135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3308 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3246  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
227 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3308  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
227 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  decreased coverage  0.00695494 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3257  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
227 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413592  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12173  hypothetical protein  71.16 
 
 
352 aa  298  6e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.789883 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3513  phosphoribosyltransferase  62.44 
 
 
220 aa  263  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684715  normal  0.167755 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1097  erythromycin esterase  62.33 
 
 
679 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511682  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1108  erythromycin esterase  62.33 
 
 
679 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0293392  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1081  erythromycin esterase  62.33 
 
 
845 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00882815  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12067  hypothetical protein  59.73 
 
 
681 aa  239  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1393  erythromycin esterase  61.14 
 
 
681 aa  236  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0175546  normal  0.392686 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2998  phosphoribosyltransferase  60.91 
 
 
223 aa  235  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149919  normal  0.225767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4988  erythromycin esterase  61.14 
 
 
681 aa  235  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0940  putative phosphoribosyl transferase protein  58.25 
 
 
235 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0777  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  58.25 
 
 
235 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0765  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  58.25 
 
 
235 aa  221  8e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3744  phosphoribosyltransferase-like protein  59.35 
 
 
418 aa  218  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0623345 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1533  hypothetical protein  52.2 
 
 
217 aa  216  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0626  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  56.59 
 
 
232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.987714  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1897  putative phosphoribosyl transferase protein  52.13 
 
 
224 aa  207  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2468  phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
214 aa  207  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  54.15 
 
 
459 aa  206  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4970  phosphoribosyltransferase  52.11 
 
 
229 aa  202  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2186  erythromycin esterase  55.12 
 
 
682 aa  202  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231601  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7039  phosphoribosyltransferase  50.97 
 
 
235 aa  201  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4797  phosphoribosyltransferase  47.57 
 
 
224 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1158  phosphoribosyltransferase  53.17 
 
 
220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875928  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2892  phosphoribosyltransferase  53.11 
 
 
223 aa  199  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2322  Erythromycin esterase  56.19 
 
 
669 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1169  hypothetical protein  48.29 
 
 
216 aa  196  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1608  purine/pyrimidine phosphoribosyl transferase  47.83 
 
 
218 aa  194  9e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0854  phosphoribosyltransferase  46.86 
 
 
219 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1163  hypothetical protein  47.8 
 
 
216 aa  193  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0576  putative phosphoribosyl transferase  47.83 
 
 
218 aa  192  3e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2961  phosphoribosyltransferase  52.68 
 
 
229 aa  192  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000716325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2872  erythromycin esterase  59.9 
 
 
668 aa  191  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104564  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1923  phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 
225 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1949  phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 
225 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0965  phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 
208 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1971  hypothetical protein  55.61 
 
 
221 aa  186  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2465  phosphoribosyltransferase  51.22 
 
 
230 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171549  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5062  phosphoribosyltransferase  51.49 
 
 
210 aa  185  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1308  phosphoribosyltransferase  48.1 
 
 
241 aa  185  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1249  phosphoribosyltransferase  52.4 
 
 
217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0737102 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0796  phosphoribosyltransferase  51.94 
 
 
215 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1277  phosphoribosyltransferase  51.94 
 
 
215 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0115029  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4124  phosphoribosyltransferase  49.28 
 
 
220 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00388372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4550  phosphoribosyltransferase  50.97 
 
 
210 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3230  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  51.22 
 
 
230 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1078  phosphoribosyltransferase  49.04 
 
 
222 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.518737 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4714  phosphoribosyltransferase  50.94 
 
 
222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120595  decreased coverage  0.00895414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6485  phosphoribosyltransferase  50.49 
 
 
209 aa  178  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.408226  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1733  phosphoribosyltransferase  48.31 
 
 
221 aa  178  8e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494334  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1167  phosphoribosyltransferase  51.22 
 
 
222 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0975763  normal  0.0766272 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25740  Phosphoribosyl transferase protein  49.27 
 
 
228 aa  176  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4420  phosphoribosyltransferase  50.49 
 
 
214 aa  175  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289093  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4384  phosphoribosyltransferase  51.22 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.36871  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1155  phosphoribosyltransferase  50.73 
 
 
245 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1690  phosphoribosyl transferase domain protein  55.83 
 
 
220 aa  172  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2224  phosphoribosyltransferase  47.12 
 
 
211 aa  171  9e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3530  phosphoribosyltransferase  43.84 
 
 
223 aa  167  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  52.68 
 
 
477 aa  167  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0958  phosphoribosyltransferase  45.41 
 
 
242 aa  165  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2462  phosphoribosyltransferase  51.24 
 
 
439 aa  164  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00859189  normal  0.0374875 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2061  phosphoribosyltransferase  47.6 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0701589  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2650  phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 
215 aa  162  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3462  phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 
441 aa  160  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3766  phosphoribosyltransferase  53.17 
 
 
459 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4117  phosphoribosyltransferase  47.57 
 
 
238 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2613  phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 
229 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.342013  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0654  phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
232 aa  159  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2142  phosphoribosyl transferase domain protein  43.9 
 
 
214 aa  158  7e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1792  phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 
232 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00238592  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2509  phosphoribosyltransferase  42.93 
 
 
209 aa  156  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0258464 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0832  phosphoribosyltransferase  47.32 
 
 
437 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3315  phosphoribosyltransferase  37.32 
 
 
208 aa  154  8e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2042  phosphoribosyltransferase  52.2 
 
 
222 aa  154  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  48.31 
 
 
443 aa  154  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5385  phosphoribosyltransferase  43.06 
 
 
229 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  44.44 
 
 
885 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  44.44 
 
 
885 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3164  phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
207 aa  153  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.405407 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1746  hypothetical protein  46.86 
 
 
441 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0311019  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2806  phosphoribosyltransferase  46.6 
 
 
443 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181803  normal  0.157505 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1335  phosphoribosyltransferase  51.22 
 
 
446 aa  152  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0585  phosphoribosyltransferase  37.38 
 
 
208 aa  152  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.362477  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0394  phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 
207 aa  151  8e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.707933  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4553  phosphoribosyl transferase  43.41 
 
 
216 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59752  normal  0.0208576 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4420  phosphoribosyltransferase  43.41 
 
 
216 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_783  phosphoribosyltransferase-like protein  41.06 
 
 
223 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3615  hypothetical protein  44.76 
 
 
220 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3450  phosphoribosyltransferase  42.99 
 
 
226 aa  149  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0796  phosphoribosyltransferase  41.26 
 
 
223 aa  149  5e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2705  phosphoribosyltransferase  44.57 
 
 
232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136065  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1189  phosphoribosyltransferase  45.85 
 
 
234 aa  146  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.267888 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1580  hypothetical protein  41.95 
 
 
214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00205223  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15350  predicted phosphoribosyltransferase  46.38 
 
 
225 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.652419  normal  0.519761 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  42.51 
 
 
884 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3617  phosphoribosyltransferase  41.71 
 
 
210 aa  143  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00882  hypothetical protein  48.37 
 
 
224 aa  141  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0251075  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2809  phosphoribosyltransferase  45.54 
 
 
209 aa  141  7e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>