179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3435 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3373  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.946701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3435  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0970833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3384  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3760  TetR family transcriptional regulator  70.98 
 
 		 192 aa  261  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.348424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  65.28 
 
 		 191 aa  246  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12279  transcriptional regulator  62.15 
 
 		 189 aa  206  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  39.29 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0942  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0072348  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4838  regulatory protein TetR  36.36 
 
 		 211 aa  101  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220923  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5600  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 279 aa  101  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0144285  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  38.34 
 
 		 212 aa  99.8  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4591  regulatory protein, TetR  37 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0937227  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6683  putative transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 197 aa  97.1  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 192 aa  91.7  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1957  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 205 aa  91.3  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0242  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 208 aa  88.6  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 192 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  36.36 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5237  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 233 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3427  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 195 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 236 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 197 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 197 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 197 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 197 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  28.8 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  25.65 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4507  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0164  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 271 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4594  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60513  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1248  AcrR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5582  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 229 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 233 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  45.83 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4890  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  23.88 
 
 		 229 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3334  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 173 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 210 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2558  transcriptional regulator  23.65 
 
 		 175 aa  45.1  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 210 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 210 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 199 aa  45.1  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0348  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  25.33 
 
 		 192 aa  45.1  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 196 aa  45.1  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 237 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 228 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 228 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 228 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 200 aa  44.7  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  21.36 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  24.03 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4118  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  24.03 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0306  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.278171  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0323  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 227 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.939407  normal  0.953553 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>