310  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  45.71 
 
 
367 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  41.85 
 
 
366 aa  259  7e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  33.81 
 
 
351 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  33.81 
 
 
351 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  33.81 
 
 
351 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  33.52 
 
 
349 aa  169  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  32.94 
 
 
357 aa  166  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  30.79 
 
 
353 aa  166  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  32.36 
 
 
357 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  31.02 
 
 
353 aa  162  8.000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  33.23 
 
 
360 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  32.2 
 
 
357 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  36.36 
 
 
341 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  29.94 
 
 
353 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  32.67 
 
 
359 aa  153  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  31.98 
 
 
360 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  30.23 
 
 
351 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  29.66 
 
 
353 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  32.87 
 
 
357 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  32.3 
 
 
351 aa  142  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  31.78 
 
 
358 aa  142  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  30.34 
 
 
348 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  31.32 
 
 
348 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  29.3 
 
 
348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  30.46 
 
 
350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  28.53 
 
 
351 aa  136  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  27.32 
 
 
348 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  29.49 
 
 
351 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  29.49 
 
 
348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  29.3 
 
 
348 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  30.83 
 
 
418 aa  133  6e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  29.86 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  29.97 
 
 
357 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 
363 aa  125  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  30.97 
 
 
355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  31.04 
 
 
356 aa  119  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  27.78 
 
 
416 aa  116  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  30.18 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  35.78 
 
 
270 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
337 aa  64.7  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 
356 aa  64.7  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.68 
 
 
402 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.92 
 
 
346 aa  63.2  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  35.64 
 
 
335 aa  63.2  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  29.27 
 
 
355 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3130  hypothetical protein  28.29 
 
 
305 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  32.5 
 
 
289 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
311 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  28.92 
 
 
273 aa  60.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2956  methyltransferase type 11  29.2 
 
 
304 aa  60.5  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626473  normal  0.0682436 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  29.45 
 
 
314 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3474  Methyltransferase type 12  33.61 
 
 
371 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  29.91 
 
 
202 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  36.94 
 
 
240 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  28.35 
 
 
269 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  32.69 
 
 
242 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  35.85 
 
 
402 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  27.49 
 
 
275 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  27.56 
 
 
269 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  31 
 
 
239 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 
246 aa  57.4  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  31.73 
 
 
244 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  30.13 
 
 
285 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  28.68 
 
 
241 aa  57  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  32.08 
 
 
268 aa  56.6  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
264 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2232  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.67 
 
 
232 aa  56.2  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.618001  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
337 aa  56.2  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
340 aa  56.2  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  29.22 
 
 
285 aa  56.2  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  29.22 
 
 
285 aa  56.2  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 
199 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  31.43 
 
 
422 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3171  methyltransferase type 11  34.38 
 
 
204 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.96 
 
 
252 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  26.77 
 
 
269 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  26.77 
 
 
269 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  30.17 
 
 
282 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.96 
 
 
252 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  26.77 
 
 
269 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>