65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3338 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  99.76 
 
 
418 aa  808    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  100 
 
 
418 aa  810    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  100 
 
 
418 aa  810    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  75.12 
 
 
428 aa  570  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  74.59 
 
 
430 aa  566  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  61.94 
 
 
427 aa  486  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  39.37 
 
 
414 aa  228  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  41.38 
 
 
395 aa  213  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  36.36 
 
 
420 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  39.31 
 
 
402 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  36.73 
 
 
408 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  39.1 
 
 
378 aa  160  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  33.16 
 
 
425 aa  157  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  36.1 
 
 
437 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  34.37 
 
 
417 aa  153  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  35.6 
 
 
469 aa  152  8.999999999999999e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  30.26 
 
 
426 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  38.24 
 
 
470 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  36.05 
 
 
421 aa  143  5e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  34.8 
 
 
494 aa  143  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  35.37 
 
 
419 aa  143  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  31.95 
 
 
478 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  33.08 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  33.08 
 
 
417 aa  130  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  34.63 
 
 
455 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  30.7 
 
 
477 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  33.78 
 
 
369 aa  127  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  34.11 
 
 
398 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  31.79 
 
 
463 aa  121  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  35.08 
 
 
434 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  34.01 
 
 
431 aa  117  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  30.47 
 
 
477 aa  117  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  33.79 
 
 
443 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  33.79 
 
 
443 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  33.79 
 
 
443 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  30.23 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  30.23 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  33 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  30.23 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  31.44 
 
 
422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  31.44 
 
 
422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  31.44 
 
 
422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  33.03 
 
 
412 aa  112  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  30.87 
 
 
417 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  30.87 
 
 
417 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  34.62 
 
 
411 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  30.67 
 
 
467 aa  108  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  35.19 
 
 
429 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  29.29 
 
 
479 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  33.33 
 
 
570 aa  106  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  34.69 
 
 
408 aa  106  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  31.29 
 
 
455 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  32.78 
 
 
420 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  32.88 
 
 
410 aa  97.1  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  30.8 
 
 
408 aa  90.1  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  31.38 
 
 
428 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  31.38 
 
 
428 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  31.38 
 
 
428 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  31.02 
 
 
375 aa  63.9  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3146  Thiolase  28.72 
 
 
468 aa  55.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1896  Protein of unknown function DUF2029  27.2 
 
 
429 aa  55.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.73633  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0205  hypothetical protein  28.11 
 
 
734 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.746079  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3867  hypothetical protein  26.91 
 
 
734 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0838155  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2388  hypothetical protein  24.64 
 
 
469 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1662  hypothetical protein  26.93 
 
 
427 aa  43.5  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>