More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3436 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  100 
 
 		 525 aa  1041    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  80.46 
 
 		 527 aa  819    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  76.27 
 
 		 529 aa  803    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  100 
 
 		 525 aa  1041    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  100 
 
 		 525 aa  1041    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  80.65 
 
 		 527 aa  842    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  55.89 
 
 		 528 aa  531  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  56.08 
 
 		 532 aa  526  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.81 
 
 		 518 aa  510  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  56.19 
 
 		 521 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  57.79 
 
 		 524 aa  501  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.24 
 
 		 572 aa  499  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  56.46 
 
 		 545 aa  497  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  54.39 
 
 		 540 aa  468  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  53.92 
 
 		 531 aa  467  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  52.21 
 
 		 521 aa  450  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  52.94 
 
 		 520 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  50.74 
 
 		 550 aa  425  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  49.25 
 
 		 534 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.19 
 
 		 533 aa  355  1e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.6 
 
 		 568 aa  340  5e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  36.41 
 
 		 584 aa  338  9e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  35.58 
 
 		 557 aa  336  7e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  37.61 
 
 		 556 aa  336  7e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  37.45 
 
 		 552 aa  334  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  34.88 
 
 		 563 aa  320  5e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  38.15 
 
 		 531 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.18 
 
 		 531 aa  318  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  35.78 
 
 		 583 aa  317  4e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  37.96 
 
 		 531 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  33.88 
 
 		 554 aa  311  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  37.02 
 
 		 538 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.7 
 
 		 534 aa  301  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.31 
 
 		 579 aa  293  6e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  33.27 
 
 		 559 aa  293  7e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  31.18 
 
 		 586 aa  292  1e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.01 
 
 		 565 aa  292  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  41.85 
 
 		 546 aa  280  4e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.69 
 
 		 536 aa  276  7e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.37 
 
 		 535 aa  273  6e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  39.41 
 
 		 527 aa  263  8e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.09 
 
 		 564 aa  262  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  39.48 
 
 		 531 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  38.87 
 
 		 532 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  34.06 
 
 		 534 aa  249  7e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  35.22 
 
 		 534 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  33.61 
 
 		 502 aa  246  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  38.43 
 
 		 532 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544288 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.51 
 
 		 510 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  36.05 
 
 		 467 aa  228  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.59 
 
 		 520 aa  226  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  33.72 
 
 		 465 aa  224  3e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  35.4 
 
 		 470 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.55 
 
 		 516 aa  213  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  34.6 
 
 		 517 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.7 
 
 		 516 aa  211  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  34.69 
 
 		 520 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  35.58 
 
 		 513 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.94 
 
 		 523 aa  204  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  28.46 
 
 		 554 aa  194  3e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  28.6 
 
 		 484 aa  183  8.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  28.83 
 
 		 484 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  28.63 
 
 		 484 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.637066 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  28.83 
 
 		 484 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  28.63 
 
 		 484 aa  174  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  28.63 
 
 		 484 aa  174  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.63 
 
 		 484 aa  174  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  28.63 
 
 		 484 aa  174  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  28.43 
 
 		 484 aa  172  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  29.95 
 
 		 451 aa  169  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.59 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1149  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.46 
 
 		 467 aa  144  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.930112 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  31.75 
 
 		 453 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  28.8 
 
 		 462 aa  140  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  30.43 
 
 		 454 aa  140  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  26.84 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  29.9 
 
 		 462 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.65 
 
 		 474 aa  139  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  29.69 
 
 		 457 aa  137  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1299  FAD linked oxidase-like  28.93 
 
 		 456 aa  136  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.913204  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0202  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.48 
 
 		 473 aa  136  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.243944 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0777  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.45 
 
 		 482 aa  136  9e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  31.53 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  29.08 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.14 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5949  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.6 
 
 		 472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00822967 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.94 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.94 
 
 		 469 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.13 
 
 		 474 aa  135  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  28.05 
 
 		 499 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  28.73 
 
 		 459 aa  134  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2602  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  29.21 
 
 		 469 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0332  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  29.21 
 
 		 469 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2415  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  29.21 
 
 		 469 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576548  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1193  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  29.21 
 
 		 469 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  27.21 
 
 		 470 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  27.21 
 
 		 470 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  29.21 
 
 		 469 aa  133  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.76 
 
 		 469 aa  133  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  29.21 
 
 		 469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>